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高通量测序研究慢性肾衰竭对宠物犬肠道菌群多样性的影响及基因功能预测分析 总被引:1,自引:0,他引:1
旨在通过高通量测序研究慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)对宠物犬肠道菌群多样性的影响,并预测分析菌群的基因功能。本研究选取30只2岁健康犬,随机等分为慢性肾衰竭模型组(CRF,肾动脉结扎法制备)、假手术对照组(Sham)和健康对照组(HCG),常规饲养,试验周期56 d。试验过程中,定期检测血肌酐(Scr)、血尿素氮(BUN)和尿蛋白/肌酐比(UP/C),无菌采集新鲜粪便进行细菌16S rDNA测序,分析慢性肾衰竭对犬肠道菌群结构、多样性与功能的影响,并以CRF组差异菌群为自变量进行主成分Logistic回归分析,构建菌群标志物综合指数(FMI)用于慢性肾衰竭预测。结果显示:1)从试验后第28天开始,CRF组Scr、BUN和UP/C分别显著高于自身试验前、HCG组和Sham组(P<0.05)。2) CRF组不同时间点肠道菌群有显著差异,第56天时的Chao 1指数、Shannon指数均降低,拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形杆菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度增加,厚壁菌门(Firmicutes)数量减少,与0 d和28 d比较差异显著(P<0.05),与同时间点HCB组及Sham组比较差异显著(P<0.05)。3)组间菌群LEfSe分析发现,CRF组富集了20个物种,主要包括假单胞菌属(Pseudomonas)、埃希氏菌属(Escherichia)和变形杆菌属(Proteus)等,这些物种与肠道其他菌属间多呈负相关关系;差异物种基因主要富集在氨基酸代谢、糖生物合成和代谢以及碳水化合物代谢等代谢途径。用这些差异物种构建的FMI,其ROC曲线AUC为0.788,可作为犬CRF的肠道微生物标志物。以上结果表明,慢性肾衰竭可以使犬肠道菌群多样性降低、菌群结构失调以及菌群功能改变,且CRF患犬肠道中富集的菌群可作为该病的肠道微生物标志物,以FMI预测效果最好。 相似文献
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执业兽医制度的出台,标志着我国对畜牧生产及动物疫病防治行业从业人员的准入门坎的提高和管理的更加规范,是加强兽医人才队伍建设的关键环节。面对这一新课题,兽医类高职教育院校只有主动适应新形势,科学设计人才培养模式,创新课程体系,突出优势与特色。本研究主要探索宠物类专业课程体系改革,在研究执业兽医资格考试大纲与考点的基础上,结合高职高专教育教学规律,构建既适应于执业兽医资格考试又满足职业岗位需求的终身学习的“工”字型“两宽一深”课程体系,拓宽知识面,加强校企合作,抓实生产实训教学环节,调动学生积极性,增强了学生就业竞争力、就业质量及转岗调岗能力。 相似文献
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奶牛场55例犊牛腹泻主要病原调查 总被引:1,自引:0,他引:1
为了解杨凌周边部分奶牛场犊牛腹泻的病原种类及感染情况,通过对杨凌2个奶牛场的55例腹泻犊牛取样检测,采用快检试剂盒对牛病毒性腹泻病毒、轮状病毒、大肠埃希菌K99、贾第虫以及隐孢子虫进行检测。结果发现不同病原的总体感染率分别为隐孢子虫35.7%,轮状病毒21.4%,大肠埃希菌K9921.4%,贾第虫7.1%,牛病毒性腹泻病毒未检出。结果表明,调查的2个奶牛场犊牛腹泻病原主要为隐孢子虫、轮状病毒、大肠埃希菌K99、贾第虫,其中隐孢子虫总体感染情况最为严重,未检出牛病毒性腹泻病毒。 相似文献
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为研究轮状病毒感染对犬肠黏膜通透性及肠道菌群的影响,选取2018年10月1日至2018年12月30日期间,在江苏农牧科技职业学院教学宠物医院就诊的轮状病毒感染患犬17例,记为A组,并设10例健康体检犬为对照,记为B组。用ELISA试剂盒检测血清中二胺氧化酶(DAO)、D-乳酸及内毒素(ET)的表达,每组随机选取9例,分别采集粪便,通过Illumina Miseq PE300平台进行细菌16S rDNA测序。结果表明:①与B组相比, A组DAO、D-乳酸和ET水平分别升高28.11%、12.37%和17.71%(P0.01)。②A、B2组样品中共有OTU数226个, A组OTU数比B组低12.39%,主成分分析(PCA)显示A、B2组样本显著分开,肠道菌群相似度差异较大, A组肠道菌群ACE指数、Chao 1指数显著低于B组(P0.05)。③在门水平上, 2组样本中拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和梭杆菌门为优势菌群,与B组相比,拟杆菌门和变形菌门比例升高,厚壁菌门比例减少(P0.05);在属水平上, A组拟杆菌属、肠杆菌属、埃希氏菌属、克雷伯氏菌属等菌属数量增加,而双歧杆菌属、瘤胃球菌属、梭菌属等菌属数量与B组相比显著减少(P0.05)。这一研究提示轮状病毒感染后可引起犬肠黏膜通透性升高,改变肠道菌群结构,加剧病情发展。 相似文献
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良圻原种猪场2009年在后备猪采用血清驯化,以保持猪群蓝耳病的稳定。为进一步了解公司内部所用猪蓝耳病病毒的特性,用同一猪蓝耳病病毒的不同拷贝数(0、20、40、400、4 000和20 000)分别对6头蓝耳病抗原抗体双阴性仔猪进行攻毒试验。病原检测:攻毒24h后,除阴性猪外,5头猪均抗原检测到PRRSV病毒核酸,抗体检测;攻毒后的前6 d抗体均为阴性,7 d后攻毒猪只抗体逐渐转阳;第9天抗体全部转阳且较第7天有大幅升高第11天后,整体抗体稍有上升但较缓慢,攻毒21 d后,各猪只抗体值在1.7~2.3之间。表明20个病毒拷贝数就足以感染猪只。 相似文献
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本试验旨在研究脂联素(APN)/脂联素受体1 (AdipoR1)/腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)信号通路在银杏叶提取物改善高脂饮食诱导的肥胖犬脂质代谢及脂肪沉积中的作用。试验选取雄性成年泰迪型贵宾犬50只,适应性饲喂2周后分成对照组(A组,n=6)和高脂饲粮组(n=44)。对照组饲喂基础饲粮,高脂饲粮组饲喂高脂饲粮(基础饲粮+25%猪油)。饲喂8周后高脂饲粮组成功建立肥胖犬模型,筛选30只肥胖犬,等分成5组:高脂饲粮对照组(B组,n=6)、银杏叶提取物组(C组,n=6)、阴性siRNA(N-siRNA)对照组(D组,n=6)、APN-siRNA组(E组,n=6)和AdipoR1-siRNA组(F组,n=6)。A组继续饲喂基础饲粮,其他各组继续饲喂高脂饲粮。C组、D组、E组和F组每天按50 mg/kg BW的剂量灌服银杏叶提取物,A组和B组灌服等量生理盐水。此外,D组、E组和F组在腹部皮下注射500μL siRNA,A组、B组和C组注射等体积生理盐水,每周3次。试验周期为4周。试验结束后,测量试验犬的体重及体脂率,测定血清甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C... 相似文献