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利用25个禽流感病毒及相关流感病毒广东株HA基因序列,建立三、四核苷酸特征基因片段BLSOM神经网络分型方法,对各片段数量进行统计和归一化处理。设计程序由MATLAB函数模拟人脑思维自组织学习,当训练步数为100及以上各毒株能成功聚类。H1、H3、H5、H7和H9亚型主要毒株分别归为一类,其中H3N2和H7N9毒株HA基因聚类图谱高度相似,表明这些毒株起源相同;不同年代H5N1毒株差异较大;H1N1和H9N2各1个毒株聚为一类,表明这两种病毒自然重组变异,为高危毒株筛查和溯源提供参考。 相似文献
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猪圆环病毒2型荧光定量PCR检测方法的建立 总被引:2,自引:4,他引:2
通过条件优化,以定量的10倍系列稀释质粒pMD-ORF2(含PCV2-ORF2全基因)为标准品,进行荧光定量PCR扩增并制作标准曲线,建立了猪圆环病毒2型(PCV2)的荧光定量PCR检测方法。该方法检测灵敏度可达1.0×100拷贝/μL,线性范围为109~100,达10个数量级;对起始浓度为1.0×106、1.0×105、1.0×104拷贝/μL的标准品的最终实际测得值分别为1.000×106、0.935×105、0.987×104拷贝/μL,变异系数分别为2.527%、2.067%、2.092%。该方法的检测灵敏度与套式PCR(nPCR)相当,甚而高于常规PCR。 相似文献
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根据GenBank中猪Ⅱ型圆环病毒(PCV-2)基因序列,设计两对特异性引物.将PCV-2广东分离株(GD1株)用PK15细胞系培养,从细胞培养物中提取病毒总DNA并以之为模板,用PCR方法分段扩增病毒全基因组,分别克隆到pMD18-T载体,对阳性质粒进行序列测定.用DNAstar对序列进行拼接,得到PCV-2 GD1株基因组全序列,全长为1767个碱基,包涵2个开放阅读杠(ORF1和ORF2),分别编码与复制相关的Rep蛋白和结构蛋白Cap.通过BLAST对所测GD1株核苷核酸序列早国内外已登录GenBank中的PCV-2病毒核苷酸序更进行同源性比较,与PCV-2参考毒株的核苷酸同源性介于94.4%~99.7%之间,与德国株PCV-2(AF201897)的同源性最高,为99.7%;与猪I型圆环病毒(PCV-1)参考株(AY184287)的同源性仅为70%. 相似文献
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花期调亏灌溉对枇杷生长结果的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
为了研究枇杷花期调亏灌溉对坐果期生长势和成熟期果实产量的影响,提出最佳调亏灌溉制度,以大田14~15年生的早钟6号枇杷为材料,采用局部滴灌的方式,花期给予不同梯度灌水量和灌水周期进行调亏灌溉处理,以不灌水为对照,调查坐果期树体生长势和果实成熟期产量指标。结果显示:花期每隔15 d调亏灌溉1次,随着灌水量增加,坐果期枝条脱叶率呈显著递减趋势、叶片叶绿素相对含量呈显著递增趋势,果实成熟期枝条叶片存活率呈极显著递增趋势、皱缩果率呈极显著递减趋势、平均单果重量呈显著递增趋势,考虑节水因素,每次灌水45 kg/株时,枇杷坐果期枝条有较多的叶片、叶片有较高的叶绿素含量,果实成熟期皱缩果率低、单果大,是最佳调亏灌溉量;花期每次灌水45 kg/株,灌水周期越长或不灌水,坐果期叶片脱落率越高,灌水周期8 d,节水同时却能保持枇杷坐果枝条不脱叶,是最佳调亏灌溉周期。本研究认为,枇杷花期调亏灌溉,增强了坐果期枇杷生长势,增加了果实成熟期产量,最佳调亏灌溉制度是8 d灌水1次、每次灌水45 kg/株,可显著减少叶片脱落、增加单果重、减少皱缩果比例。 相似文献