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为从基因组水平上探究香猪性成熟早、产仔数少、体型小的分子机理,本研究下载与香猪在繁殖和体型性状方面有明显差异的梅山猪、杜洛克猪的重测序数据作为参照,对26头香猪、24头梅山猪和24头杜洛克猪的重测序数据进行SNPs检测和等位基因频率差值分析,筛选香猪基因组外显子上与梅山猪、杜洛克猪高度分化的SNPs位点,并使用AS-PCR方法和Sanger测序方法统计其中8个SNPs位点的群体等位基因频率。最后,对含有高度分化SNPs位点的基因进行GO功能富集和KEGG通路分析。结果显示,SNPs检测获得香猪基因组外显子上SNPs共236 710个,包括193个终止密码子丢失、1 238个终止密码子获得、90 945个错义SNPs和144 334个同义SNPs。得到1 046个香猪高度分化SNPs,包括429个错义SNPs、2个终止子丢失、6个终止子获得和609个同义SNPs,影响524个蛋白质编码基因;并发现X染色体上44-58 Mb的一段富含高度分化SNPs的热点区域。群体等位基因频率验证结果与重测序结果一致,鉴定了8个位点均为香猪与梅山猪、杜洛克猪高度分化的SNPs。对524个含有高度分化SNPs的基因进行GO和KEGG分析,富集到卵母细胞减数分裂、雌激素信号途径等繁殖相关通路;GO功能注释到细胞内雌激素受体信号、纤毛运动等繁殖相关条目,骨骼系统形态发生、骨骼发育、成骨细胞分化等体型相关条目。得到含有香猪高度分化SNPs的18个繁殖性状候选基因PTGFR、TRO、DNAH17、PKDREJ、KAT8、DNAI2、VDR、TEX14、QSOX1、AR、WNK3、ADCY3、SPEF1、MIGA2、SLC2A8、PSMF1、TBC1D20、IFT172和7个体型相关基因IBSP、NR6A1、HSPG2、TARS、PDZD2、FGF4、AMER1,可能是决定香猪性成熟早、产仔数少、体型小的关键基因。 相似文献
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湖北省钟祥市南湖水生态环境评价 总被引:1,自引:0,他引:1
位于湖北省钟祥市城关郢中镇东的南湖,面积800hm^2,集观赏和水产养殖于一体。鱼产量为700t/a。该湖紧靠城市,直接纳人了未经任何处理的大量生活和工业污水,每天流量达40000t,造成水体严重富营养化,鱼类因栖息环境恶化而大量死亡,造成很大经济损失。鉴于此,笔者对南湖水生态环境进行了调查,旨在为南湖的综合治理提供科学依据。 相似文献
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对杭州市桐庐县茶园、果园和桑园土壤肥力的调查表明,该县园地土壤酸化明显、土壤有机质和全氮偏低、土壤有效钾不足;土壤有效磷高低相差较大,茶园、果园土壤磷素缺乏明显,桑园土壤有效磷平均较丰富,但仍有一定面积的土壤存在磷素不足。建议重视园地土壤酸化的防治,增加有机肥料的投入,增强配方施肥的推广力度。 相似文献
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苋菜、马唐出土对温度、水分的反应 总被引:2,自引:0,他引:2
本研究于1995~1997 年在中国农业大学杂草研究室完成。研究结果表明:马唐(Digitariasanguinalis)、苋菜(Am aranthusretroflexus)室内出土的温度极限点:最低温度5℃,最高40℃,适宜温度是30~35℃。5~50℃温度段内,在相邻温度间杂草出土率显著变化的段是20~25℃和35~40℃,出土最快的温度是40℃;这两种杂草出土的水分极限点是20% ,适宜水分是80% ,20% ~100% 含水量段内,在相邻的水分含量间杂草出土率显著变化段是40% ~60% ,出土最快的水分含量是100% 。温度和水分在对苋菜和马唐出土的作用中,二者之间存在一定程度的互补作用,温度对水分的互补作用尤为明显 相似文献
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