山西糜黍遗传差异评估及分子身份证构建

应用微卫星标记对糜黍资源进行遗传多样性分析，确定其遗传背景，有利于资源的合理高效利用。以80份山西糜黍核心种质为材料，44个SSR标记为检测工具，利用软件PowerMarker 3.25和PopGen 1.32计算遗传多样性衡量参数，使用MEGA 11.0.10软件绘制聚类图，使用NTSYSpc2.11a软件进行主成分分析，应用ID Analy?sis 4.0软件构建材料的DNA分子身份证。结果表明，80份材料在44个位点共检测出130个等位变异，平均每个位点检出3个；基于UPGMA聚类分析，80份材料划归4个类群（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ），分别以晋中市、忻州市、朔州市、忻州市材料为主。主成分分析将材料划归10类（G1～G10），其中，G1均来自大同市，G2均来自朔州市，G3均来自忻州市，G4均来自太原市，G5～G10分别来自阳泉市、晋中市、吕梁市、长治市、临汾市和运城市。综合多态性信息含量（PIC）和Shannon多样性指数（I）值得出，高于平均值的SSR引物有21对（RYW3、RYW7、RYW11、RYW14、RYW18、RYW26、RYW28、RYW29、RYW30、RYW31、RYW3...     

中国谷子名米品种遗传多样性与亲缘关系研究

中国是谷子的起源地,历史上的四大传统名米分别为沁州黄、桃花米、龙山小米和金谷米,由于其具有良好的商品与食用品质特征,曾被选为皇家贡米。为探究谷子四大名米的遗传多样性以及与同名品种间的亲缘关系,本研究利用46对SSR标记和22对SRAP标记分别对四大名米及其同名品种共l79份材料的遗传差异进行分析。SSR结果表明,材料间遗传距离为0.0435～0.6304,平均0.3267, PIC为0.2406,等位基因频率为0.7845,遗传多样性为0.2968;基于UPGMA将179份资源聚为10个群组,聚类与其来源有一定相关性;基于Structure和主成分分析均可将材料分为3个类群。SRAP结果表明材料间遗传距离为0.1818～0.9545,平均为0.6001, PIC为0.5257,等位基因频率为0.5718,遗传多样性为0.5688;基于UPGMA将179份材料分为14个类群;基于Structure和主成分分析均可将材料分为3个类群,类群间界限清楚,类群划分与其来源一致。