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萝卜EST 资源的SSR 信息分析及EST-SSRs 标记开发 总被引:1,自引:0,他引:1
从NCBI 数据库下载了287 349 条萝卜EST 序列,经预处理后得到无冗余EST 序列58 105 条,全长38 622.476 kb。利用MISA 搜索SSR 位点,得到含有SSR 位点的EST 序列3 523 条,共3 718 个SSR,平均每10.39 kb 就出现1 个SSR。分析发现萝卜EST 序列中存在265 种重复基元类型,其中二、三、六核苷酸重复是主导的重复基元类型,二核苷酸中以比例高达91.34%的AG/CT 重复基元为主;三核苷酸中主导的重复基元类型是AAG/CTT,比例为35.86%;六核苷酸中,存在两种主要的重复基元,分别为AAGGAG/CCTCTT 和AAGAGG/CCTTCT,所占比例为12.78%。这些结果表明,萝卜EST-SSRs 出现频率较高,类型丰富,具有良好的多态性潜能和开发利用价值。使用primer3.0 批量设计,并以不同主导重复基元类型初步合成183 对EST-SSR 引物,以12 份典型萝卜种质、1 对亲本及其F1 的基因组DNA 为模板,对其有效性进行验证,筛选出有清晰扩增产物的引物159 对,其中具多态性引物64 对;在试验亲本及其F1 中表现多态性的引物30 对,共显性引物27 对。 相似文献
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中国黄瓜种质资源的来源及遗传多样性表现 总被引:2,自引:0,他引:2
本文对国家蔬菜种质资源中期库数据库信息系统中的1434份黄瓜资源的基本信息进行了分析,结果显示我国黄瓜资源主要分布在华北和华东地区,其次是东北地区,其它地区的分布相对均匀。 相似文献
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对国家蔬菜种质资源中期库中不同起始发芽率水平和不同保存年限的黄瓜种子进行了活力监测。结果表明,保存年限对种子发芽率、发芽势、发芽指数和活力指数4个指标影响均不显著。即在国家蔬菜种质资源中期库中保存15a内,黄瓜种子活力未呈现显著下降的趋势。但种子入库时的起始发芽率水平显著影响种子安全保存时间,起始发芽率越低,种子活力下降越显著。 相似文献
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萝卜种质芽期耐热性鉴定方法初探 总被引:2,自引:0,他引:2
以18份特征不同的萝卜种质为试材,在25、30、32、35、38℃5个温度条件下进行发芽试验,以发芽率和相对发芽率、发芽指数和相对发芽指数、活力指数和相对活力指数为指标进行萝卜种质芽期耐热性鉴定,并对适宜的胁迫温度和评价指标进行了筛选。结果表明,35℃可作为筛选萝卜芽期耐热种质的适宜胁迫温度,相对发芽率和相对发芽指数比发芽率和发芽指数更适宜作为耐热性的筛选指标,相对活力指数是适宜耐热性筛选的综合指标。 相似文献
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中农 2 0 0系列新品种属连续结瓜能力较强的极早熟、早熟或中早熟 ,雌性或强雌性品种 (品种特征特性见2 0 0 2年《中国蔬菜》增刊彩页第 4页和黑白 4 1页。) ,对栽培技术的要求较严格。加强肥水管理 ,进行适当的植株调整 ,促进营养生长 ,方能充分发挥这类品种的优势。1.该类品种熟性早 ,适当晚播并不影响早熟性 ,播种过早反而会影响早熟性的发挥。适宜栽培季节以北京为例 ,春大棚 3月上旬、春温室或日光温室 2月中下旬育苗。其他地区根据当地气候适当提早或推迟播期。2 .苗龄 2 5~ 2 8天 ,不能过长。苗期无需蹲苗 ,注意防寒保温。防止老僵… 相似文献
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