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sRNA伴侣蛋白Hfq敲除条件下沙门菌的转录组分析 总被引:1,自引:0,他引:1
为探明沙门菌(Salmonella)在sRNA伴侣蛋白Hfq敲除条件下转录组变化情况。本试验采用HiSeq测序平台对沙门菌LT2菌株及其Hfq敲除株进行高通量测序,通过DESeq2差异分析方法筛选敲除sRNA伴侣蛋白Hfq条件下的差异表达基因,对其进行生物信息学GO功能显著性富集分析和Pathway显著性富集分析。结果显示,对照组和试验组分别得到12 753 534条、8 254 308条Clean Reads。通过DESeq2差异分析获得差异基因1 055个,其中表达上调基因516个,表达下调基因539个。GO功能显著性富集分析表明显著差异表达基因主要富集在钴胺素代谢过程、钴胺素生物合成过程、碳水化合物代谢过程等生物过程中。Pathway显著性富集分析表明显著差异表达基因富集到细菌趋化性、丙酸代谢和碳代谢等11个信号通路中。结果表明,本试验应用RNA-seq技术丰富了sRNA伴侣蛋白Hfq调控基因数量,筛选出20个受伴侣蛋白Hfq调控的显著差异表达基因,其中4个基因功能及编码蛋白未知,注释了差异表达基因的生物学功能及信号通路,推断Hfq在细菌对数期主要通过影响营养提供和趋化性等途径,继而影响细菌的正常生理活动,为Hfq协同sRNA的调控机理研究及sRNA靶基因的筛选奠定了基础。 相似文献
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为了解云南省与贵州省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)ORF3基因变异情况,试验采用PCR技术、分子克隆及序列分析方法对云南省昆明市某规模化养猪场发生腹泻的6头病猪的粪便病料样本进行了研究。结果表明:1株PEDV ORF3基因均含有964个碱基,编码320个氨基酸;ORF3基因均无碱基缺失或插入,存在部分碱基变异;与GenBank中登录的部分PEDV核苷酸序列的同源性为95.1%~99.9%,推导氨基酸序列的同源性为94.2%~98.7%;与经典毒株CV777及贵州毒株GZZY、GZMR、GZZAI1亲缘关系较近,与贵州(GZTW3、GZRRH)毒株亲缘关系较远。说明云南省与贵州省主要流行的毒株同源性较高且存在一定相关性。 相似文献
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刘丽娟 《农业图书情报学刊》2012,24(5):150-154
科技论文是总结科学技术研究成果的文献,具有科学性、创新性、学术性等特点。一篇好论文不仅要有科学的分析论证,独到的学术见解,结构严谨、层次清楚、语句通顺,而且还要遵守一定的写作要求。为了提高科技论文写作水平,从编辑的角度出发,仅仅对科技论文的一个类型——研究论文,在内容和格式方面常见的主要问题进行了归纳和总结,以期为广大作者的论文写作有所帮助。 相似文献
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《水浒》中散布出来的有关性别角色的观念应该引起我们的注意,在为数不多的女性角色中,“潘金莲”之类是备受人们关注的.就《水浒》的女性形象分类、女性形象的描写,以及造成这些女子命运悲剧的原因进行了逐一论述,试图找出她们身上的共性,分析造成其悲剧的社会原因. 相似文献
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<正>1症状主要危害石榴叶片和果实,发生严重时导致叶片提早枯落。石榴树感病后,造成树体早期落叶,果实有黑斑,树势衰弱。初期叶面上出现针眼状的黑褐色小斑点,后逐渐扩大为圆形、方形、多角形等不规则斑块,其大小为0.30.5mm×3.0mm。后期叶面病斑为灰褐色或深褐色至黑色边缘常呈黑线状,通常情况1 相似文献
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8月7日,一架直升机在河南省内乡县杨树基地进行“飞防”,使得万亩杨树病虫害遭“空袭”。这是该县针对时下杨树痛虫害大量增加,危害加重而进行防治的一组真实镜头,也是该县连续第九年组织的大规模杨树食叶害虫防治工作的一个缩影。 相似文献
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分析不同种植海拔高度及采制时期对黄山"松谷"毛峰茶中茶多酚、游离氨基酸、咖啡碱、茶多糖和硒含量的影响;采用相关国家标准对黄山"松谷"毛峰茶中相应功能成分进行含量测定;从种植海拔高度看,茶样中茶多酚、游离氨基酸含量、酚氨比值及硒含量随种植海拔高度的增加而增加,对于咖啡碱,高海拔茶样中的含量显著高于平地地区茶样,而不同海拔高度的茶样中茶多糖含量差异不显著;从采制时期看,茶样中茶多酚含量为5月最高,4月次之,6月最低;游离氨基酸含量4月最高,5月次之,6月最低;茶样酚氨比值6月最高,5月次之,4月最低;咖啡碱含量4月和5月基本相同,均高于6月;氨碱比值4月最高,5月次之,6月最低;茶多糖含量6月最高,5月次之,4月最低;硒含量4月最高,5月和6月基本一致。此研究结果表明种植海拔高度及采制时期对黄山毛峰茶中茶多酚、游离氨基酸、咖啡碱、茶多糖和硒含量有交互性影响。 相似文献