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基于全基因组信息鉴定中国荷斯坦牛产奶性状基因及功能注释 总被引:1,自引:1,他引:0
前期研究基于中国荷斯坦牛女儿设计资源群体,采用Illumina公司Bovine50K微珠芯片对产奶性状进行了全基因组关联分析(GWAS),利用传递不平衡(L1-TDT)和回归分析(MMRA)2种统计分析方法共同检测到35个显著SNPs位点。本研究旨在基于该GWAS结果进一步对产奶性状基因进行鉴定及功能注释。基于牛基因组序列草图(Btau4.2),采用生物信息学和比较基因组学方法进行显著SNPs位置候选基因筛查和功能预测。分析发现,12个SNPs位点位于基因内部,23个位于基因侧翼,最终鉴定到28个位置候选基因,并确定了其物理位置、基因类型及潜在功能。基因功能可归纳为6种类型:调节机体营养成分代谢和平衡、细胞骨架或基质成分、调节细胞增殖和周期及凋亡、参与细胞信号转导和盐离子通道构成、具有激酶活性、参与mRNA转录调控或翻译调控。该研究为进一步鉴定中国荷斯坦牛产奶性状主效基因及功能验证打下了基础。 相似文献
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对江苏商品蛋鸡6个鸡场临床表现严重血管瘤鸡群的送检样品进行了病理学分析,结果发现,送检的6只商品蛋鸡均可见体表血管瘤,内脏主要在肝、脾、肌胃和肠系膜表面的大小不等的血管瘤,引起严重的肝破裂、脾脏失血和肌胃失血,6个病例中有4个病例出现血管瘤和髓样细胞瘤并存。追踪检测父母代蛋鸡表明,父母代蛋鸡场的各个日龄鸡群均存在不同程度的丁亚群禽白血病病毒(Avian Leukosis Vivus SubgroupJ,ALV-J感染;而送检商品病鸡均呈现病毒血症而抗体阴性,提示垂直传播的可能;ALV-J特异性RT-PCR结果显示,6个样品均存在ALV-J感染;对扩增克隆的部分序列分析可见,此六株病毒之间同源性为97.9%~99.6%,而与原型毒HPRS103之间的同源性则较低(94.6%~95.2%),与同为蛋鸡分离毒株AY360088和SD07LK1同源性为94.2%~95.0%。 相似文献
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为预测番鸭呼肠孤病毒(DRV)YB株σC蛋白二级结构和B细胞抗原表位,对DRV YB株的σC蛋白氨基酸序列与参考DRV相应序列以DNAStar软件进行同源性和遗传进化树分析;采用SOPMA法、Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schultz法方法预测其二级结构;用Hopp-Woods法、Emini法、Jameson-Wolf法和吴玉章等建立的方法分别预测蛋白的亲水性、表面可能性和抗原指数,然后综合分析其B细胞抗原表位.结果显示,DRV YB与国内DRV相应序列同源性在93.7%~99.6%,代表性较强;B细胞表位可能在15~27、36~49、40~49及90~98区段或其附近,这4个被预测的表位均含有β-转角和无规卷曲结构.本研究为进一步确定σC蛋白的B细胞表位和反向()计提供了理论基础. 相似文献
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仔猪断奶后腹泻是仔猪早期断奶应激性疾病中最常见和危害最大的一种病症,多发生于早期断奶的仔猪。宁阳县是传统生猪养殖生产大县,从当前生产实际了解到,在一些规模标准化程度相对不高的养殖场中断奶后腹泻仍然是影响生猪饲养、造成养殖损失的一个重要因素。1常见症状断奶后腹泻经常发生于断奶后早期的仔猪,这种消化不良性腹泻症状表现温和、轻微。 相似文献
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本试验选取3月龄的鹅48只,随机分为8个组,每组6个重复。每组试验日粮添加的苜蓿粉含量分别为6.15%、10.10%、13.60%、17.05%、19.80%、22.50%、24.30%、28.60%,使粗纤维(CF)含量依次升高,而能量(ME)、粗蛋白(CP)、钙(Ca)、有效磷(AP)、蛋氨酸(Met)、赖氨酸(Lys)等水平基本一致。采用全收粪法,检测粪便中的CP和氨基酸(从),确定其消化率,以探讨不同苜蓿粉添加比例的结构日粮对鹅消化吸收的影响。结果表明:在ME和CP等摄入量一致的条件下,随着苜蓿粉添加水平的提高,N的沉积量、净蛋白利用率(NPU)差异不显著(P〉0.05);粪中氨态氮(NH3-N)浓度显著下降(P〈0.05),各种氨基酸表观消化率(AAAD)较高(75.62%~93.31%)。 相似文献
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【目的】探讨原核表达的番鸭呼肠孤病毒(DRV)外壳蛋白σC与σB对于雏番鸭的免疫保护作用,为研制有效的DRV亚单位疫苗提供理论基础。【方法】对pET-30a-S3/BL21重组菌与pET-30a-S4 ORF2/BL21重组菌进行稳定性检验,表达的重组蛋白进行纯化和复性后,进行油乳剂制备,50只1日龄雏番鸭随机平均分为5组,即DRV σB蛋白免疫组、DRV σC蛋白免疫组、DRV σB + σC蛋白免疫组及PBS对照组和攻毒对照组,免疫组皮下接种剂量为500 μg/只,7日龄时进行二次免疫,14日龄时进行攻毒试验,ELISA和琼扩(AGP)检测抗体水平并计算保护指数。【结果】重组菌具有良好的稳定性,各免疫组的雏番鸭均在第2次免疫后7 d产生了一定效价的抗体,其中DRV σB + σC蛋白免疫组和DRV σC蛋白免疫组的雏番鸭血清抗体ELISA效价均为1﹕200,高于DRV σB蛋白免疫组的1﹕100。攻毒保护试验结果表明,联合免疫的保护指数最高,可达70,重组DRV σC保护指数次之,为60,重组DRV σB蛋白保护指数最低,仅为40。【结论】使用原核表达的DRV外壳蛋白σC与σB制备油乳剂,联合免疫可诱导雏番鸭快速产生一定效价的抗体,并提供良好的免疫保护力。 相似文献
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为探究番鸭呼肠孤病毒(MDRV)感染对雏番鸭肠黏膜免疫的影响,本研究将100只1日龄MDRV抗原抗体阴性雏番鸭随机分为二组:空白对照组(NCG)和MDRV同居感染组(CIG),利用人工感染发病的20只番鸭对GIC组番鸭进行同居感染。NCG和CIG组番鸭分别于后者同居感染1 d、3 d、6 d、10 d、15 d、21 d后采集其十二指肠、空肠、回肠样品进行肠道形态结构(绒毛高度、宽度、V/C值、肠壁厚度、绒毛表面积)的观察及免疫相关细胞(上皮内淋巴细胞、杯状细胞、肥大细胞)的检测。结果显示:与NCG相比,CIG番鸭肠道绒毛高度下降、宽度变窄,排列稀疏,V/C值降低,绒毛表面积下降,肠壁厚度变薄,上皮内淋巴细胞、杯状细胞、肥大细胞数量下降,尤其是同居感染6 d以后其各项检查指标均与NCG差异极显著(p0.01)。表明MDRV可导致肠道消化吸收功能障碍和黏膜免疫抑制。该研究结果进一步充实MDRV感染的致病机制。 相似文献
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日粮中添加苜蓿粉对五龙鹅纤维消化和氮代谢的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
选取3月龄的健康试验鹅48只,随机分为8组,进行消化代谢试验。各试验组日粮分别添加6.15%,10.10%,13.60%,17.05%,19.80%,22.50%,24.30%,28.60%的苜蓿粉,结果表明:在代谢能(ME)和粗蛋白(CP)等摄入量一致的条件下,苜蓿粉含量为6.15%~28.6%(CF含量为5.41%~12.05%)时,粗纤维(CF)的消化率为17.15%~25.35%,中性洗涤纤维(NDF)21.04%~33.80%,酸性洗涤纤维(ADF)19.10%~28.08%;表观氮沉积(ANR)组间差异不显著(P>0.05);粪中氨态氮(NH4 -N)浓度显著下降(P<0.05);各种氨基酸(AA)消化率较高(75.62%~93.31%);碱性磷酸酶(AKP)活性与CF、NDF和ADF消化率呈显著负相关(P<0.05);酸性磷酸酶(ACP)、谷草转氨酶(GOT)、谷丙转氨酶(GPT)、胆碱酯酶(CHE)、肌酸激酶(CK)、脂肪激酶(LPS)和乳酸脱氢酶(LDH)的活性与营养物的消化率呈弱相关(P>0.05)。 相似文献
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