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【目的】对一批荷兰进境番红花种球(Crocus sativus)进行病毒鉴定,以防止危险性病毒传入危害。【方法】根据已报道的马铃薯Y病毒科(Potyviridae)通用引物(Sprimer和M4T),采用RT-PCR方法对一批番红花种球样品进行检测,取其中一个RT-PCR产物进行克隆测序,利用Gen Bank上的基本局部比对搜索工具(Basic Local Alignment Search Tool,BLAST)和MEGA 6中的基于对数期望的多重序列比较(Multiple Sequence Comparison by Log-Expectation,MUSCLE)进行序列比对分析,并根据外壳蛋白基因(coat protein,CP)序列利用最大似然法(maximum likelihood method)进行系统发育分析。【结果】RT-PCR检测结果显示该批样品扩增到一条约1.7 kb的预期大小片段,说明该批番红花种球样品中存在Potyviridae科病毒。测序获得长度为1 666bp的序列(命名为2677-NL),含有部分核内含体b基因(nuclear inclusion b,NIb)、完整的CP和3′端非编码区(3′-UTR),其核苷酸序列与虎眼万年青花叶病毒(Ornithogalum mosaic virus,Or MV)的SW3.3分离物具有最高序列一致性(99.6%),与Or MV参考基因组序列(Reference genomic sequences,Ref Seq;NC_019409)的序列一致性为99.1%。该分离物的CP与6个Or MV印度分离物(JQ686722、JQ686720、JN692498、JN692497、JN692496、JF682235)的核苷酸和氨基酸序列一致性分别为71.5%—77.3%和65.7%—79.7%,与其他32个Or MV分离物的核苷酸和氨基酸序列一致性分别为77.9%—99.5%和82.9%—99.2%。基于CP进行的系统发育分析表明,Or MV可分为两个类群,而2677-NL与5个澳大利亚分离物(JQ807995、JQ807996、NC_019409、AF185964、AF185965)相聚成簇,表明其在系统发育关系上与Or MV澳大利亚分离物的亲缘关系最近。【结论】根据国际病毒分类委员会(ICTV)关于Potyviridae科病毒种类的分类标准,2677-NL为Or MV的一个分离物,证实该批番红花种球受到Or MV的侵染。这是世界上首次在番红花中发现Or MV的报道。 相似文献
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小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)是葫芦科作物上的一种重要病毒,近几年来已成了我国葫芦科作物上的一种重要病原物。根据已知的ZYMV基因组序列分别设计了2对特异性引物,在优化RT—PCR条件的基础上,成功建立了ZYMV的RT—PCR检测方法。引物ZYM1/ZYM2用于扩增整个CP基因序列(片段长度949bp),而引物ZYM3/ZYM4用于扩增部分CP基因序列(片段长度449bp),其中,引物ZYM3/ZYM4的检测灵敏度比引物ZYM1/ZYM2的检测灵敏度高。把所建立的方法用于南瓜(Cucurbita moschata)、丝瓜(如如cylindrica)病叶的检测,结果在这些病叶中也检出ZYMV。因此,该方法可用于ZYMV的快速、灵敏检测及分子流行病学的调查研究。 相似文献
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有益瓢虫的生防利用研究概述 总被引:7,自引:0,他引:7
对国内近三十年来有所研究报道的有益瓢虫的种类、防治对象及分布作一综述,有益瓢虫共有51种,其中3种为国外引进种,48种为国内所有种,除一种为菌食性外,其余均为捕食性,所取食的害虫种类大多数为介壳虫、蚜虫、螨类、粉虱,极少数种类取食叶甲、木虱、飞虱若虫、叶蝉若虫等。 相似文献
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新菠萝灰粉蚧(Dysmicoccus neobrevipes(Beardsley))是我国进境植物检疫性有害生物,新菠萝灰粉蚧和菠萝灰粉蚧(D.brevipes)经常从进口菲律宾和东南亚水果中截获,用形态学方法对二者进行鉴定较难,且耗时较长。为了对这两种粉蚧进行快速准确鉴定,本研究利用mtDNA COI基因设计了两组特异性引物和MGB探针,应用TaqMan实时荧光PCR方法实现了对新菠萝灰粉蚧和菠萝灰粉蚧进行快速准确鉴定的目的。该方法耗时短,重复性好,适合在口岸检疫中推广应用。 相似文献
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根据西班牙提供的脱水燕麦草相关材料,查阅中国国家有害生物检疫信息系统和国内外有关文献期刊,检索CABI数据库,总结西班牙燕麦草上发生的有害生物。按照第11号国际植物检疫措施标准和《GB/T 20879—2007中华人民共和国国家标准——进出境植物和植物产品有害生物风险分析技术要求》,对进境的西班牙燕麦草可能携带的有害生物进行了风险分析,明确需重点关注的有害生物有12种,含昆虫1种、真菌1种、细菌1种、线虫2种、病毒2种和杂草5种,根据分析结果,结合贸易实际情况,提出了降低有害生物随燕麦草传入的风险管理措施。 相似文献
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为了准确快速鉴定甘蔗簇粉蚧,利用显微技术对虫体进行观察,再提取单头粉蚧基因组DNA,应用COI通用引物进行PCR扩增并双向测序。PCR产物测序分析后,输入GenBank中进行BLAST搜索并应用MEGA11构建系统发育树。结果表明甘蔗簇粉蚧主要形态特征为具有18对刺孔群,钉状单孔散布背面,多格腺少,仅在阴门附近,领状管腺无。所获得的COI基因序列与甘蔗簇粉蚧具有100%一致性,系统发育分析表明样品的COI基因序列均与甘蔗簇粉蚧处于同一分支中。研究结果可为该类粉蚧的检疫鉴定提供参考。 相似文献