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明光小耳猪遗传多样性分析 总被引:2,自引:0,他引:2
为深入了解明光小耳猪群体遗传结构,使之得到更好的保护和利用,采用分布在家猪19对染色体上的76个微卫星标记对该猪种65个样品进行群体遗传变异分析.共检测到343个等位基因,每个座位的等位基因数从2到9不等,有效等位基因数在1.223 9~4.807 9之间,平均每个座位等位基因数为(4.513 2±1.205 5)个,有效等位基因数为(3.216 9±0.773 6)个,群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.944 2±0.159 5、0.668 5±0.094 5和0.610 3±0.108 3.结果表明,明光小耳猪群体遗传变异丰富. 相似文献
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单核苷酸多态性(SNPs)作为新的遗传标记已广泛应用于基因定位、克隆和遗传多样性的研究。在畜禽的遗传育种过程中,人们一直在致力于寻找些可靠的遗传标记(Genetic Marker)来提高选择效率与效能。而遗传标记的内涵随着遗传学,特别是基因概念的发展而发展。遗传标记已逐渐从形态、细胞扩展到生化和分子水平上的标记。 相似文献
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1近交系的命名 近交系是由全同胞兄妹或亲子连续20世代交配而育成的,其近交系数应达到或大于98.6%,且所有个体可以追溯到一对共同祖先。亲子配或全同胞配是近交的2种极端形式,也称“急骤近交”。 相似文献
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从猪血中提取高质量基因组DNA的研究 总被引:7,自引:0,他引:7
经研究改进 ,建立了一种从猪血中提取高纯度全基因组DNA的有效方法。经 2 %琼脂糖凝胶电泳检测 ,DNA带型整齐集中 ,无拖尾现象 ,证明DNA分子片段完整 ,没有降解。紫外分光光度计检测 ,DNA的OD2 60 /OD2 80 达 1.75± 0 .0 5 ,证明所提DNA质量较好 ,用于PCR扩增 ,可以得到满意的扩增效果 ,且避免了用苯酚等剧毒试剂 ,是一种理想的DNA提取法 相似文献
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为探讨猪雄激素受体(Androgen receptor,AR)基因的序列、结构、表达和功能,以版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)睾丸组织为材料,用RT-PCR技术获得猪AR基因cDNA序列,进行生物信息学分析,应用荧光定量技术明确其mRNA的多组织表达特征。结果表明:BMI AR基因cDNA长3 257bp(GenBank登录号:KU705631),包含2 688bp的全长编码区,位于猪X染色体,含有9个外显子和8个内含子;推导出的BMI AR蛋白含有1个核定位信号、1个DBD结构域和1个LBD结构域,无信号肽,无跨膜螺旋;与黄牛、山羊、人、猩猩、大鼠和小鼠的AR蛋白依次有94.2%、94.0%、90.2%、89.0%、88.1%和87.5%的同源性;其二级结构中以无规则卷曲和α螺旋为主,延伸链和β转角只在局部出现;在二级结构预测结果的基础上利用同源建模构建了其三级结构;AR基因mRNA在被检测的BMI 15个组织中呈现差异表达现象,表达量最高的组织为睾丸。该研究结果为进一步研究AR基因在BMI中的生理功能及调节机制提供了依据。 相似文献
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在版纳微型猪近交系(BMI)公猪精液冷冻保存稀释液中添加不同浓度甘油,并对不同解冻液配方和解冻方法进行研究,对比解冻后的精子活力、质膜完整率和顶体完整率,优化BMI公猪精液冷冻保存方法。结果表明,解冻后,甘油浓度为2%和3%组的精子活力、质膜完整率、顶体完整率显著高于1%、4%和5%组(P<0.05);Ⅰ号解冻液解冻后精子活力、质膜完整率、顶体完整率均显著高于Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ号解冻液(P<0.05);在活力、质膜完整率和顶体完整率方面,40℃ 6 s和50℃ 6 s这两种程序的解冻效果都显著优于38℃ 30 s(P<0.05)。由此可见,2%或3%的甘油作为抗冻保护剂、Ⅰ号解冻液解冻、40℃ 6 s或50℃ 6 s水浴解冻是较为理想的BMI公猪精液冷冻保存方法。 相似文献
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利用RT-PCR技术从版纳微型猪近交系睾丸组织中扩增出GSKIP全长编码序列并分析其分子特征,对GSKIP基因进行功能注释,分析其与非编码RNA(miRNA和lnRNA)间的调控关系,并构建ceRNA转录调控网络,进一步分析GSKIP蛋白的基本功能,构建多物种进化树和相互作用蛋白网络.通过RT-PCR获得了BMI GSKIP CDS区全长420 bp,该基因含4个外显子;基因功能分析表明,GSKIP主要参与Wnt信号通路;基因靶向作用分析表明,猪GSKIP受ssc-miR-181c、ssc-miR-181b、ssc-miR-181a、ssc-miR-335和miR-644-5p等5个miRNA的靶向调控;蛋白质结构分析表明,GSKIP包含1个DUF727结构域,α螺旋在二级结构中占比最高;多物种进化分析表明,BMI GSKIP氨基酸序列在哺乳动物中较为保守,与绵羊和牛的亲缘关系最为接近;蛋白互作网络分析表明,BMI GSKIP与10个蛋白存在相互作用. 相似文献