排序方式: 共有43条查询结果,搜索用时 15 毫秒
21.
为了全面了解苦瓜转录组SSR位点特征和满足苦瓜分子育种对分子标记的需求,利用MISA软件对来自苦瓜材料‘大沥-11’6个组织的59740条转录组Unigene序列进行SSR位点搜索,共检测出31066个SSR位点,出现频率(发现的SSR个数与总Unigene数之比)为52.00%,平均每2.62 kb出现1个SSR位点。在苦瓜转录组SSR位点中,基元类型主要为三核苷酸,占总SSR位点的42.17%;其次是二核苷酸,占总SSR位点的31.66%。利用Primer 3软件对搜索到的苦瓜转录组SSR位点进行引物设计,然后把获得的引物序列比对回苦瓜的参考基因组,选择上下游引物序列都是唯一比对的序列并去除重复后共获得9135对特异SSR引物。选择MC00上的232对特异SSR引物对‘谭边大顶’和‘华艺320’两个苦瓜品种基因组DNA进行PCR扩增,其中有219对特异引物可扩增出清晰的条带,有效扩增率为94.40%;有31对特异引物扩增产物表现出多态性,多态率为13.36%。本研究开发的苦瓜转录组特异SSR引物为苦瓜的种质资源分析、基因定位、分子标记辅助选择等理论与应用研究提供了引物数据参考。 相似文献
22.
23.
24.
25.
26.
27.
RAPD标记构建辣椒分子连锁图谱研究初报 总被引:5,自引:0,他引:5
以辣椒属长椒变种的两个自交系杂交所得的F1代经自交获得F2 代的 93个单株为作图群体 ,利用RAPD技术开展了辣椒分子遗传图谱的构建研究 :选用Operon公司的 3 2 0个随机引物对亲本进行了RAPD多态性检测 ,通过多次重复筛选 ,获得了 3 3个多态性引物 ,得到 49个具有较好重复性和稳定性的RAPD标记 ,其中 11个标记表现为偏分离标记 ;利用MAPMAKER/expversion 3 .0软件初步构建了辣椒的分子连锁图谱 ,该图谱由 11个连锁群组成 ,含有 2 8个RAPD标记 ,总长度为 2 82 .41cm。 相似文献
28.
29.
30.
通过对数据库中32 295条非冗余的辣椒EST序列进行搜索,发现3 396个SSR分布于3 277条EST序列中,EST-SSR频率为10.52%,平均分布距离为4.46 kb.在辣椒EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占总SSR的43.02%和37.84%.优势重复基元为GA/TC、AG/CT和AT,分别占15.99%、11.98%和11.37%.用Primer Premier 5.0软件设计了420对引物,对辣椒抗疫病自交系‘B072’和感疫病自交系‘B088’进行PCR扩增,403对引物有扩增产物,引物有效扩增率为95.96%,其中76对引物有多态性,多态性引物占可扩增引物的18.86%.试验证明,利用辣椒EST序列开发SSR标记是可行的. 相似文献