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萝卜EST 资源的SSR 信息分析及EST-SSRs 标记开发 总被引:1,自引:0,他引:1
从NCBI 数据库下载了287 349 条萝卜EST 序列,经预处理后得到无冗余EST 序列58 105 条,全长38 622.476 kb。利用MISA 搜索SSR 位点,得到含有SSR 位点的EST 序列3 523 条,共3 718 个SSR,平均每10.39 kb 就出现1 个SSR。分析发现萝卜EST 序列中存在265 种重复基元类型,其中二、三、六核苷酸重复是主导的重复基元类型,二核苷酸中以比例高达91.34%的AG/CT 重复基元为主;三核苷酸中主导的重复基元类型是AAG/CTT,比例为35.86%;六核苷酸中,存在两种主要的重复基元,分别为AAGGAG/CCTCTT 和AAGAGG/CCTTCT,所占比例为12.78%。这些结果表明,萝卜EST-SSRs 出现频率较高,类型丰富,具有良好的多态性潜能和开发利用价值。使用primer3.0 批量设计,并以不同主导重复基元类型初步合成183 对EST-SSR 引物,以12 份典型萝卜种质、1 对亲本及其F1 的基因组DNA 为模板,对其有效性进行验证,筛选出有清晰扩增产物的引物159 对,其中具多态性引物64 对;在试验亲本及其F1 中表现多态性的引物30 对,共显性引物27 对。 相似文献
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我国蔬菜种质资源工作70年回顾与展望 总被引:1,自引:0,他引:1
<正>种质资源又称遗传资源,是携带生物遗传信息的载体,具有实际或潜在的利用价值。蔬菜种质资源包括各种蔬菜的栽培种、野生种、野生和半野生近缘种,以及人工创造的品种、品系、遗传材料等的种子、组织、器官、细胞、染色体、DNA片段和基因等~([1-2])。蔬菜种质资源是生物多样性的重要组成部分,是蔬菜科学研究和蔬菜生产可持续发展的物质基础,是支撑农业科技原始创新和蔬菜 相似文献
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“十五”期间,在国家自然科学基金、国家“863”计划、国家科技攻关项目,以及各部委、省(市)基金项目的大力支持下,通过全国蔬菜科技工作者的协作攻关,我国蔬菜(薯类)在种质资源的收集、保存、创新和利用,新品种选育,病虫害防治,无公害生产等方面的研究取得重要进展。本刊从第8期开始连续报道相关内容。 相似文献
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“十五”期间,在国家自然科学基金、国家“863”计划、国家科技攻关项目,以及各部委、省(市)基金项目的大力支持下,通过全国蔬菜科技工作者的协作攻关,我国蔬菜(薯类)在种质资源的收集、保存、创新和利用,新品种选育,病虫害防治,无公害生产等方面的研究取得重要进展。本刊从第8期开始连续报道相关内容。 相似文献