蛋白质组学技术的发展及其在肉质研究中的应用

随着现代科学技术的飞速发展,现代生物学技术已经发展到后基因组时代,生命科学研究的重点也从结构基因组研究转移到后基因组时代——功能基因组的研究。蛋白质组学研究是功能基因组一个重要的组成部分,与之相关的技术也得到了迅速的发展,并且在多个领域都得到了相应的发展。综述了蛋白质组学相关技术的发展及其在肉质中应用的概况。     

内蒙古绒山羊不同毛被类型遗传参数估计及遗传进展研究

为研究内蒙古绒山羊不同毛被类型遗传,收集内蒙古白绒山羊种羊场1990—2014年间54 044只绒山羊毛长(自然长度)的重复数据记录,按照不同羊毛长度将绒山羊分为三个类型:短毛型(≤13cm,SSL)、中间型(13cm羊毛长度≤22cm,ISL)和长毛型(22cm,LSL)。对毛长进行基本统计分析,发现内蒙古绒山羊个体之间的羊毛长度存在很大的差异,毛长度在5~34cm之间,而且毛长的分布规律基本符合正态分布。采用WOMBAT软件的AIREML算法进行方差组分分析和遗传参数估计。结果表明短毛型、中间型和长毛型的遗传力分别是0.11、0.16和0.22,长毛型的遗传力高于短毛型和中间型,并且短毛型和中间型属于低遗传力,而长毛型属于中等遗传力。从遗传进展上看,三种类型的遗传趋势相一致,总体上呈上升趋势,并且三种类型毛长的平均育种值每年分别增加0.005 9、0.011 3和0.014 1cm。研究表明长毛型的遗传进展比中间型和短毛型的遗传进展快,所以选择长毛型的绒山羊可以加速毛长遗传进展,为与其相关的重要经济性状间接选择奠定理论基础。     

基于高通量转录组测序阿尔巴斯型绒山羊绒毛生长周期差异表达基因分析

为研究绒山羊绒毛生长周期内皮肤基因表达规律以及皮肤差异表达基因的挖掘,采用Illumina HiSeqTM2000高通量转录组测序平台RNA-Seq技术,对3只成年雌性阿尔巴斯型内蒙古绒山羊全年12个月的皮肤样本进行转录组测序,将无参考基因组de novo拼接组装的unigene运用Nr,GO,COG以及KEGG数据库进行比对注释,并进行差异基因在全年各月份间的变化规律分析。结果显示,测序获得的unigene数为105 854条,比对注释基因55 541个,其中共有51 078条转录本进行了GO注释,21 189条转录本在COG数据库分析得到注释,26 201条预测基因KEGG数据库比对成功。其中皮肤基因GO注释在生物学功能分类中,细胞过程、代谢过程、生物学调控、生物功能调控以及刺激应答方面注释到的转录本比例最大;在分子功能分类中,结合以及催化活性作用方面注释到的转录本比例最大;通过COG数据库的比对注释,看到皮肤表达基因的同源蛋白功能主要集中在基因转录、翻译后修饰、和信号传导机制方面,反而在同工酶转运和代谢、细胞动力、二级代谢生物合成、转运和催化以及核结构方面注释到的基因极少;皮肤转录组数据与KEGG数据库比对,得到皮肤相关转录本较为富集的几条通路分别为MAPK signaling pathway,Wnt signaling pathway,Notch signaling pathway,Hedgehog signaling pathway,TGF-βsignaling pathway,JAK-STAT signaling pathway以及Focal signaling pathway;通过绒山羊不同月份皮肤转录组测序数据进行差异基因分析,得出绒山羊全年皮肤生长周期中基因差异变化规律为绒山羊全年皮肤共有4次较为剧烈的基因差异变化,第1次发生在2月与3月之间,第2次发生在3月与4月之间,第3次发生在6月与7月之间,第4次发生在10月与11月之间,前2次出现的基因差异变化较后2次剧烈得多,说明绒山羊绒毛生长启动时基因变化剧烈,而绒毛生长到休止时的皮肤基因变化较为缓和,是一个基因缓慢变化的过程。     

内蒙古成年绒山羊皮肤基因表达的研究

构建了成年绒山羊次级毛囊兴盛期皮肤组织cDNA文库。在GenBank数据库注册非冗余ESTs 392条。序列号为CD051766～CD052157。共有319个已知功能基因。未分类的基因108个；基因和蛋白质表达类70个；代谢类43个；细胞结构类45个；细胞信号和传导类30个；细胞和机体防御的基因15个；参与细胞分裂的基因8个。发现了一些可能和绒毛生长有关的基因：TGFβbinding protein，EDRK enriched factor，growth factor receptor，G protein associated receptor，dermal papilla derived protein 2，homeobox gene otx2，kallikrein7，jagged-1，thrombos pondin-1 and p53 inducible protein。     

影响绒山羊早期生长性状的环境因素分析

大多数内蒙古绒山羊在草场较差，气候条件严酷的环境中以放牧的粗放式饲养管理为主，因而众多的环境因素或者环境因素间以互作的方式影响绒山羊有关性状的表现。因为绒山羊的早期生长发育的好坏直接会影响到其未来的生产性能。为此，此文详细分析了各环境因素对绒山羊早期生长性状的影响，以便在绒山羊育种和生产中合理考虑这些因素。     

内蒙古白绒山羊育种信息管理系统的研究与应用

内蒙古白绒山羊育种信息管理系统是为了对内蒙古白绒山羊育种资料进行管理和分析而开发设计的.系统由系统管理、数据输入、统计查询、育种分析、报表打印和帮助6大功能模块组成.可实现对羊场产羔记录、断乳记录、生产记录、鉴定记录和配种繁殖记录等信息的全面管理和维护;在育种方面还可以进行遗传参数和育种值的估计,能为羊场制定育种方案提供服务.     

中国6个山羊群体微卫星标记的遗传多样性分析

利用30个微卫星座位，对中国6个群体山羊（阿尔巴斯、二狼山、乌珠穆沁、阿拉善、辽宁绒山羊和陕南白山羊），共计240个个体的遗传多样性进行了分析。计算了各群体的等位基因频率，并以其为基础获得了各群体的平均杂合度（He）、平均多态信息含量（PIC）和平均有效等位基因数（Ne），分别为0．367～0．467、0．533～0．639、2．571～4．915。分析了群体内和群体间的遗传变异，并根据遗传距离，进行了NJ聚类，结果将6个山羊群体分为两大类。为进一步对山羊品种的保存和利用提供科学的依据。     

无籽西瓜新品种鄂西瓜12号的选育

以黑皮红瓤四倍体材料W4-48-3为母本,花皮红瓤二倍体材料W2-38-42-1为父本配制而成无籽西瓜一代杂种鄂西瓜12号。中熟,果实发育期35d(天)左右;果实圆形,果皮墨绿色,覆蜡粉,皮厚1.2cm左右;果肉红色,中心糖含量11%～12%,边糖含量7%～8%;单果质量5～7kg,每667m2产量2500kg左右,适宜湖北省及周边地区栽培。     

山羊肌肉生长抑制素（MSTN）基因HphⅠ酶切多态性分析

采用限制性内切核酸酶HphⅠ对山羊肌肉生长抑制素（MSTN）基因的379bp扩增产物进行了PCR—RFLP多态性分析，检测到3种基因型，其酶切位点分别由2种共显性基因控制；对该片段的纯舍型分别克隆、测序发现，BB型在第1661位由T→C。上述结果为首次试验证实山羊MSTN内含子2（379bp）区域存在多态性。