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旨在通过测定基因组选择选留的大白公猪的后裔生产性能,探究基因组选择实际育种效果。本研究选用913头大白猪构建参考群体,利用ssGBLUP对新出生的823头大白公猪在去势前进行第一次基因组评估,待生产性能测定后进行第二次基因组评估,最终选留10头性能差异显著的公猪留种,比较其后代生长性状表型和育种值及综合选择指数差异。结果表明,两次基因组遗传评估,达100 kg体重日龄、100 kg活体背膘厚和总产仔数3个性状基因组育种值(GEBV)估计准确性分别由0.56、0.67和0.64提高至0.73、0.73和0.67,两次基因组选择基因组母系指数相关系数为0.82,表明在去势前进行公猪基因组选择具有较高的准确性,可实现种猪早期选择。根据各性状GEBV和基因组母系指数,10头公猪被划分为高、低生产性能组,后裔测定成绩表明,两组公猪后代100 kg体重日龄表型均值之差为2.58 d,育种值之差为3.08 d,100 kg活体背膘厚表型均值之差为1.15 mm,育种值之差为1.03 mm,综合母系指数均值之差为9.3,除后代100 kg体重日龄表型均值之差外,其他差异均达到极显著水平。本研究证明,在基因组评估中具有显著差异的公猪其后代在表型值和育种值等方面均存在显著差异,通过基因组选择能够挑选出优秀种公猪,可将其遗传优势传递给后代。 相似文献
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中国荷斯坦牛初产日龄遗传评估及全基因组关联分析 总被引:2,自引:0,他引:2
基于高通量SNPs测序的全基因组关联分析为奶牛繁殖性状相关基因的探索提供了契机。本研究基于课题组前期中国荷斯坦牛基因组测序芯片的结果,通过DMU(v 6.0)采用AI-REML结合EM算法的动物模型对北京地区2001-2011年10年间19 111头中国荷斯坦母牛初产日龄记录进行遗传参数估计,并应用PLINK(v 1.07)将大群估计的2 172头中国荷斯坦母牛初产日龄性状的育种值(EBV)作为表型值,进行基于无关群体设计的全基因组关联分析。通过全基因组水平的Bonferroni校正,共检测到1 700个SNPs与初产日龄显著相关。选取P值达到10-15的43个SNPs进行初步分析,其中12个位于X染色体上。显著SNPs上下游200kb范围内存在KLHL4、TRAM1、TRAM2、ZNF438、MATK等繁殖障碍疾病相关基因。7号染色体1 Mb(20.42~21.52 Mb)区域内多个SNPs位点与初产日龄显著相关。这些基因和区域可以作为影响初产日龄性状的重要候选基因和区域,为揭示奶牛繁殖性状的分子遗传基础积累了素材。 相似文献
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Chuan Yu Qiu Liu Aijian Qin Xuming Hu Wencai Xu Kun Qian Hongxia Shao Wenjie Jin 《Veterinary research communications》2013,37(4):277-283
Marek’s disease virus (MDV) is a highly cell-associated herpesvirus that causes a disease in chickens characterized by tumor formation and immunosuppression. The changes of major histocompatibility complex (MHC) expression in different MDV-infected cells are not completely understood. In this study, we investigated the expression of the Class I MHC and β2-microglobulin (β2m) genes in response to MDV infection at different time points by real-time PCR. In both in vitro and in vivo, the expression levels of Class I MHC and β2m genes were upregulated during early MDV infections in comparison to control cells; We also found that the expression of Class I MHC gene was downregulated in BudR (5-bromo-2′-deoxyuridine)-treated MSB1 cells at 48 h and MDV-infected chicken embryo fibroblast cells (CEF) at 120 and 168 h post infection (hpi); Furthermore, compared to control groups, Class I MHC and β2m expression levels were downregulated in peripheral blood lymphocytes (PBLC) from MDV-infected chickens at 14 and 28 days post infection (dpi); Interestingly, both Class I MHC and β2m gene expression levels increased again in PBLC from MDV RB1B-infected chickens at 35 dpi, in which MDV was in the latent or transformed infection stages. In addition, Class I MHC expression was clearly decreased in MDV-infected CEF at 120 hpi although β2m expression was significantly increased. These changes in Class I MHC and β2m gene expression might provide more insights into host-virus interaction. 相似文献
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微孔草的分布及植物群落特征研究 总被引:5,自引:0,他引:5
采用定量样地法,对孔微草这一特种油料植物的群落结构、群落变异以及群落特征进行了研究。结果表明,微孔草干物质生产量占总量的比率,休闲地为9.16%、撩荒地为16.90%、油草地为15.32%、燕麦地为10.66%、青稞地为5.97%;群落系数相应为87.09%、87.91%、91.82%、95.65%、93.60%;优势度相应为9.60%、13.45%、11.99%、16.61%、7.13%。经主分 相似文献
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研究了石羊河国家湿地公园乔木群落及其林下植被组成特征和物种多样性,为该区域的植被管理提供理论依据。采用分层样方抽样法调查石羊河国家湿地公园的乔木群落及林下植被,分析湿地公园植被组成特征和物种多样性。结果表明:共调查到21科、38属、51种植物,其中乔木层共4科、6属、13种,灌木层共5科、8属、9种,草本层共14科、24属、29种;以乔木层优势树种对调查林分进行划分和命名,可分为7个植被群系,分别为旱柳群系、线叶柳群系、沙枣群系、小叶杨群系、二白杨群系、新疆杨群系和胡杨群系,每个群系中植被组成存在一定的差异;7个植被群系乔木层和灌木层的Simpson指数和Shannon-Weiner指数整体小于草本层,但乔木层的Pielou均匀度指数整体大于灌木层和草本层。综上,石羊河国家湿地公园乔木群落及林下植被林分结构比较简单,树种单一,物种多样性较小,林分稳定性较差。 相似文献
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狗牙根(Cynodon dactylon)是全球最重要、品种最丰富的暖季型草坪草种之一,种或品种间形态相近,采用传统形态学和田间小区试验等方法难以作出鉴定,本试验利用AFLP分子标记技术,对9份常用狗牙根材料的遗传多样性进行了分析.结果表明:13对引物共扩增出1326个条带,平均每对引物扩增出93.2条带,其中多态性条带有1212条,多态性条带比率为91.71%,材料间遗传相似系数(GS)为0.469~0.797,变幅为0.328.聚类分析表明,在GS值为0.648处,可将9份常用狗牙根材料分为5类:T-419、小矮人和老鹰草为一类,摄政王单独为一类,瑞拉和黑杰克为一类,南京狗牙根和普通狗牙根 相似文献