F17大肠杆菌在湖羊羔羊个体脾脏中LncRNA表达谱变化

【目的】通过筛选对大肠杆菌（E.coli）F17菌毛非腹泻型与腹泻型的绵羊脾脏中差异表达的lncRNA,来探究lncRNA对绵羊抗腹泻的作用。【方法】本研究通过对湖羊羔羊口服E.coli F17菌株获得非腹泻和腹泻型个体,利用羔羊肠道细菌计数、病理组织切片验证攻毒成功性;构建非腹泻组和腹泻组羔羊脾脏的cDNA文库,使用Illumina HiSeq 2500平台进行配对测序;通过Gene Ontology（GO）和KEGG Pathway富集分析对差异表达转录本功能描述和细胞通路分析,利用FPKM法估计lncRNA和mRNA转录物的表达水平,并用高通量测序技术RNA-seq筛选出非腹泻和腹泻个体脾脏中的差异表达lncRNA;然后利用荧光定量PCR技术检测了非腹泻组和腹泻组羔羊脾脏组织中DE lncRNA和DE mRNA的表达水平,来验证筛选的DE lncRNA在非腹泻组过程中发挥作用。【结果】羔羊口服E.coli F17菌株后,出现非腹泻和腹泻两种表型,腹泻组羔羊肠道中的细菌数量显著高于非腹泻组（P<0.05）,同时腹泻组羔羊空肠黏膜组织出现不同程度的损伤,色泽暗沉,小肠绒毛部分脱落。笔者利用RNA-seq在非腹泻和腹泻羔羊脾脏中筛选出34个差异表达的（DE）lncRNA,703个的DE mRNA,随机选择一共12个DE lncRNA和DE mRNA,用q-PCR验证它们在非腹泻型和腹泻型羔羊体内的相对表达水平,发现与RNA-seq结果一致。通过Gene Ontology（GO）和KEGG Pathway富集分析,将DE lncRNA与GO 数据库进行比对的结果表明一共有34条lncRNA被注释和分类到302个功能亚类中,绵羊蛋白质结合（GO：0005515）,细胞核（GO：0005634）,poly（A）RNA结合（GO：0044822）,细胞质（GO：0005737）,组织重塑（GO：0048771）,内肽酶活性的调节（GO：0052548））,6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-双磷酸酶复合物（GO：0043540）,磷脂酰肌醇磷酸化（GO：0046854）,果糖-2,6-二磷酸2-磷酸酶活性（GO：0004331）,钙依赖性磷脂酶C活性（GO：0050429）等10 个功能亚类的lncRNA较多,而其余的功能亚类的lncRNA分布较少。将DE lncRNA与KEGG 通路数据库进行比对的结果表明,一共有34条lncRNA被注释和归类到149个KEGG 通路中,绵羊甲状腺激素信号通路（路径：ko04919）,Spliceosome（路径：ko03040）,白细胞跨内皮迁移（路径：ko04670）,神经营养因子信号通路（路径：ko04722）,溶酶体（路径：ko04142）,MAPK信号通路 - 途径（路径： ko04011）,鞘脂信号通路（路径：ko04071）,吞噬体（路径：ko04145）,氧化磷酸化（路径：ko00190）等9 个KEGG 通路的lncRNA较多,而其余的KEGG 通路的lncRNA分布较少。 通过lncRNA-mRNA相互作用网络分析,发现6个共表达基因：MYO1G、TIMM29、CARM1、ADGRB1、SEPT4、DESI2。【结论】探究了对于腹泻产生非腹泻和腹泻型羔羊脾脏中lncRNA的表达谱,发现了非腹泻和腹泻羔羊脾脏中差异表达的lncRNA,有助于找出羔羊如何抵抗腹泻的发生机制,为羔羊抵抗腹泻提供科学的依据。     

不同钙制剂对烟富3号苹果采后贮藏品质的影响

研究硝酸钙、山梨醇混合钙(螯合率为0%)和山梨醇螯合钙(螯合率为100%)处理对烟富3号苹果在贮藏期间主要生理生化指标的影响,探讨其对果实软化的响应机制,以期为苹果采后保鲜提供理论依据。以烟富3号苹果为试材,采后分别浸泡在钙离子质量分数均为0.34%的上述钙制剂20 min,以清水为对照,研究不同形态钙处理对果实硬度、可溶性固形物、酸度、原果胶、维生素C、丙二醛含量和果胶甲酯酶、超氧化物歧化酶活性的影响。结果表明,与对照相比,不同钙形态处理均能维持果实硬度、酸度、可溶性固形物和原果胶含量,抑制果胶甲酯酶活性与丙二醛含量增加,并提高维生素C含量和超氧化物歧化酶活性。其中,在贮藏60 d时,对照、硝酸钙、山梨醇混合钙和山梨醇螯合钙处理的果实硬度分别较初始状态下降30.89%、24.92%、23.07%和22.94%,以山梨醇螯合钙浸泡处理效果最优。因此,可通过采后浸泡山梨醇螯合钙来提高苹果贮藏品质,延长苹果贮藏期。     

竹节参林下栽培技术

竹节参林下栽培是其种植生产的最主要途径之一。文章在简述重庆市巫山县竹节参林下栽培基地概况的基础上,从选地、清林、整地、栽种、日常管理、种子的采收、处理与保存及根茎采收、初加工和储藏,并从耕地、林下、野生环境下竹节参生长、质量的差异,竹节参根茎繁殖和种子繁殖优缺点,"多芽"竹节参培育问题,竹节参种子处理技术问题等进行讨论。可为当前各地快速发展的竹节参开发利用提供参考。     

玉米HD-ZIP I亚家族基因鉴定及表达分析

转录因子是植物响应逆境胁迫的重要调节因子,在其整个生长发育过程中发挥着重要的作用。HD-ZIP家族蛋白是植物中特有的一大类转录因子,包含4个亚家族(HD-ZIP I^IV),其中HD-ZIP I亚家族成员主要参与干旱、渗透压等极端环境和ABA及乙烯等激素处理的响应过程。本文采用隐马可夫模型(HMM)在玉米参考基因组中鉴定到17个HD-ZIP I亚家族成员,这些基因不均匀分布于玉米6条染色体上,与水稻的亲缘关系要近于拟南芥。玉米HDZIP I亚家族基因在玉米7种组织中表现出多种表达模式,具有明显的组织表达特异性。另外, HD-ZIP I亚家族基因对高盐、淹水及冷害等不同的逆境胁迫处理呈现出不同的响应模式及响应程度差异。5种不同激素处理后,玉米HD-ZIP I亚家族基因也表现出复杂的响应模式。这些结果为进一步解析玉米HD-ZIP I亚家族基因的生物学功能和作用机理提供了一定的参考价值。     

CRISPR-Cas9基因编辑系统研究进展

由规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR)和CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated protein)组成的CRISPR-Cas系统是细菌一种重要的获得性免疫系统。经改造的CRISPR-Cas9系统可在真核生物和原核生物、病毒等基因组内实现目的基因的插入、缺失。尽管由于受到单链引导RNA(single guide RNA,sgRNA)识别序列具有特异性的限制,同时一些物种基因结构存在复杂性和特异性,在基因编辑过程中会出现脱靶现象,在一定程度上限制了CRISPR-Cas9系统更加广泛的应用。但是,CRISPR-Cas9系统已经展现出很强的基因编辑能力,提升科研人员基因编辑的能力,是一项极具有应用潜质的新技术。论文主要阐述了CRISPR-Cas9系统结构、组成、设计策略和应用等方面研究进展,为相关科学的研究提供参考。     

森林生态系统服务的价值评估和补偿:概念、原则和指标

通过生态系统服务价值评估途径制定森林生态补偿标准,意味着立足于市场评估森林生态系统服务的经济价值。但是,一些问题困扰着评估实践,选择哪些指标用于评估就是难题之一。评估存量还是流量,选择指标时应遵循的原则,也必须事先得到明确界定。本研究应用生态学和经济学理论,提出了评估本身应遵循的范畴和原则,以及应当选取的价值类型和评估指标。     

东亚和南亚固有绵羊群体X-蛋白等位基因特有频率分布的研究

本研究利用单向水平板淀粉凝胶电泳以我国5个固有地方绵羊品种包括湖羊（Hu）、同羊（Tong）、滩羊（Tan）、小尾寒羊（Han）、洼地羊（WD）为研究对象对X-蛋白遗传多样性进行了检测,并引用我国周边国家、地区绵羊品种为分析背景。结果表明以喜马拉雅山脉为界的亚洲东部和南部的北部群体和南部群体在编码的X（＋）型的显性等位基因X频率上存在极显著差异（P〈0．01）。北部检测的群体中X等位基因频率范围为0～0．18,平均值为0．0878,包括属于藏羊和蒙古羊系统的小尾寒羊（Han）、不丹羊（Bhutan）、同羊（Tong）、湖羊（Hu）、滩羊（Tan）、洼地绵羊（WD）、Bhyanglung绵羊（Bhy）、Baruwal绵羊（Bar）、云南绵羊（Yunnan）、哈拉和林绵羊（Kh）和乌兰巴托绵羊（Ub）。南部检测的群体中X等位基因频率范围为0．2037～0．4655,平均值为0．3082,包括属于印度绵羊系统的孟加拉国绵羊（Ban）、Kagi绵羊（Kagi）、Lampuchhre绵羊（Lamp）、越南占部落绵羊（Cham）和缅甸绵羊（Mya）。本研究揭示X等位基因可作印度绵羊的标记,在绵羊群体尤其是亚洲东部和南部绵羊系统形成的研究中具有潜在的重要作用。     

遗传距离与利用微卫星进行系统树构建初探

以中国牛亚科家畜6个群体12对微卫星数据为基础,采用6种遗传距离（DA、DC、DS、DSW,（σμ）^2和DTL）和2种聚类方法（UPGMA和NJ法）,探索它们对系统树构建准确性的影响。结果表明：微卫星位点平均杂合度水平显著影响系统树构建的准确性,用DA和DC遗传距离构建的系统树准确性相对较高,但很难确定NJ法和UPGMA法哪一种更适合于系统树的构建,而DTL遗传距离用于系统树构建有待进一步完善;最后,对微卫星用于家畜系统树构建的有效性和局限性进行了探讨。     

素质养成教育在动物医学人才培养中的应用

动物医学专业的实践性较强,稳固的基础知识和过硬的实践技能的训练对动物医学人才的培养尤其重要。专业素质养成教育重视专业素质的循序渐进发展,培养学生日渐形成熟练的操作技巧和良好的思维活动能力,为动物医学人才培养所需。此外,加强教师引领作用和探索更多的实践教育途径,能够促进学生不断地积累知识和逐步扎实提升专业技能,充分发挥素质养成教育在动物医学高素质专业人才培养中的作用。