藤茶高通量转录组分析及黄酮类化合物合成相关基因挖掘

[目的]分析藤茶高通量转录组序列,从中挖掘出黄酮类化合物合成相关基因,为进一步揭示藤茶黄酮类化合物生物合成调控机制提供理论参考.[方法]分别采集藤茶的幼叶和成熟叶,提取其总RNA构建cDNA文库,采用Il-lumina HiSeqTM 4000高通量测序平台对藤茶叶片进行转录组测序,经过滤处理后运用Trinity组装,将获得的Unigene与Nr、Nt、Pfam、Swiss-Prot、GO、KO和KOG 7个数据库进行比对注释,并预测Unigenes的编码区序列(CDS);基于KEGG信号通路富集分析,发掘藤茶黄酮类化合物合成相关基因.[结果]藤茶叶片转录组测序获得82126236条原始测序序列(Raw reads),过滤处理后得到80156972条高质量序列(Clean reads),进一步组装拼接得到92472条Unige-nes,平均长度为1208 bp,N50长度为1780 bp,其中,至少在1个数据库注释的Unigenes有84217条,占Unigenes总数的91.07%,有8944条Unigenes在7个数据库均被注释,占Unigenes总数的9.67%.在GO数据库成功注释的41116条Unige-nes可分为生物学过程、细胞组分和分子功能三大类,共56个小类;在KOG数据库注释的14553条Unigenes可分成25类,其中,一般功能预测注释成功的Unigenes最多(1946条);其次是翻译后修饰、蛋白质翻转、分子伴侣(1776条),参与次生代谢物质的生物合成、转运和降解的Unigenes较少,仅有319条;KEGG信号通路富集分析发现,共有15262条Unigenes注释到128条KEGG信号通路,以注释为代谢的Unigenes最多,为8694条,其中筛选获得有98个黄酮类化合物合成相关基因,分别编码苯丙烷代谢通路的3种关键酶和类黄酮代谢通路的14种关键酶.藤茶叶片转录组Unigenes与Swiss-Prot和Nr数据库比对,获得52582条CDS序列,ESTScan 3.0.3预测获得35535条CDS序列.[结论]藤茶在细胞过程、代谢过程、单有机体过程、细胞和细胞部分、结合和催化活性能力分布的基因较丰富,在一般功能、翻译、翻译后修饰、蛋白质翻转及分子伴侣的基因表达量较高,具有较强的碳水化合物代谢能力.多种关键酶基因参与藤茶黄酮类化合物的生物合成,推测其生物合成途径存在多条分支,调控机制也较复杂.     

"201"稻草粉栽培真姬菇试验

真姬菇即玉草,其朵型秀美,风味极佳,近年来风靡日本、深受人们青睐。真姬菇秋、冬季栽培,栽培原料有阔叶树木屑、棉籽壳、麦皮、米糠、玉米粉等。为了寻找可代替栽培的原料,1997年,我们利用富含蛋白质的谷秆两用稻"201"稻草粉(下简称201)栽培真姬菇试验,现将试验结果小结如下：     

一种对转基因植物基因表达进行检测的新方法

介绍了对一种检测转基因植物基因表达的新方法－－蛋白免疫原位杂交法，该法与常规的Westernblot相比，具有操作简便，有效可行，所需仪器少等特点，适用于在翻译水平上对转基因植物进行了检测。     

金属离子对魔芋葡甘聚糖分子链拓扑网络结构的影响研究

以魔芋葡甘聚糖分子链和金属离子的相互作用为基础,探讨金属离子与魔芋葡甘聚糖功能的调控关系.运用 分子动力学模拟魔芋葡甘聚糖分子和金属离子作用位点,结合拓扑学进行分析,并对结果进行红外光谱图验证.结 果表明拓扑分析能在一定程度上简化魔芋葡甘聚糖链空间结构描述,对葡甘聚糖为主体的金属离子络合物结合位 点进行定位预测从而对其功能进行调控.     

提高茶树新梢EGCG含量的无公害诱导物筛选

茶树中含有丰富的多酚类化合物(简称茶多酚),其含量高达鲜叶干物重的20%～35%,其中EGCG(表没食子儿茶素没食子酸酯)所占比例最大,为茶多酚总量的40%左右,其含量高达鲜叶干物重的9%～13%。现今,EGCG不能人工合成,茶树是EGCG的唯一来源。通过提高茶叶中EGCG含量,既可提高茶叶饮料品质,又能大大提高茶叶保健品质。利用无公害高效诱导物诱导提高茶树新梢EGCG含量的研究在国内外尚属新领域,而且对于现有大面积栽培的茶树,通过外源诱导因子的诱导可能是提高EGCG的最快捷途径。本研究以福鼎大白茶、毛蟹、铁观音、本山、福云六号等五个茶…     

白茶的研究进展

本文论述了白茶的研究进展,内容包括白茶的发展史、种植技术、采摘与鲜叶质量、白茶的加工、保健品质研究五个部分,最后提出了白茶未来研究要点.     

寓深意于简明的“矩形原理”，激发学生的学习动力

靠优越家庭背景就业的不公平现象虽然不很普遍,但现实的存在却严重挫伤了不少青年学生学习的积极性.经研究提出"矩形面积理论"(矩形原理):把家庭背景等(客观条件)喻为矩形的"底",把学习成绩等(主观努力)喻为矩形的"高",把矩形面积喻为就业结果(效果).分析了"底"和"高"不同的5种类型的学生就业的现实情况后总结出:在不公平现象还不可能完全避免的今天,"底边"短的人需要加倍努力增加"高",才能弥补"底边"较短而出现的不公平结果;出于用人单位在市场经济中提高自身竞争力的需要,"底边"长的人也必须努力增加"高".     

闽台农业标准化比较研究

简要介绍了台湾和福建农业标准化的发展历程,并从农业标准体系、农产品安全检测和质量认证等方面比较分析了闽台两地农业标准化的现状,最后就如何借鉴台湾农业标准化建设经验,加快推动福建农业标准化进程进行了相关探讨.     

稻草与稻米蛋白质含量的相关与回归(摘要)

“稻草饲料”一直是畜牧学家和营养学家活跃的研究领域,他们以外因的角度作了大量的研究,但是,目前绝大多数稻草仍然是作燃料和肥料,而作饲料的稻草为数还很少。因此,从“内凶”的角度,对“稻草饲料”这一领域进行深入的研究,无疑是很有必要的。稻草中蛋白质含量是“稻草饲料”的重要的营养指标。前人对稻米蛋白质含量研究较多,而对稻草蛋白质含量的研究尚未见到报道,本文就我们的初步研究简报如下:     

金边龙舌兰组织培养技术研究

以金边龙舌兰(Agave americana var. Marginata)植株茎段为外植体,研究不同消毒方式对茎段污染率、褐化率及不同分化培养基与生根培养基对金边龙舌兰丛生芽分化、生根的影响。结果表明,采用0.1%HgCl_2处理10 min对金边龙舌兰植株茎段的消毒灭菌效果相对较好;诱导分化的最佳培养基为MS+6-BA 2.0 mg/L+NAA 0.2 mg/L+KT 1.0 mg/L,金边龙舌兰丛生芽分化率、增殖效率相对最高,分别为80.0%、130.0%;诱导生根的最佳培养基为MS+0.4 mg/L NAA,其生根率相对最高,为100.0%,且长出的根系健壮,数量适中,根长1.5 cm左右。