新疆地区绵羊品种TMEM154基因第2外显子G103A位点的多态性分析

绵羊跨膜蛋白154基因(Transmembrane protein 154,TMEM154)多态性与进行性肺炎的易感或抗性有关。本研究以绵羊TEME154基因第2外显子G103A(E35/K35)位点SNP为候选分子标记,利用PCR直接测序法检测TEME154基因型,对该基因在新疆地区8个绵羊品种(阿勒泰羊、哈萨克羊、巴音布鲁克羊、多浪羊、策勒黑羊、巴什拜羊、德国美利奴羊和中国美利奴羊)的遗传多态性进行分析。结果表明:绵羊TMEM154基因在第2外显子103bp处发生了G-A突变,PCR测序共检测到3种基因型;即AA、AG和GG,G103A位点的GG(E35)基因型与绵羊进行性肺炎的高敏感性相关,在阿勒泰羊、哈萨克羊、巴音布鲁克羊、多浪羊、策勒黑羊和巴什拜羊群体中属于优势基因型,而在中国美利奴羊和德国美利奴羊群体中比例较低。方差分析表明,该位点的基因型频率在阿勒泰羊、哈萨克羊、巴音布鲁克羊、多浪羊、策勒黑羊和巴什拜羊等进行性肺炎高敏感群体和中国美利奴羊和德国美利奴羊等低敏感群体间存在显著差异(P0.05)。本研究结果提示,绵羊TMEM154基因第2外显子G103A位点多态性在进行性肺炎高敏感与低敏感的绵羊群体中分布存在较大差异,该SNP可作为一个理想的分子标记应用于绵羊的抗病育种。     

新疆褐牛和中国荷斯坦牛POU1F1基因第六外显子多态性与产奶量的关联分析

以新疆褐牛和中国荷斯坦牛为研究对象.应用PCR-RFLP方法对POU1F1基因第6外显子的多态性及其与产奶量的相关性进行了分析.结果表明,新疆褐牛和中国荷斯坦牛的群体在该位点分别有2种等位基因(A/B),频率分别为0.43/0.57和0.33/0.67.B等位基因是优势等位基因.在新疆褐牛群体中,BB型个体的产奶量显著高于AA型(P<0.05).     

绵羊EDAR基因的克隆、序列分析及其在毛囊发育过程中的表达

旨在获得中国美利奴羊EDAR(ectodysplasin A receptor)基因的CDS区全序列并进行生物信息学分析,同时分析EDAR在绵羊毛囊发育过程中的表达特性,为深入研究该基因在绵羊毛囊生长发育过程中的作用及其表达调控提供基础资料。采用PCR扩增获得绵羊EDAR基因全长编码区,并克隆到PCRTM-BluntⅡ-TOPO@vector进行测序;利用生物信息学方法预测蛋白结构;应用qRT-PCR技术检测EDAR基因在绵羊毛囊发育过程中的表达特征。结果表明,绵羊EDAR基因的CDS序列长度为1 350bp(GenBank登录号:KX900497),编码449个氨基酸,该氨基酸序列与其他物种相比一致性较高;进化树分析表明,绵羊EDAR氨基酸序列与牛的进化关系较近,与斑马鱼较远;预测结果显示绵羊EDAR蛋白存在一个信号肽和一个跨膜结构域;qRT-PCR分析表明,EDAR基因在绵羊胎儿毛囊发育过程中均有表达,在毛囊发育第55天和第135天表达较高,第75天表达最低。获得绵羊EDAR基因完整的编码区序列和毛囊发育过程中的表达特性,生物信息学分析发现EDAR基因的编码区序列具有物种间的保守性,同时该基因在绵羊毛囊不同发育阶段的皮肤组织中表达,由此表明EDAR基因可能在绵羊毛囊的生长发育过程中发挥重要作用。     

超细型细毛羊基因组DNA的AFLP检测研究

利用AFLP标记对超细型细毛羊品系纯度进行检测,旨在为评价该品系细毛羊的遗传特性,采用TaqⅠ和EcoRⅠ双酶切,利用6对引物对24只细毛羊基因组DNA进行分析,共获得226个AFLP标记,1对引物获得的标记数在29~50之间,新吉超细型细毛羊相似系数AFLP研究结果为0.914~0.982,本研究为评价新吉超细型细毛羊遗传稳定系数提供了相关的参数。     

用PCR-DGGE和16S rDNA测序解析吐温对绵羊瘤胃细菌多样性的影响

选取装置永久性瘤胃瘘管的中国美利奴绵羊,采用5×5拉丁方试验设计,在绵羊日粮中分别添加5或10 g/d Tween 20,3或6 g/d Tween 80,以空白为对照,采用PCR-DGGE技术研究不同水平的非离子表面活性剂Tween 20和Tween 80对绵羊瘤胃中细菌多样性的影响;对DGGE指纹图谱中的12个优势DNA条带的16S rDNA进行测序和序列分析,在线寻找其相似的细菌分类。结果显示,5个组之间DGGE指纹图谱的相似性在65.4%～75.4%。与对照组相比,除10 g/d吐温20组外,其他各组的细菌丰度均有不同程度的下降。DNA序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA序列中有8个条带序列与GenBank中已知序列的相似性大于97%。受吐温20影响的细菌与Microbacteriumoxydans、Schlegelella aquatica、Brevundi monas sp.、Lachnospir-aceae和Methylobacillus sp.有较高的相似性;而受吐温80影响的细菌与Schlegelella aquatica、Acinetobacter soli和Microbacteriumoxydans有较高的相似性。日粮中添加吐温20和吐温80后,高剂量的吐温20使绵羊瘤胃中的优势菌种类增加,吐温80和低剂量的吐温20使优势菌种类下降。在绵羊瘤胃细菌中,受吐温20和吐温80影响的种类不同。     

新疆绵羊SNP数据库系统的设计与实现

在当前生物信息学的研究过程中,通过对生物SNP数据的研究,可以了解生物的进化和发展过程,并找到影响其生长的基因。本文基于新疆绵羊SNP数据进行研究与设计,依据绵羊SNP数据的特性和系统要求,实现了新疆绵羊SNP数据库系统,为研究绵羊的科学工作提供了平台。     

特克塞尔与哈萨克羊杂交F2代胴体性状的多元分析

实验旨在研究特克塞尔×哈萨克羊杂交F2代的尾部脂肪大小对胴体性状的影响。选用体况良好的520只8月龄羔羊,运用SPSS与R语言对羔羊的表型数据进行主成分与聚类分析,研究尾部脂肪的分化情况,并对杂交F2代各类型尾脂羊屠宰前体重、胴体重、断奶重及脂肪沉积性状进行差异比较分析。结果发现,主成分分析中41个表型值提取到9个主成分,累计贡献率达到87.694%,屠宰前体重、胴体重、断奶重与5个脂肪表型性状的特征值较高;聚类分析结果可将杂交F2代分为A型、B型、C型和D型4个类型;D型的屠宰前体重、断奶重与A型屠宰前体重、断奶重差异不显著,C型背膘厚极显著高于A型,B型的屠宰前体重、胴体重、断奶重极显著高于A型、C型和D型。B型、C型和D型间背膘厚差异不显著。综上,杂交F2代的尾部脂肪发生性状分离,屠宰前体重随着尾部脂肪的增加而下降,结合特克塞尔与哈萨克羊的体型外貌特征,C型和D型更趋近于哈萨克羊,B型则更趋近于特克塞尔羊。     

多山梨醇酯对玉米秸秆体外发酵活力的影响

采用体外培养技术研究添加0.2%的多山梨醇酯20、40、60和80对玉米秸秆体外发酵活力的影响.结果表明:多山梨醇酯60和多山梨醇酯80能够显著提高玉米秸秆体外发酵24h的累积产气量.与对照组相比,多山梨醇酯60组和多山梨醇酯80组24h累积产气量分别提高5.68%(P＜0.05)和9.02%(P＜0.05).添加多山梨醇酯对玉米秸秆的发酵模式没有显著影响,但添加多山梨醇酯60和多山梨醇酯80可增强玉米秸秆在体外的发酵强度.除多山梨醇酯20外,添加其它多山梨醇酯使玉米秸秆干物质降解率较对照组提高5.2～8.1%(P＜0.05),有机物降解率有提高的趋势.在发酵24h结束时,添加多山梨醇酯40、60和80均使氨态氮浓度下降,还原糖和MCP升高,对pH和总挥发性脂肪酸无影响.其中,多山梨醇酯60和多山梨醇酯80组还原糖浓度分别比对照组提高7.54%(P＜0.05)和7.26%(P＜0.05).多山梨醇酯80组MCP较对照组提高15.93%(P=0.061).在体外培养条件下,多山梨醇酯60和80可促进玉米秸秆的降解.这说明,多山梨醇酯60和多山梨醇酯80可作为一种新型的反刍动物瘤胃发酵调控剂.     

用半定量RT-PCR法检测BⅢB4基因在绵羊皮肤组织中的mRNA表达

利用半定量逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,测定新吉细毛羊皮肤组织中 BⅢB4基因mRNA表达水平,以18SrRNA为内标,分析相对表达量及其与羊毛细度的关系.通过探讨和优化PCR体系中退火温度、MgCl2浓度和循环次数等参数,建立了检测羊毛细度相关基因mRNA表达的半定量RT-PCR体系.用Independent Samples T Test分析BⅢB4 PCR产物与18SrRNA PCR产物电泳后的灰度比值,可知BⅢB4基因mRNA表达量对羊毛细度的影响.     

哈萨克羊与特克赛尔羊不同杂交组合后代羔羊早期生长性能的比较

【目的】比较不同血统比例特克赛尔羊与哈萨克羊杂交组合后代羔羊的早期生长发育规律,筛选早期生长快、增重显著的杂交组合,为培育哈萨克羊肉用新类型提供理论依据。【方法】测量4个不同杂交组合(即特克赛尔羊×F₁、F₂×F₁、F₂×哈萨克羊、F₁×F₂),共计1 193只单胎型羔羊出生至180日龄期间不同生长阶段的体重,比较4个不同杂交组合的累积生长、绝对生长、相对生长等生长性状,并利用Logistic、Gompertz、Von Bertalanffy非线性拟合模型拟合与分析体重数据生长曲线,筛选出早期生长性能最佳的杂交组合。【结果】羔羊从出生至180日龄生长过程中,F₂×F₁杂交组合羔羊生长速度快,生长强度大,增重较显著,拐点体重较高的同时也能最快到达拐点体重。其次是特克赛尔×F₁、F₂×哈萨克羊杂交组合羔羊。F₁×F₂杂交羔羊生长发...