单宁酸对嗜水气单胞菌转录组影响的研究

嗜水气单胞菌作为水产养殖业中的主要病原菌，严重危害该产业的发展。为探究单宁酸对嗜水气单胞菌的抑菌作用及其转录组的影响，本实验将单宁酸2倍倍比稀释(8μg/mL～8 192μg/mL)后，测定单宁酸对嗜水气单胞菌ATCC 7966株的最小抑菌浓度(MIC)；将嗜水气单胞菌分别与不同浓度的单宁酸共培养，根据所测细菌OD600nm值(共测24 h)，绘制细菌的生长曲线。结果显示，单宁酸对嗜水气单胞菌的MIC为2 048μg/mL；浓度低于64μg/mL (临界值)单宁酸处理后不影响嗜水气单胞菌的生长。因此本实验采用64μg/mL的单宁酸与嗜水气单胞菌ATCC 7966株共培养，每组重复4次，12 h后提取各组嗜水气单胞菌总RNA，反转录为cDNA后构建cDNA文库，再利用随机引物，经PCR扩增、定量后，采用Illumina HiSeq测序平台进行转录组测序(RNA-Seq)。通过计算每个样品中r RNA的占比(rRNA%)及碱基的错误率对测序数据质控；采用Bowtie2将获得的各组嗜水气单胞菌测序数据与GenBank中嗜水气单胞菌ATCC 7966株参考基因组比对，分析它们之间的相似性。结果...     

长江天鹅洲白鱀豚国家级自然保护区鱼类资源现状

了解湖北长江天鹅洲白鱀豚国家级保护区的鱼类资源现状,为豚类保护措施的制定提供参考,也为长江渔业资源的保护和管理提供依据。于2017-2019年在保护区水域进行了渔获物和渔业水声学调查。调查共采集到鱼类83种(亚种),结合历史资料,保护区共分布有鱼类154种(亚种),隶属于11目25科85属。历史资料中的71种在此次调查中未采集到,有7种为此次调查新增种类。长江干流和天鹅洲故道的优势种和鱼类密度均存在较大差别。在保护区长江干流江段,黄颡鱼(Tachysurus fulvidraco)和银鮈(Squalidus argentatus)为优势种,在天鹅洲故道,光泽黄颡鱼(Tachysurus nitidus)和贝氏歺又鱼(Hemiculter bleekeri)为优势种。长江干流和天鹅洲故道的鱼类资源平均密度分别为(0.40±0.38)和(0.94±0.81)尾/m~3。调查结果表明,保护区的鱼类资源仍处于衰退的进程中,需针对保护区不同水域采取不同的保护措施。     

基于环境DNA宏条形码的红枫湖鱼类多样性研究

2020年11月，按地理区域将贵州省清镇市猫跳河梯级水电站拦河而成的典型喀斯特高原型深水人工水库红枫湖水域划分为南湖（S1、S2、S3）和北湖（S4、S5、S6）共6个采样点，利用eDNA(environmental DNA, eDNA)宏条形码技术探究了贵州喀斯特高原水域鱼类多样性。结果：共监测到鱼类28种，隶属于4个目、13个科、25个属，其中梭鲈属（Sander）、鲚属（Coilia）、鳜属（Siniperca）、乌塘鳢属（Bostrychus）和鲈属（Perca）为优势属；南北湖鱼类群落空间分布差异性不显著（P>0.05），但各样点鱼类群落组成差异明显，其中S2鱼类群落多样性指数最高（Chao1 618.9;Shannon 3.16）,S6鱼类群落多样性指数最低（Chao1 190.87;Shannon 0.98）。在所有鱼类组成中，鲈形目共13种，占46.43%，这表明该水域可能受人工养殖及引种放流等影响而导致外来物种入侵。结果表明，环境DNA技术可用于喀斯特高原水域的鱼类多样性及空间分布研究，并丰富了红枫湖鱼类基础资料及调查手段。