猪Ⅱ型圆环病毒广东分离株的全基因组克隆及序列分析

根据GenBank中猪Ⅱ型圆环病毒(PCV-2)基因序列,设计两对特异性引物.将PCV-2广东分离株(GD1株)用PK15细胞系培养,从细胞培养物中提取病毒总DNA并以之为模板,用PCR方法分段扩增病毒全基因组,分别克隆到pMD18-T载体,对阳性质粒进行序列测定.用DNAstar对序列进行拼接,得到PCV-2 GD1株基因组全序列,全长为1767个碱基,包涵2个开放阅读杠(ORF1和ORF2),分别编码与复制相关的Rep蛋白和结构蛋白Cap.通过BLAST对所测GD1株核苷核酸序列早国内外已登录GenBank中的PCV-2病毒核苷酸序更进行同源性比较,与PCV-2参考毒株的核苷酸同源性介于94.4%～99.7%之间,与德国株PCV-2(AF201897)的同源性最高,为99.7%;与猪I型圆环病毒(PCV-1)参考株(AY184287)的同源性仅为70%.     

南亚热带李新品种‘麒麟三华李’

‘麒麟三华李’是从‘三华李’芽变中选育出来的李新品种。果实近圆形,平均单果质量48.2 g,果皮和果肉紫红色,果粉厚,含可溶性固形物13.0%,总糖8.27%,可滴定酸1.12%,维生素C 95.7 mg · kg-1,可食率97.4%。肉质松软,半离核,香味浓郁。丰产稳产,适应性强,适宜在南亚热带山区种植。     

禽流感病毒广东株HA 基因BLSOM神经网络分型方法的建立

利用25个禽流感病毒及相关流感病毒广东株HA基因序列,建立三、四核苷酸特征基因片段BLSOM神经网络分型方法,对各片段数量进行统计和归一化处理。设计程序由MATLAB函数模拟人脑思维自组织学习,当训练步数为100及以上各毒株能成功聚类。H1、H3、H5、H7和H9亚型主要毒株分别归为一类,其中H3N2和H7N9毒株HA基因聚类图谱高度相似,表明这些毒株起源相同;不同年代H5N1毒株差异较大;H1N1和H9N2各1个毒株聚为一类,表明这两种病毒自然重组变异,为高危毒株筛查和溯源提供参考。     

避雨栽培对广东寄接梨生长发育 及果实品质的影响

以棠梨为寄接砧,嫁接早熟砂梨品种粤引早脆梨花芽,比较避雨栽培和露地栽培条件下果实生长发育特性和果实品质的差异。结果表明,避雨栽培寄接梨果实生长发育期比露地栽培长10 d,成熟果实纵横径比露地栽培大,单果重量显著提高。避雨栽培果实果皮呈黄白色,色泽均匀鲜亮,果点小且不明显,锈斑少,果实外观得到明显改善;与露地栽培相比,避雨栽培果实可溶性固形物和可溶性总糖含量分别提高13.6%和11.9%,可滴定酸含量和果实硬度则分别降低13.3%和15.1%,表明避雨栽培条件下的寄接梨果实内在品质优于露地栽培,这为避雨栽培技术在广东寄接梨生产上的应用提供了重要依据。     

栗瘿蜂在中国板栗和日本栗上的危害率调查

对栗瘿蜂在中国板栗和日本栗上的危害进行调查,结果表明:栗瘿蜂在不同板栗品种之间危害率差异显著,其中枝条危害率最高的是河果1号(65%),中国板栗比日本栗受害严重,栗瘿蜂在树冠的南向、中下部以及内部危害严重。广东、湖北、贵州等板栗产区调查结果表明,在管理不善的果园,枝条危害率高达40%~80%。     

广西部分黄皮种质资源观察研究

对广西无核、园皮、鸡子皮、鸡心和甜皮等5个黄皮品种的观察研究结果表明,园皮、甜皮早熟,这是因为其果实生长期较其他品种短;5个品种一年抽4～5次梢,其中第1次和第4次梢抽发时间受天气影响程度较大,第2次梢均在4月抽发,第3次梢在采收后抽出,在高温多雨的秋冬季部分品种抽出第5次梢。在5个黄皮品种中,果实品质以甜皮最佳,其次是鸡子皮、无核,园皮、鸡心的品质较差。     

黄皮转录组密码子使用偏好性分析

为全面了解黄皮(Clausena lansium)表达基因的密码子使用特点,以转录组测序获得的12 696条编码蛋白基因序列为数据来源,利用CodonW 14.4软件对其密码子碱基组成以及有效密码子数(effective number of codon, ENC)、同义密码子相对使用频率(relative frequency of synonymous codon, RFSC)等密码子使用参数进行计算和统计,发现黄皮表达基因密码子的平均GC含量为0.448,同义密码子第3位核苷酸的平均GC含量(GC3S)为0.400。表达基因整体的ENC取值为56.5,其中绝大部分的ENC值大于35,说明黄皮表达基因密码子使用偏好性程度整体水平较低。通过高频密码子分析法确定了GCU、AGA、AAU、GAU、AUU、UUU、UCU、CAU、CUU、UUG和GUU 11个高频密码子。将黄皮的密码子使用频率与人、小鼠、果蝇、酵母、大肠杆菌5种模式生物以及拟南芥、水稻、葡萄、草莓4种不同类型植物进行比较,发现其与果蝇和大肠杆菌存在较大差异,而与拟南芥和葡萄基本一致。以上研究结果对黄皮基因合适表达系统的选择以及外源基因在黄皮中的高效表达具有重要指导意义。     

猪嗜淋巴细胞疱疹病毒2型GD27株gB基因生物信息学分析

试验采用PCR方法扩增出猪嗜淋巴细胞疱疹病毒2型（porcine lymphotropic herpesviruses 2,PLHV-2）gB基因全序列,并进行测序,使用生物信息学软件对gB蛋白进行生物信息学分析和预测。结果显示,gB蛋白由876个氨基酸组成,分子式为C₄₅₀₀H₆₉₇₅N₁₁₉₉O₁₃₅₁S₄₀,分子质量为100.77 ku,等电点为6.45,不稳定系数为38.58;二级结构预测以无规则卷曲为主要结构,1-39位氨基酸为信号肽,761-780位氨基酸为跨膜区结构,具有多种功能位点,存在多处天然非规则结构蛋白;三级结构显示有一个具有溶解作用的环状构象。综合多种方法分析预测结果表明,gB基因存在多个B细胞线性抗原表位,可作为PLHV-2疫苗的候选抗原。     

发光杆菌1029发酵培养基成分优化组合研究

采用SAS软件中的Plackett-Burman设计对影响发光杆菌1029发酵液抑菌效果的重要因素进行了筛选.选出MgCl2和(NH4)2SO4为影响实验的两个重要因素,并通过响应面分析法对发光杆菌1029号菌株的发酵培养基成分进行优化,采用优化培养基得到的发酵液对烟草青枯病菌的抑菌圈直径提高了0.58 mm.     

农用核苷酸对黄皮光合作用的影响

应用农用核苷酸处理黄皮叶片,试验结果表明:叶绿素a、b,c含量增加,叶绿素a/b值增加,农用核苷酸处理3周内净光合速率(photo)和叶片蒸腾速率(Trmmol)快速增加,然后快速下降.