三个鸡品系的遗传差异与杂种优势关系的研究

采用RAPD标记分析了武定鸡快羽系、绿壳蛋系和合成系间的遗传差异,进行了三个鸡品系间的杂交试验,并应用简单的线性相关分析了遗传距离指数与杂种优势的关系。分析结果表明快羽系与绿壳蛋系间的遗传差异较小,而快羽系与合成系间的遗传差异较大。品系间遗传距离指数与F1代各性状观察值均为正相关,但相关不显著;与杂种优势率之间也均为正相关,但只与13周龄存活率、种蛋受精率有显著的相关关系。表明RAPD标记在预测杂种优势上具有一定参考价值。     

德宏水牛和摩拉水牛及杂交后代的遗传差异分析*

 为了解德宏水牛、摩拉水牛及二者杂交后代之间的遗传差异,本研究采用随机扩增多态性DNA标记技术,从70个随机引物中筛选出11个多态性丰富的引物对德宏水牛、摩拉水牛及二者杂交后代共80个个体进行了遗传变异检测,结果11条引物共产生89种扩增片段,多态片段73条,多态率82.02%。两亲本群体相对遗传距离为 0.220 3 ,杂交后代群体与德宏水牛、摩拉水牛群体的相对遗传距离分别为 0.101 7 和 0.135 3 ,表明杂交后代群体与两亲本群体间的遗传差异小于两亲本群体间的遗传差异,杂交后代群体与德宏水牛群体遗传关系更接近。     

版纳微型猪近交系AO血型A基因的克隆及生物信息学分析

【目的】扩增版纳微型猪近交系AO血型A基因编码区全长序列,并对序列进行生物信息学分析。【方法】提取版纳微型猪近交系猪组织的RNA,反转录成为cDNA,利用RT-PCR方法扩增AO血型A基因编码区全长序列,将纯化的片段与pMD18-T载体连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆并测定其序列,利用生物信息学方法分析其序列特征,并与其他12种物种构建系统进化树。【结果】版纳微型猪近交系AO血型A基因编码区全长1 095 bp,编码364个氨基酸,氨基酸序列与GenBank上登录的猪AO基因氨基酸序列相似性为99.5%。【结论】版纳微型猪近交系的AO血型A基因除了与黑猩猩、人和小鼠亲缘关系较远外,与牦牛、藏羚羊、水牛、小须鲸、绵羊、羊驼、野骆驼、山羊的关系都较为接近,其中与山羊的亲缘关系最为接近。     

猪类无精症缺失基因DAZL的cDNA全长克隆、组织表达和亚细胞定位

旨在获得猪类无精症缺失基因DAZL cDNA全长序列,阐明该基因的序列、mRNA组织表达模式、蛋白质结构特征及亚细胞定位情况.本研究以版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)10月龄成年公猪为研究对象,屠宰收集组织样,利用RACE和RT-PCR技术获得DAZL基因cDNA全长序列...     

中国水牛的遗传多样性与起源分化

中国水牛资源丰富,主体上为沼泽型水牛,主要分布于我国的热带和亚热带地区其在我国南方地区的农业生产中发挥着重要作用.与其他家养动物相比,中国水牛的遗学研究起步较晚.已有的研究结果表明,中国沼泽型水牛的染色体数为2n=48,其与河流传型水牛的杂种后代群体存在染色体数的多态性;早期的血液蛋白与同工酶座位的遗传检测显示,中国水牛各地方类群间遗传差异小,遗传关系较近;而近年微卫星 DNA 标记和 mtDNA标记检测结果显示,其群体遗传多样性较为丰富,且存在一定的遗传分化.考古发现及近年的分子遗传学研究揭示沼泽型和河流型水牛是在不同的地点独立驯化而来,中国可能是沼泽型水牛最初驯化之地.     

版纳微型猪近交系精子发生相关基因PHF7的分子特征及转录调控研究

[目的]获得版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)精子发生相关基因PHF7的分子特征,构建其转录调控网络.[方法]通过RNA-seq技术对BMI睾丸进行全转录组测序;利用RT-PCR技术从BMI睾丸分离PHF7全长编码序列并分析其分子特征和蛋白功能;进一步基于睾丸全转录组测序数...     

微卫星PAGE银染法及其干胶的简易制备

为了使微卫星PCR扩增的DNA片段能得到较好的分离和长期保存实验胶片 ,研究利用 1 5对猪的微卫星引物 ,经PCR扩增 ,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,银染法显色 ,然后制成了干胶。结果表明 ,聚丙烯酰胺凝胶具有很好的分离微小差异DNA片段的能力 ,而且银染后制成的干胶可长期保存。此法尤其适用于不具备凝胶成像系统和干胶机的实验室使用。     

版纳微型猪近交系VEGF基因克隆及其组织中转录水平的检测

为克隆版纳微型猪近交系血管内皮生长因子(VEGF)基因并检测该基因在各组织中的转录水平,本研究提取版纳微型猪近交系18种组织RNA,利用RT-PCR方法扩增VEGF基因编码区全长序列,进行克隆测序。利用VEGF基因序列的推导氨基酸序列与牛等8个物种的VEGF氨基酸序列构建物种系统进化树,同时采用半定量RT-PCR方法分析VEGF基因在版纳微型猪近交系18种组织中的转录水平。结果显示,版纳微型猪近交系VEGF基因编码区全长573 bp,编码190个氨基酸。氨基酸序列同源性分析表明,与牛等8个物种具有90%以上的相似性,分子系统进化表明其序列与人的关系最近,其次为牛、羊和兔。多组织半定量RT-PCR研究表明VEGF mRNA在版纳微型猪近交系的18个组织中均有转录水平的表达,其中在卵巢、脾脏、心脏、肺脏及皮肤中表达量较高,其他组织中表达量略低。     

5个鸭群体遗传关系的微卫星标记分析*

 选用12个微卫星标记对5个鸭群体（金陵黑鸭、樱桃谷鸭、乌嘴鸭、莆田黑鸭和三穗鸭）的进行了了群体内杂合度、多态信息含量和群体间遗传距离进行检测和分析。结果表明，12个微卫星标记只有7个在5个群体中检测到多态性，5个群体的平均杂合度在0.530 8~0.634 7之间，其中金陵黑鸭的平均杂合度最高，乌嘴鸭的最低。基于Nei氏标准遗传距离构建的系统发生树结果表明，樱桃谷鸭独聚为一大类，金陵黑鸭与乌嘴鸭聚集为一类，莆田黑鸭和三穗鸭聚集为一类。上述5个群体7个微卫星座位的检测和分析结果为这些鸭群体的资源利用提供了参考依据。     

猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究

旨在分离猪PYGO2编码区序列，获悉该基因mRNA组织表达模式、蛋白质结构特征、细胞中的分布和定位，并构建蛋白相互作用网络。本研究首先利用RT-PCR从成年版纳微型猪近交系（BMI）睾丸组织中克隆PYGO2编码区序列；利用生物信息学解析其基因结构并对蛋白质进行多种功能分析，比较多个哺乳动物PYGO2的氨基酸序列同源性，构建系统进化树和蛋白质相互作用网络；然后利用qPCR技术检测PYGO2在15个组织中的mRNA表达情况；最后通过构建pEGFP-C1-PYGO2融合表达载体，转染猪睾丸细胞（ST），确定PYGO2的亚细胞定位。结果表明，PYGO2基因CDS长1 221 bp，编码406个氨基酸（基因和氨基酸号分别为KY644518和AVB77243.1），定位在猪4号染色体；PYGO2蛋白二级结构以无规则卷曲为主，N端和C端均疏水；氨基酸序列同源比对分析表明，猪PYGO2与其他哺乳动物的相似度均大于97%，在进化上高度保守；蛋白互作网络分析显示，猪PYGO2与9个蛋白可能存在相互作用，其中与BCL9蛋白作用最为紧密；qPCR表达分析表明，猪PYGO2在被检的15个组织中均有不同程度表达，在生殖腺中表达相对较高；ST细胞中的亚细胞定位结果表明，PYGO2 mRNA主要分布在细胞核。本研究获得了PYGO2基因的编码序列，蛋白质结构和定位，蛋白质相互作用网络，mRNA多组织表达特征，可为进一步解析该基因在猪精子生成中的分子机制提供参考。