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为了探究西瓜NAS基因家族的生物学功能,基于西瓜全基因组组装注释数据,利用HMMER、MEGA、TBtools等工具对西瓜NAS家族进行生物信息学的鉴定和分析,包括染色体定位、蛋白质结构、蛋白保守基序、系统进化树、启动子顺式作用元件和共线性分析。结果表明:在西瓜全基因组中共鉴定出4个ClaNAS基因,分布于2号染色体、3号染色体、6号染色体上;编码的氨基酸数量变化范围为277~356aa、分子量为30.68~39.88kDa、等电点为4.71~7.46;4个claNAS成员编码蛋白质的二级结构组成一致,三级结构差异明显;拟南芥、水稻、甜瓜、番茄和西瓜5个物种的NAS基因家族被分为3个亚族,其中葫芦科植物被单独聚为一类;西瓜NAS基因家族的启动子区含有激素应答、光响应、胁迫应答、转录因子结合位点等多种顺式作用元件;西瓜基因组内未发现NAS基因的串联重复和片段复制,但西瓜NAS基因与拟南芥、番茄的NAS基因间分别存在2个共线性基因对。西瓜NAS基因家族的全基因组鉴定与生物信息学分析为进一步研究西瓜NAS基因的功能和分子机制提供了依据。 相似文献
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GRAS基因家族是植物中广泛存在的一类转录因子,在植物生长发育、生物和非生物逆境胁迫、光信号和激素信号应答等多个过程中发挥重要作用。对玉米GRAS基因家族成员的理化性质、染色体定位、系统发育、顺式作用元件等特征进行了分析。结果表明,在玉米全基因组中共鉴定出49个ZmGRAS基因,不均匀地分布于1~10号染色体上,编码蛋白质理化性质差异较大,可能在不同的微环境下发挥作用。系统进化分析将GRAS蛋白分为8个亚家族,可能在调节自身生长发育、逆境应答等过程中具有重要作用。玉米GRAS基因家族的启动子区含有激素应答、光响应、胁迫应答等多种顺式作用元件,推测其可能响应激素、胁迫等多种信号。共线性分析显示,具有共线性关系的基因可能是染色体片段复制的结果,且属于同一亚家族,具有相似的结构和功能。研究结果为进一步研究玉米GRAS基因的功能和逆境胁迫响应机制提供了依据。 相似文献
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外源物质对低温胁迫下西瓜幼苗生理特性的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
以'B4'西瓜为试材,采用6个水杨酸(SA)浓度(0.01、0.1、0.5、1.0、2.5、5.0 mmol·L-1)和4个油菜素内酯(BR)浓度(0.005、0.05、0.5、5.0 mg· L-1)分别喷施西瓜幼苗的叶片,研究了低温胁迫条件下不同浓度SA和BR对西瓜幼苗生理特性的影响,以期能够阐明遭受冷害胁迫时外源激素类物质调节西瓜幼苗生长发育和提高幼苗耐寒性的生理作用机制,为外源物质在西瓜设施栽培中缓解冷害胁迫提供参考依据.结果 表明:低温胁迫条件下,随着SA和BR浓度的增加,超氧化物歧化酶(SOD)活性、过氧化物酶(POD)活性、可溶性蛋白质含量均有先增加后降低的趋势,丙二醛(MDA)含量的变化趋势均是先降低后升高,SA的浓度为0.5 mmol·L-1时处理效果最明显,BR的最佳处理浓度为0.05 mg·L-1.此外,SA和BR均能够在短期内显著增加低温胁迫下西瓜幼苗中SOD活性、POD活性和可溶性蛋白质含量,并显著降低MDA含量;但随着低温处理时间的延长,SA和BR处理的西瓜幼苗中SOD活性、POD活性和可溶性蛋白质含量均有降低的趋势,MDA含量有增加趋势,在低温处理的第0.5天,SA的处理效果最好,而BR是在第1.5天效果最好. 相似文献
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针对目前中国小麦秸秆利用率不高以及燃烧秸秆所带来的环境污染问题,该文研究了利用稀烧碱溶液处理小秸秆以制备用于复合材料的小麦秸秆纤维的性能及制备工艺,研究了氢氧化钠溶液质量分数、液固比、处理温度和处时间等工艺参数与小麦秸秆纤维失重率的关系,并对所制备的小麦秸秆纤维的强伸性能、表面性能进行了测试。结果明,小麦秸秆经稀烧碱溶液处理(氢氧化钠质量分数4%、液固比30mL/g、处理温度100℃、处理时间60min)后制的小麦秸秆纤维力学性能与原样相比没有明显损伤,但内、外表面结构均变得疏松,比表面积增大,滴水接触角变小从而提高了聚合物聚乳酸对秸秆纤维的浸润性能,提高了二者之间界面的粘结性。该研究结果为利用小麦秸秆制备秸纤维增强聚乳酸复合材料提供参考。 相似文献
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采用Sentinel-2 MSI(multispectral instrument,MSI)作为数据源,以多尺度面向对象分析为基本方法,研究分析塑料大棚与其他地物在不同分割尺度下的典型特征,建立一组大棚指数,提出一种基于大棚指数集的塑料大棚提取方法。通过山东省潍坊市某地区的塑料大棚提取试验对方法进行验证,应用该方法提取大棚的生产者精度、用户精度和总体Kappa系数分别为96.6%、89.2%和0.9,测试精度表明该方法能较为有效地应用于塑料大棚提取研究。 相似文献