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蒙古马基因组拷贝数变异的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
拷贝数变异(copy number variation,CNV)在人类和动物基因组中普遍存在,是重要的遗传变异资源.本试验利用比较基因组杂交(comparative genomic hybridization,CGH)芯片对2匹蒙古马和1匹纯血马进行全基因组CNV检测,共检测到210个CNVs,长度6 109 bp至571.87 kb,平均值为37.81 kb,中值为14.45 kb.合并重叠的CNVs,共检测到70个CNV区域(CNV region,CNVR),大小从6 151 bp至573.59 kb,平均值和中值分别为38.93和14.45 kb,总长度为6.19 Mb.经CNV基因注释和功能分析发现,大部分基因与嗅觉受体活性、嗅觉感官知觉、化学刺激的感官知觉、识别和嗅觉传导等功能相关.对5个CNVRs进行qPCR检验,83.33%的qPCR结果与CGH芯片结果一致.通过对蒙古马基因组拷贝数变异的研究,证明CNV在马基因组中普遍存在,为揭示马基因组CNV与重要生物性状的关联性及品种改良奠定了基础. 相似文献
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通过对不同种植时间、不同种植基质的香根草Vetiveria zizanioides分株苗、组培苗根际丛枝菌根(AM菌)感染检测,探讨了香根草对AM菌的感染特性.结果表明,在消过毒的森林泥炭土中,组培苗种植12个月感染率只有20.0%,感染强度低;种植22个月只有53.3%,感染强度为中.分株苗种植在自然土壤中,3个月就有AM菌感染,其感染率为56.7%;种植22个月感染率达到最高峰,为80.0%,感染强度为中等;种植时间为33个月时,感染率不再增加,但感染强度进一步增高.说明香根草根际AM菌的感染率和感染强度可能与苗源无关,而与种植基质密切相关. 相似文献
93.
文昌鸡产蛋性能及蛋品质研究 总被引:2,自引:2,他引:2
本文就文昌鸡产蛋规律、种蛋品质进行研究.结果表明:文昌鸡开产后第7周前产蛋率快速上升,到开产后第7周或第8周,产蛋率到达最高峰,60%以上的产蛋率能维持15~18周,经过产蛋高峰期后,产蛋率缓慢下降,期间略有波动,说明文昌鸡的产蛋性能良好;文昌鸡55周龄蛋品质性状蛋重(EW)、蛋壳重(SW)、蛋壳厚度(ST)、蛋壳强度(SS)、哈氏单位(HU)、蛋形指数(SI)、蛋黄重(YW)、蛋黄颜色(YC)的测定结果平均值分别为49.00g、6.34 g、320.69μm、4.01 kg/cm2.70.02、1.31、16.45 g、6.13. 相似文献
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96.
97.
以鸡传染性法氏囊病毒VP2蛋白的基因组序列为基础,采用Garnier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schultz方法预测VP2蛋白质的二级结构;用Kyte-Doolittle方案预测蛋白质的亲水性;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性;用Jameson-Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数。综合分析,预测VP2蛋白的抗原表位。通过以上几种方法预测IBDV病毒VP2蛋白的B细胞表位位于VP2蛋白N端3-10、30-45、77-84、150-157、197-206、211-222、278-288、298-303、315-325、376-381、386-394、403-411、415-425区段。 相似文献
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99.
100.
Yu-Xiong Lai Bao-Lei Jin Yu Xu Li-jie Huang Run-Qing Huang Yong Zhang Jimmy Kwang Jian-Guo He Jun-Feng Xie 《Veterinary immunology and immunopathology》2014,157(1-2):87-96
Betanodaviruses are the causative agents of viral nervous necrosis (VNN), a serious disease of cultured marine fish worldwide. Virus-like particles (VLPs) are one of the good novel vaccine candidates to control this disease. Until now, betanodavirus vaccine studies mainly focused on the humoral immune response and mortality after virus challenge. However, little is known about the activation of genes responsible for cellular and innate immunity by vaccines. In the present study, VLPs of orange-spotted grouper nervous necrosis virus (OGNNV) were produced in prokaryotes and their ability to enter Asian sea bass cells was the same as native virus, suggesting that they possess a similar structure to OGNNV. VLPs immunogenicity was then determined by intramuscularly vaccinating Epinephelus coioides at different concentrations (1.5 or 15 μg g?1 fish body weight, FBW) and immunizing frequencies (administration once, twice and thrice). A single vaccination with the dosage of 1.5 μg g?1 FBW is enough to provoke high titer antibodies (average 3 fold higher than that of negative control) with strong neutralizing antibody titer as early as 1 week post immunization. Furthermore, quantitative PCR analysis revealed that eleven genes associated with humoral, cellular and innate immunities were up-regulated in the liver, spleen and head kidney at 12 h post immunization, correlating with the early antibody response. In conclusion, we demonstrated that VLP vaccination induced humoral immune responses and activated genes associated with cellular and innate immunity against betanodavirus infection in orange-spotted grouper. 相似文献