基于RNA-seq的木霉长链非编码RNA的生物信息学预测及其重寄生相关性分析

[目的]本研究旨在全基因组范围内识别木霉(Trichoderma guizhouense) NJAU 4742(NJAU 4742)的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA),探究lncRNA在重寄生过程中可能参与的调控作用。[方法]用链特异性RNA-seq技术,对重寄生过程中与病原菌互作接触前、后以及独立培养的木霉菌进行转录组测序;构建生物信息学流程,识别lncRNA并用RSEM和DESeq2软件分析lncRNA在重寄生过程中的表达情况;对lncRNA的靶标预测和表达情况进行分析,探索lncRNA在重寄生过程中可能参与的调控作用。[结果]在木霉NJAU 4742中识别了1 676个lncRNA,其中包含1 049个基因间型lncRNA,590个反义型lncRNA,32个正义型lncRNA以及5个内含子型lncRNA。与编码基因相比,lncRNA的外显子数量偏少,序列长度偏短,表达量偏低,在基因组上的跨度偏短。靶标预测结果显示:1 496个lncRNA能够靶向2 269个蛋白编码基因,其中1 492个lncRNA以顺式作用形式靶向2 262个编码基因,4个lncRNA以反式作用形式靶向7个编码基因。GO功能分类结果显示:代谢过程(metabolic process)、催化活性(catalytic activity)和细胞过程(cellular process)是lncRNA靶标分布数量较多的3个类别。KEGG通路分析结果显示:信号转导(signal transduction)、转运与分解代谢(transport and catabolism)和碳水化合物代谢(carbohydrate metabolism)是lncRNA靶标分布数量较多的3类通路。进一步分析发现:147个lncRNA靶向编码碳水化合物活性酶和蛋白酶的基因以及次生代谢物合成相关的基因,其中30个lncRNA在重寄生过程中表达水平发生显著变化,有10个lncRNA的表达和靶标基因显著相关。[结论]木霉在NJAU 4742中存在长链非编码RNA,部分成员参与对病原菌重寄生过程的调控。     

高产广适玉米新品种囤玉3318的选育及栽培技术

囤玉3318是河南省金囤种业有限公司于2010年用自选系J9078作母本、自选系J12Q008作父本杂交组配而成的玉米单交种,并于2018年通过山西省审定。该品种具有高产、稳产、抗病、广适、活秆成熟等特点。适宜在山西省南部复播区种植,适宜密度4 500～4 800株/亩。     

中国木薯产量波动及影响因素分析

利用剩余法将木薯生产波动与长期趋势相分离,对中国48年来木薯生产变化趋势进行分析,计算中国木薯产量及木薯产量短期波动系数。结果表明:我国木薯生产波动幅度较大,整体上属于短期波动和古典波动,生产易出现大起大落的状况。     

田间气象条件对梨小食心虫越冬代出土的影响及辽宁中部地区梨小食心虫发生规律研究

以辽宁省海城市代表性的南果梨园为研究对象,连续3年采用性诱剂诱捕梨小食心虫成虫,并结合当地气象数据,研究了田间气象条件对梨小食心虫越冬代出土的影响及其发生规律。结果表明:梨小食心虫(简称梨小)越冬代幼虫出土主要受温度的影响,气温在13℃时梨小食心虫越冬代幼虫开始出土,在不同年份温度差异不大的情况下,较高气温对梨小出土没有明显的加速作用;降雨对梨小出土的影响主要体现在对温度的调控上,即降雨量越多导致气温越低,进而减缓梨小出土。辽中地区梨小食心虫发生情况受春季气温影响,一年发生3~4代。     

太子参无公害高产栽培技术

一、太子参的生长特性太子参是越年生植物,宿根性草本植物。具有15℃以下低温发芽特性,属秋季栽种,冬季生根,春季先开花,后长苗。较适宜温和、凉爽、湿润的气候,生长于500—800米海拔之间的低山地带,怕高温和阳光暴晒,一般年平均温度在10—20℃最适宜太子参的生长,气温超过30℃,植株生长停滞。二、栽培技术1.品种。目前,本区太子参栽培品种主要有2个:①柘参1号。叶片卵形,全缘,无波状;雄蕊数2枚或10枚;种根芽白色;块根纺锤形,淡黄色,较大;适合在海拨600米以上砂质壤土或新开垦地种植。该品种中感     

恩施州马铃薯加工业现状与发展浅析

本文分析了恩施州马铃薯加工业发展的优势条件,包括自然地理条件、区位优势、良好的原料品质、较强的科技力量等。同时,揭示了目前尚存在的不足,包括原料供给不足、加工产品单一,企业管理不规范等;提出了从马铃薯淀粉、全粉及变性淀粉、休闲食品、马铃薯硒产品和色素产品食品添加剂加工等方面的发展建议和具体的配套措施,即强化马铃薯加工品种选育与相关技术研究,稳定加工专用薯基地建设,在政府加大政策支持力度的前提下,实施较大的马铃薯加工企业的培育、扶持和引进工程。     

平安新乡,以民生为向度

"平安建设只有起点,没有终点". 2009年5月18日,在"全国社会治安综合治理优秀市"表彰会上,河南省新乡市市委书记吴君凝练且厚重的肺腑之言,折射出了560万人民在构筑平安新乡的历程中,一直在尊崇的无止境精神.     

高职院校《森林环境》课程教学改革的探索与实践

根据林业技术专业需要,以培养学生的综合素质和专业实践技能为主线,从教学内容、教学方法与手段、实践教学和考核方法等方面进行了改革探索与实践,取得了较好的效果。     

高等农业院校动物科学本科专业创新型人才培养的探讨

高校作为人才培养的基地，能否培养出高质量的创新型人才，已成为人们讨论的热点。本文结合动物科学专业的自身特点，阐述了动物科学专业创新型人才的基本特征和基本素质，提出了动物科学专业创新型人才培养的对策，以期对提高动物科学专业人才培养质量有所帮助。     

大棚环境下8种紫花苜蓿品种比较试验

利用塑料大棚(简称大棚)种植饲草是一项新的生产技术。内蒙古农牧业科学院草原研究所在现有的生产技术水平上,进一步优化设计,在鄂尔多斯市鄂托克旗赛乌苏嘎查设施农业基地大棚内对8个苜蓿品种的生长速度、茎叶比、干鲜比及产草量等进行了比较。结果表明,保加利亚紫花苜蓿和乌审旗紫花苜蓿最适宜作为大棚苜蓿推广应用。