家蚕感染二分浓核病毒(镇江株)的数字基因表达谱分析

【目的】筛选家蚕与二分浓核病毒(Bombyx mori bidensovirus Zhenjiang strain,Bm BDV-ZJ)感染相关的差异表达基因,鉴定家蚕与病毒感染有关的调控基因,为进一步阐明家蚕抗Bm BDV-ZJ的分子机制提供理论依据。【方法】采用Illumina高通量测序技术,构建家蚕品种JS口服感染Bm BDV-ZJ的数字基因表达谱,为排除个体间差异,以10头蚕作为一个样本用于DGE检测。样本中基因的差异表达检测通过严格的运算法则进行,对差异检验的P值(P value)作多重假设检验校正,通过控制FDR(false discovery rate)来决定P值的域值。本研究中,差异表达基因定义为FDR≤0.001且差异倍数在2倍及以上(|log2ratio|≥1)的基因。采用基因本体论(GO)分类体系确定所有差异表达基因可能的功能。用GO计算P值和bonferoni校正。选用校正P值≤0.05作为基因组显著富集的阈值。WEGO软件用来视化、比较和绘制GO注释结果。利用KEGG数据库进行通路富集分析,进一步确定显著富集代谢途径或信号传导途径,Q值≤0.05的通路指定为DGEs中的显著富集通路。通过q RT-PCR方法对部分差异表达基因进行验证。【结果】感染组和对照组分别得到4 850 663和4 875 307个原始标签,去除低质量标签后,分别得到4 757 934和4 788 406个清洁标签,对应的标签种类数量分别为62 436和63 680种。两个文库间的清洁标签和清洁标签种类的数量在不同拷贝区间分布类似,感染组和对照组样本的测序量分别为3.5 M和3.7 M,测序深度符合试验的要求,两样本的DGE数据是可信的。将这两个DGE数据库的所有清洁标签与家蚕参考基因库进行比对,在对照组与感染组中,分别有36.39%和45.30%的清洁标签可以比对到基因。另有50.02%和43.34%的清洁标签可以比对到家蚕参考基因组,剩余的未知标签分别占清洁标签总数的13.59%和12.35%。共发现了447个差异表达基因,其中306个上调表达,141个下调表达。分别有218、147和179个差异表达基因涉及GO 3个本体中的分子功能、细胞组分和生物过程。利用KEGG公共数据库进行Pathway显著性富集分析,注释到的基因总数为8 473个。447个差异表达基因经鉴定后,其中的330个基因被归类到151个KEGG路径中。差异表达基因显著富集的Pathway(Q值≤0.05)有19个,其中最显著富集的是细胞质中DNA识别通路。挑选了24个差异表达基因进行q RT-PCR验证,其中20个基因的差异表达趋势与DGE的结果一致。其中在DNA识别通路中共检测到9个差异表达基因,BGIBMGA009408-TA、BGIBMGA004913-TA、BGIBMGA011753-TA均为编码RNA聚合酶III的基因,表达量均上调,是对照组的4.3、2.3、3.4倍。【结论】构建了3龄家蚕JS感染Bm BDV-ZJ后28 h感染组及对照组幼虫的数字基因表达谱,Pathway显著性富集分析和q RT-PCR验证显示,家蚕感染Bm BDV-ZJ后可能通过启动胞质内DNA识别通路来感应入侵病毒的异源DNA成分并迅速启动天然免疫抵御Bm BDV-ZJ病毒感染,为研究Bm BDV-ZJ侵染家蚕和家蚕抵御Bm BDV感染的分子机制打下了基础。     

酵母发酵虎杖提取白藜芦醇技术初步研究

对酵母发酵虎杖(Polygonum cuspidatum)提取白藜芦醇的原料预处理方式、发酵工艺及提取方法等进行初步研究。结果表明,酵母固态厌氧发酵能有效地提高虎杖白藜芦醇的提取得率,适量添加纤维素酶和木聚糖酶能在一定程度上提高虎杖白藜芦醇得率。较佳的虎杖生物发酵提取白藜芦醇的工艺条件为:虎杖原料粉碎过10目筛,发酵体系含水的质量分数为65%,添加糖化酶Ⅱ和SADY酵母的量分别占虎杖原料质量的0.18%和0.34%,厌氧发酵5 d,发酵后采用体积分数为95%的乙醇水溶液提取。     

多菌种混合发酵对菜籽饼脱毒的研究

[目的]选择对菜籽饼脱毒效果最佳的菌株。[方法]以酵母菌、枯草芽孢杆菌、黑曲霉和乳酸菌为供试菌株,分别对菜籽饼进行单菌株和混菌株发酵脱毒试验,测定脱毒效果。[结果]混菌株发酵的脱毒效果明显优于单菌株发酵,混菌株发酵中3菌株脱毒效果又优于双菌株发酵。乳酸菌、黑曲霉和酵母菌3种菌株的组合,对菜籽饼硫甙的脱除率达75．2％,对植酸、单宁的去除率分别达58．9％和66．7％。[结论]该研究为菜籽饼的综合利用奠定了基础。     

光照强度对农用AGV导航线提取影响的研究

[目的]改善农用AGV导航线提取的精度。[方法]对同一对象在41 000-90 000 lx下采集的19幅图像进行图像分割试验。[结果]在1 080×1920的图像中,每幅图像与其他图像提取导航线的最大误差为50个像素点左右。[结论]光照强度误差是现有大多数算法可以接受的,光照强度带来的导航线提取差异将促进农用AGV视觉导航技术的发展。     

花生生育早期耐涝性室内鉴定对大田期的意义

为探索花生不同品种生育早期耐涝性差异及与大田耐涝性的关系,对8个品种的种子进行室内180 h浅、深水处理,对幼苗进行10 d淹涝和大田短（10 d）、长期（88 d）湿涝,测定发芽能力、幼苗生长发育和乙醇脱氢酶（ADH）活性、大田湿涝产量（WY10、WY88）和产量耐性系数（WTC10、WTC88）。结果表明,(1)花生对淹涝较敏感,其耐涝性因淹涝时期、程度（水深）和品种而异。浅涝时种子先露尖而后发芽;深涝时只露尖而不能形成幼芽。不同品种发芽期耐涝性差异较大。幼苗的根部受害程度远甚于地上部,根色、根重是不同品种耐性差异的主要表征指标。(2)花生幼苗根系ADH活性受淹涝即厌氧诱导的效应极为明显,其中淹涝3~10 d的ADH活性与耐涝性负相关,尤其是淹涝10 d后ADH活性高的品种,植株发育不良。(3)与大田所有产量耐涝性指标的相关性,ADH活性、根色均为负相关,单株根重、单株地上部重、单株总重则为正相关,尤其是根重与WY10 2年均呈显著正相关。(4)耐涝性鉴定时间,在发芽期浅、深水中分别以180、120 h为宜,幼苗期以3~10 d为宜。因此,花生生育早期耐涝性室内鉴定对大田期有重要参考价值。     

金秀老山自然保护区野生植物的种类及特点

广西金秀老山自然保护区有维管植物196科711属1 497种,其中蕨类植物29科52属94种,裸子植物6科7属12种,被子植物161科652属1 391种。这些植物中有国家重点保护植物10种、药用植物616种、材用植物180种、观赏植物70种、野生可食植物100种、纤维植物95种、淀粉植物64种、油脂植物99种、芳香植物87种、鞣料植物94种、染料植物13种、饲料植物40种、其他资源植物60种。并在其资源特点进行分类的基础上,提出植物资源保护与可持续利用的建议。     

药物防治剑麻“红蜘蛛”效果初报

多年来剑麻一直受到“红蜘蛛”为害。受害的麻片叶面叶背出现大小不一的斑点,类似柑橙溃疡病,严重影响剑麻生长和纤维质量。但在麻片上却很难找到红蜘蛛虫体,针对这个问题,进行了杀菌药物防治,旨在指导剑麻大田生产。1药剂品种与施药方法地点在广西农垦国有龙北农场,品种为龙舌兰麻H.11648。77%可杀得粉剂1000倍液,(15mg兑水15kg);75%克螨特乳油1000倍液,(15ml兑水15kg);50%多菌灵粉剂500倍液,(30mg兑水15kg);对照区,不喷药。共4个处理区,3个重复(3个区组),共有12个处理小区,每个小区面积为292.5m2,有剑麻130株。按各处理设计药物浓度,于20…     

白头叶猴栖息地植被特征

经样地调查统计表明,广西崇左生态公园、北京大学生物多样性研究基地白头叶猴栖息地的植被是由热带科属的、具草质（纸质）叶的、中小型的、全缘叶的高位芽植物为主体组成的,原生植被为热带季雨林。但现存植被则是原生植被受不同程度干扰后形成的多种次生植被类型,且都处于向上演替的过程之中,保存最好的是苹婆纯林及其与青檀组成的混交林。研究还表明,只要生境植被保持良好的向上演替,白头叶猴也必将得到有效的保护。     

规模猪场疫病防控存在的问题和解决对策

随着经济的高速增长,畜牧养殖业也迎来了良好的发展契机,养猪场规模化、集约化程度明显增强,在一定程度上提高了经济效益。疫病防控工作仍然是规模化养猪场管理的重点,也是促进养猪业健康持续发展的基石。本文总结了现阶段规模化养猪场疫病防控工作中存在的问题,并结合实际情况提出有效应对策略,旨在为规模化养殖提供理论依据。     

奶水牛V_A缺乏症的诱因及综合防治

VA是维持奶水牛正常视觉功能、促进皮肤组织黏膜完整性和维持骨骼正常发育的重要微量元素。VA的缺失会诱发奶水牛的营养性疾病。多年来,笔者从事奶水牛养殖技术指导工作,工作中常见有VA缺乏症的情况。文中就奶水牛VA缺乏症的诱因、防治等开展分析并提出建议,供大家参考。