希金斯炭疽菌中碳水化合物酶类蛋白的理化性质分析

为深入了解希金斯炭疽菌中化合物酶类蛋白(CAZymes)的功能,以前期获得的238个CAZymes为研究对象,对其进行理化性质预测分析,结果表明,近2/3的蛋白理论等电点小于6,属于酸性蛋白,同时,通过随机数软件对上述蛋白进行10%抽样分析,明确了不同理论等电点类别的分泌蛋白所具有的分子质量、分子式、半衰期、不稳定性系数、脂肪族氨基酸指数、总平均亲水性等理化性质。     

全基因组预测里氏木霉QM6a的碳水化合物活性酶类蛋白

【目的】里氏木霉QM6a是一株产纤维素酶的重要工业菌株,明确该菌中碳水化合物活性酶类蛋白(CAZymes),为进一步开展其功能研究打下坚实的理论基础。【方法】基于前期所获得的356个分泌蛋白数据,利用CAT预测程序对其CAZymes进行分析。【结果】里氏木霉QM6a中含有201个CAZymes,可以分为主要类别、复合类别,主要类涉及93个GHs和52个CBMs以及15个AAs、14个CEs、5个PLs、4个GTs;复合类别则涉及15个GH/CBMs和1个AA/CBMs以及2个CE/CBMs。【结论】通过上述生物信息学分析方法有效地实现了里氏木霉碳水化合物活性酶蛋白的预测。     

植物病原丝状真菌中糖苷水解酶的研究进展

植物病原丝状真菌中的糖苷水解酶是碳水化合物活性酶中的一类,在植物病原真菌侵染植物的过程中通过分解其细胞壁中的碳水化合物组分从而实现真菌对植物免疫防卫反应的进一步操控。前期对植物病原丝状真菌中碳水化合物活性酶展开了综述性评价,近年来,随着生物技术和生物信息学、分子生物学等试验方法的发展,以及基因组学、代谢组学、蛋白质组学、转录组学等组学的不断发展,研究者对糖苷水解酶的研究不断深入和完善。旨在对糖苷水解酶进行综述性评价,重点关注其分类、功能及研究方法。在分类方面,主要涉及底物特异性、结构相似性、催化作用机制和水解位置。在功能方面,重点研究其在稻瘟病菌菌、禾谷炭疽病病菌和希金斯炭疽病病菌等病原丝状真菌侵染过程中的作用。此外,还探究了分离和鉴定、生物学特性及基因克隆和表达分析等方面的研究方法。研究的最终目标是深入分析上述研究成果,系统梳理糖苷水解酶在上述真菌中的功能,以期为今后解析病原丝状真菌中糖苷水解酶的功能提供重要理论支撑,并对今后学术界的研究重点、难点及热点进行展望,为未来开展糖苷水解酶功能解析、互作蛋白找寻及加工应用提供研究思路。     

高校学生信息素养现状及其评价标准研究进展

信息时代对高校学生的信息素养能力提出了更高要求,然而,目前高校学生信息素养层次不齐,对学生信息素养的评价指标体系尚未形成统一标准,较难实现学生信息素养能力的提高.从信息素养的内涵和外延为切入点,对高校学生信息素养所存在的问题以及国内外众多学者所开展的有关高校学生信息素养的评定标准、评定方法进行综述,以期为进一步提升中国高校学生信息素养提供策略.     

昆明市金殿公园植物重要病害调查与防治

昆明金殿公园作为重要的风景区,以其独特的历史底蕴和丰富的园林植物受到市民喜爱。对金殿公园植物病害分布和种类调查后发现,该地区植物病害中叶部病害严重地影响着植物的观赏价值和经济价值,针对有关病害提出防治建议。     

云南省油茶产业发展现状及对策研究

油茶产业作为云南省近年积极发展的产业,其在全国油茶生产中尚处于劣势位置,如何更好地破解油茶产业发展过程中的问题,更好地促进经济发展是摆在当前较为重要的问题之一。该研究基于《2009~2020年全国油茶产业发展规划》和云南省油茶产业发展历史数据,从云南省油茶产业的分布区域、产量情况对其发展现状进行评述,同时,通过比较其他省份油茶产业的发展情况,总结云南省油茶产业发展中亟需解决的问题,为实现云南省油茶产业快速、健康、有序发展提供对策建议。     

核桃炭疽病生物防治菌株YB-4-15的筛选和鉴定

核桃炭疽病给云南核桃产业的发展造成了严重的影响。为给核桃炭疽病生物防治制剂的开发提供理论支撑,以核桃炭疽病菌为指示菌,采用土壤稀释平板法及对峙培养法,对生防菌株进行了分离与筛选,结果表明:菌株YB-4-15、YB-8-11-1、YB-7-9-1对核桃炭疽病菌均有80%以上的抑菌活性,其中,抑菌作用最稳定、抑菌效果最佳的菌株为YB-4-15。然后对YB-4-15菌株进行了形态学鉴定和ITS分析,鉴定结果表明:YB-4-15菌株为钩状木霉菌。最后,对该木霉菌的生物学特性及次生代谢产物的性质进行了研究,结果表明:该菌最适温度为28℃,其菌丝生长对光照条件不敏感,适合在p H为4~8的PDA培养基上生长,其无菌滤液的热稳定性较差,仅在45℃及以下温度条件下才有较好的抑菌效果。     

植物与病原菌互作理论研究进展

植物病原菌与其寄主相互作用过程中,关于病原菌操控植物和植物又反抗病原菌侵染的作用机制,学术界存在多种模型和假说,从最早的Flor"基因对基因"假说到警戒假说,再从警戒假说到"诱饵"假说,再到目前学术界较为认同的Zigzag理论。对这些植物与病原菌互作理论进行了总结,着重介绍了"诱饵"假说和Zigzag理论。     

黄单胞菌Xanthomonas campestris pv. Raphani 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析

为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序(motif)的生物信息学分析,同时,对Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析。明确Xcr中存在3个Tss,分别命名为TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋结构,均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif,而就信号肽而言,仅TssC含有明显的信号肽序列。Xcr中的Tss与Xcc、Xca等黄单胞菌属病菌中的Tss具有较近的亲缘关系。     

枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类(CAZymes)的分布与进化分析

[目的]分析枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类的分布与进化情况,对枯草芽孢杆菌工业菌株的开发利用具有重要意义.[方法]利用CAT在线预测程序对前期获得的102个分泌蛋白序列进行CAZymes预测.[结果]明确枯草芽孢杆菌BEST195中CAZymes的数量为57个,分别为27个GH、21个CBM、2个CE、4个...