1株竹鼠奇异变形杆菌的分离鉴定及药敏分析

为确定广东某竹鼠养殖场发生竹鼠死亡的原因,本研究从发病竹鼠血液和组织中分离到可疑细菌,并对分离的菌株进行革兰氏染色、生化特性分析和16S rRNA基因鉴定及序列分析,同时进行药敏试验.结果显示:分离的细菌为杆状、球状和球杆状形状不一的革兰氏阴性菌;生化特性与奇异变形杆菌基本一致;16S rRNA序列与NCBI数据库中奇...     

粤北地区H9N2亚型禽流感和新城疫流行情况调查

为了了解广东省粤北地区家禽H9N2亚型禽流感和新城疫流行状况,采用H9N2 AIV和NDV实时荧光定量PCR方法对2014年-2017年在粤北地区18个采样点采集的6 500份样品进行检测,并将阳性样品进行PCR扩增与分析。结果表示,从6 500份样品中检出H9N2 AIV 44份,NDV 6份,H9N2 AIV和NDV混合感染3份。1月～3月H9N2 AIV检出率最高,H9N2亚型禽流感在粤北地区流行呈逐年下降趋势。新城疫在粤北地区的流行以散发为主没有明显的季节。序列分析显示,3株H9N2 AIV属于我国H9N2 AIV主要流行分支,3株NDV与F48E9强毒株同源性较高,遗传进化关系上属于同一分支。通过对粤北地区H9N2 AIV和NDV的调查分析,明确了H9N2 AIV和NDV的流行变异趋势,可为粤北地区H9N2 AIV和NDV的综合防控提供参考。     

山羊鼻内肿瘤病毒荧光定量PCR检测方法的建立及应用

为了解山羊鼻内肿瘤病毒(ENTV-2)的流行情况,本研究针对ENTV-2的env基因设计了1对特异性引物与探针,通过RT-PCR条件优化,成功建立了ENTV-2荧光RT-qPCR检测方法.该方法特异性高、灵敏性强(5.61 copies/μL)、重复性好(CV为0.09％～1.20％).本研究建立的一步法荧光RT-qP...     

猪圆环病毒2型和3型双重荧光PCR检测方法建立及应用

猪圆环病毒属于圆环病毒科圆环病毒属,目前基因型分为PCV1、PCV2、PCV3和PCV4.但在临床上,PCV2和PCV3流行较多,且鉴于PCV2和PCV3高度相似的临床特征,因此,建立一种快速、可靠的可同时检测PCV2和PCV3的方法,对PCV的临床诊断和流行病学调查意义深远.本研究利用生物信息学软件,设计2对引物和2...     

华南地区牛结节性皮肤病病毒全基因组测序及分析

为了对2020年我国华南地区牛结节性皮肤病(lumpy skin disease, LSD)疫情进行溯源调查,本研究采用商品化检测试剂盒和透射电镜对2份华南地区疑似感染的牛皮肤结节组织样本进行鉴定,利用高通量测序技术进行病毒全基因组测序,并对其进行序列比对、遗传进化和病毒重组分析。qPCR检测结果显示2份样本均为牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus, LSDV)阳性,电镜观察到典型LSDV病毒粒子形态,将其命名为China/GD02/2020株和China/GX01/2020株,获得全基因组序列上传GenBank获得登录号分别为OM803091和OM803092。对病毒全基因组序列比对及遗传进化分析显示GD02和GX01株的核苷酸相似性达到99.99%,并与2020年中国台湾、中国香港和越南的LSDV分离株处于进化树的同一小分支,且均归属为重组病毒。病毒重组分析表明2株病毒的主要亲本为南非疫苗株(Neethling vaccine LW 1959),次要亲本为摩洛哥从牛分离的田间株(LSD/KSGP 0240/Morocco/2017)和南非野毒株(Ne...