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1.
鸡沙门氏菌脉冲场凝胶电泳分型研究 总被引:1,自引:0,他引:1
为应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)从分子水平上对禽源沙门氏菌之间的差别进行分析和研究,本研究采用自动微生物鉴定仪对12株疑似鼠伤寒沙门氏菌和15株疑似鸡白痢沙门氏菌进行了鉴定.以限制性核酸内切酶Xba I对其全基因组DNA进行酶切、PFGE分型,Info Quest FP聚类分析软件对电泳结果进行分析.结果显示,共鉴定出11株鼠伤寒沙门氏菌、1株圣保罗沙门氏菌、6株阿姆斯特丹沙门氏菌、5株亚拉巴马沙门氏菌、1株鸡白痢沙门氏菌、2株纽波特沙门氏菌和2株肠炎沙门氏菌,一共分为12个PFGE型.实验结果表明,江苏地区存在有不常见的沙门氏菌血清型,同种血清型之间的基因型差别较小(相似值为0.85~1),不同血清型之间差别较大(相似值为0.45~0.70).PFGE能从分子水平上对禽源沙门氏菌的基因组DNA进行分型. 相似文献
2.
旨在克隆获得牦牛StAR基因编码序列(CDS)并进行生物信息学分析,探究其mRNA组织表达特性。本研究以屠宰场采集的成年母牦牛心、肝、脾、肺、肾、卵巢、输卵管、子宫组织(n=5),不同年龄(胎牛、1岁、2岁)牦牛的卵巢(n=3),不同发情周期(卵泡期、黄体期)的牦牛卵巢(n=3),黄体期黄牛的卵巢(n=3)及实验室冻存的牦牛颗粒细胞为研究材料。以牦牛黄体期卵巢cDNA为模板,用逆转录PCR克隆StAR基因,并使用MEGA7.0和ExPASy-ProtParam等软件分析其生物信息学特性;采用实时荧光定量PCR技术分析牦牛StAR基因组织表达特性。结果发现,StAR基因CDS区长858 bp,编码285个氨基酸,StAR蛋白总体带正电荷,属于碱性亲水稳定蛋白,无跨膜结构及信号肽,主要存在于细胞质和线粒体; StAR基因具有较高的保守性,符合物种进化规律。牦牛StAR基因在卵巢表达水平最高(P<0.01),且2岁时卵巢表达水平极显著高于胎牛和1岁龄(P<0.01),黄体期卵巢表达水平极显著高于卵泡期(P<0.01);黄体期黄牛卵巢中StAR基因的表达量极显著高于牦牛(P<0.01);在颗粒细胞的体外培养过程中StAR基因表达量逐渐上升,在培养24 h时达到高峰(P<0.01),随后显著降低。综上所述,StAR基因序列较为保守,在牦牛卵巢组织中表达最高,且表达水平随年龄与卵巢周期而变化,提示StAR基因可能参与牦牛卵巢及黄体功能相关的繁殖调控。 相似文献
3.
根据GenBank中普通牛生长分化因子9(GDF-9)基因序列(AF 307092)设计1对引物,以麦洼牦牛卵母细胞总RNA为模板,通过RT-PCR技术对牦牛GDF-9基因cDNA进行克隆测序和序列分析.结果表明:所克隆的1399 bp片段为预期的牦牛GDF-9基因cDNA序列,包含由2个外显子组成的全编码区和3′-下游部分序列.牦牛GDF-9基因编码区核苷酸序列长度为1362 bp,编码453个氨基酸,与GenBank中报道的普通牛、水牛、绵羊、山羊相应序列一致,而与人和黑猩猩存在差异.和普通牛相比,牦牛GDF-9基因编码区存在1处碱基转换(C→T),导致相应的氨基酸由丙氨酸(A)转换为缬氨酸(V).牦牛与普通牛、水牛、绵羊、山羊、人和黑猩猩的核苷酸同源性分别为99.9%、98.4%、97.0%、96.8%、85.6%和85.1%;氨基酸同源性分别为99.8%、97.1%、95.1%、95.4%、79.4%和79.5%.利用NJ法和MP法以该基因编码区核苷酸序列构建的物种间分子系统进化树结果基本一致,即牦牛与普通牛先聚为一类,再与水牛聚为一类,而后与绵羊和山羊聚为一类,最后与人和黑猩猩聚为一类.该聚类结果与物种间遗传距离大小一致,也与各物种在动物学上的分类相吻合,表明GDF-9基因编码区适用于构建物种间系统进化树. 相似文献
4.
l "trod notionViolent human disturbance results in global landscape and vegetation fragmentation, including thepolar landscape and alpine vegetation (Cox, 1993).In modern world, environment and development aretWo important problems, which have a direct effecton the destiny of human and the earth. Forestry,which undertakes double missions that are to optimize the environment and promote the development,is the crux to realize the unity of environment anddevelopment (Liu 1985).China is a develop… 相似文献
5.
【目的】探究激素敏感脂肪酶(HSL)基因在牦牛内的遗传多态性,为进一步揭示牦牛群体间遗传分化、开展牦牛肉质性状的关联分析以及HSL基因在牦牛物种中的定位、表达调控等研究提供依据。【方法】采用PCR-RFLP方法对九龙牦牛、麦洼牦牛和巴州牦牛共92头牦牛的HSL基因部分外显子I进行SmaI酶切多态性分析;统计基因频率、基因型频率大小,进行卡方(χ2)适合性、独立性检验,并计算纯合度、杂合度、有效等位基因数和多态信息含量等遗传多态参数。【结果】3个牦牛群体在HSL基因外显子I具有SmaI酶切多态性,在该酶切位点存在AA、AB和BB 3种基因型。3个牦牛群体均检测到AA和AB基因型,而BB基因型只在巴州牦牛中检测到。九龙牦牛和麦洼牦牛的AA基因型频率最高,而巴州牦牛AB基因型频率最高;A等位基因频率在3个牦牛群体中均高于B等位基因频率,为优势等位基因。适合性检验表明3个牦牛群体在该酶切位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态;独立性检验表明九龙牦牛与麦洼牦牛、巴州牦牛之间表现为差异显著(0.01<P<0.05)和差异极显著(P<0.01),而麦洼牦牛与巴州牦牛之间表现为差异不显著(P>0.05)。测序分析表明,HSL基因外显子I第70位(从PCR产物测序片段的5′端计数)发生了单碱基突变(G→A),并导致了编码氨基酸由甘氨酸(G)变为精氨酸(R)。【结论】牦牛在HSL基因外显子I内具有SmaI酶切多态性,其多态性是因所分析序列内一单碱基突变(G→A)所致,该碱基转换导致了氨基酸由甘氨酸(G)变为精氨酸(R);在该酶切位点,九龙牦牛、麦洼牦牛和巴州牦牛均处于Hardy-Weinberg平衡状态。九龙牦牛与麦洼牦牛、巴州牦牛之间表现为差异显著(0.01<P<0.05)和差异极显著(P<0.01),而麦洼牦牛与巴州牦牛之间表现为差异不显著(P>0.05)。 相似文献
6.
为了解蚂蚁在高寒草甸生态系统中的功能和作用,评估和认识高寒草甸生态系统的健康状况和稳定性,利用Biolog-ECO生态板法对蚁丘干扰后高寒草甸土壤理化性质以及土壤微生物功能多样性进行研究分析,结果表明,1)蚁丘扰动后0~10 cm土层土壤有机质、全氮、速效氮、速效磷、速效钾含量均显著高于蚁丘10~20 cm土层(P<0.05),而蚁丘扰动与土层深度的交互作用对理化性质均无显著影响(P>0.05);2)蚁丘干扰后高寒草甸土壤微生物多样性指数(Shannon-Weiner指数、Pielou指数、McIntosh指数和底物碳源利用数)有所增加;3)主成分分析表明蚁丘干扰对土壤微生物功能多样性产生了影响,改变了微生物代谢功能特征,土壤微生物利用的主要碳源是碳水化合物、氨基酸类和羧酸类;4)冗余分析表明土壤养分影响土壤微生物碳源代谢特征和功能。因此,由于蚂蚁的挖掘活动、有机质的累积等改变了蚁丘土壤微环境,进而改变了土壤微生物的碳源利用类型和代谢功能。 相似文献
7.
8.
试验旨在研究绿汁发酵液(previously fermented juice,PFJ)对柱花草青贮营养成分及品质的影响。以热研2号柱花草为原料进行青贮试验,设对照组(直接青贮)和试验Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ及Ⅴ组,各试验组PFJ添加比例为1%、2%、3%、4%和5%,30 d后测定柱花草青贮饲料主要营养成分含量及发酵品质。结果显示,与对照组相比,试验Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ组粗蛋白质(CP)含量显著提高(P < 0.05),Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ组中性洗涤纤维(NDF)和酸性洗涤纤维(ADF)含量均有不同程度的降低,Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ组柱花草青贮的饲料相对值(RFV)显著提高(P < 0.05)。添加PFJ试验组与对照组相比显著降低了青贮饲料的pH (P < 0.05),乙酸和丙酸含量均有不同程度的降低,乳酸含量显著提高(P < 0.05)。柱花草直接青贮品质较差,添加PFJ提高了饲料青贮质量评分等级。综上所述,添加PFJ可提高营养价值,明显改善柱花草青贮品质,PFJ添加量为4%时青贮效果最好。 相似文献
9.
10.