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旨在预测和分析貉源阿留申病毒(RFAV) VP2和NS1蛋白的抗原表位特征,筛选阿留申病毒属较保守的B、T细胞抗原表位。本研究对RFAV的近全长基因组进行克隆及测序,对其VP2和NS1基因编码蛋白的理化性质、二级结构、翻译后修饰位点和抗原表位进行预测,并将预测的修饰位点、抗原表位与其他阿留申病毒种的序列进行比较分析,筛选相对保守的修饰位点和抗原表位。结果显示,获得的RFAV基因组长4 327 bp,编码VP2蛋白的636个氨基酸,编码NS1蛋白的641个氨基酸。VP2和NS1蛋白均为亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主。在阿留申病毒属内,VP2蛋白有3个保守的B细胞抗原表位,3个保守的T细胞表位,8个保守的翻译后修饰位点;NS1蛋白有1个保守的B细胞抗原表位,2个保守的T细胞抗原表位和7个保守的翻译后修饰位点。本研究成功克隆了RFAV近全长基因组序列,全面对RFAV的VP2、NS1蛋白抗原表位、翻译后修饰位点进行预测,并分析其在阿留申病毒属内的保守和变异特征,为阿留申病毒免疫研究提供参考。 相似文献
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禽流感(Avian influenza,AI)是由禽流感病毒(AIV)所引起禽类的一种急性和高度接触性传染病,几乎所有的野生和家养禽类都可感染。2003年底从亚洲始发并席卷全球的高致病性禽流感疫情中,泰国等国家从多种死亡野鸟体内分离到了H5N1型禽流感病毒。2005年4月,我国青海湖中的近6000只斑头雁等侯鸟发生急性死亡,经病毒分离和鉴定,证实病原体为H5N1亚型禽流感病毒。因此,许多学者认为野生鸟类在传播禽流感病毒过程中扮演了重要角色。吉林省处于亚太地区候鸟迁徙路线上的重要位置,每年有大量的野生鸟类栖息和停留。为了解吉林地区野生鸟类禽流感病毒抗体的动态,2006年3月至2006年7月份对吉林市花鸟市场上的野生鸟类抽样进行血清学检测,为禽流感防控提供科学依据。 相似文献
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本研究参考并分析GENBANK中阿留申病毒、肠炎细小病毒的序列及本实验室测序的两种病毒序列,设计并实验筛选出阿留申病毒诊断引物2对和肠炎细小病毒1对;其中阿留申病毒诊断引物ADV537与肠炎细小病毒引物PAR593组成联合诊断引物。由于2种病毒同属细小病毒属,基因某些区段相似,用于2种病毒的鉴别诊断、阿留申病毒与肠炎细小病毒混合感染的诊断。 相似文献
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根据GenBank上发表的犬瘟热病毒(CDV)核蛋白(N)蛋白基因序列,设计合成了1对寡聚核苷酸引物,提取犬瘟热病毒疫苗株CDV3的RNA为模板,采用RT-PCR扩增病毒的N蛋白基因,并进行产物克隆和序列分析。将CDV3疫苗株N基因与GenBank数据库中的疫苗株Onderstepoort及中国、美国和德国等分离的疫苗株或毒株共14株CDV N基因序列进行同源性分析,发现CDV3 N基因序列与疫苗株Onderstepoort的同源性为97.1%,与其他分离毒株的核苷酸同源性为92.8%~94.0%,其中与中国分离的TN株同源性为93.6%;然而,CDV3 N蛋白与它们的氨基酸同源性却基本都为96.6%~97.3%。这说明虽然犬瘟热弱毒株CDV3在核苷酸水平上与其他疫苗株毒株的差异较大,但是在氨基酸水平上的比较差异较小。 相似文献
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为了鉴别豚鼠气单胞菌M12并研究其致病性,本试验利用管家基因gyrB鉴定菌种,然后采用家兔回肠体外器官培养(IVOC)和腿部肌肉注射两种方式探究该病原菌的致病机制,运用光学显微镜、电子显微镜、扫描电镜等多种手段从微观视角去研究M12的菌体结构、致病过程和感染组织的病理变化。结果显示,M12为两端钝圆的革兰氏阴性短杆菌,在电镜下观察发现该菌除鞭毛外细菌大小为(0.6~1.6)μm×(0.6~0.7)μm,鞭毛长度是菌体长度的2~3倍。该菌与GenBank上豚鼠气单胞菌的相似性高达100.0%。IVOC试验在扫描电镜下观察可以看到M12黏附在肠上皮细胞聚集成团,形成生物膜结构,肠上皮细胞破损;病理切片观察发现M12对家兔肠、肝脏、肺脏、肾脏、肌肉组织都有损伤。本试验结果可为豚鼠气单胞菌致病性的深入研究提供参考依据。 相似文献
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水貂犬瘟热CDV_3疫苗株基因组序列测定及H基因遗传稳定性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
对水貂犬瘟热CDV3疫苗株基因组进行全序列测定与分析,以阐明该疫苗株的来源亲本毒株,基因特征及H基因遗传稳定性。将CDV3疫苗株基因组cDNA分9个重叠片段进行RT-PCR并克隆入pMD 18-T载体中,测定全长cDNA序列。并与CDV野毒参考株和疫苗株N、F和H基因氨基酸序列比对分析其基因变异情况。通过对CDV3疫苗株6个不同生产批次(Vero细胞培养代次)H基因序列测定以分析毒株的分子遗传稳定性。基因序列分析结果表明:CDV3疫苗株基因组全长15 690 bp,与CDV野毒株基因组同源性较低(93.0%~95.3%)。H基因核苷酸和氨基酸序列与Lederle疫苗株(EF418783)同源性最高,分别为99.6%和98.7%。而6个不同培养代次CDV3疫苗株H基因氨基酸序列无任何差异。由此证实CDV3疫苗株的亲本毒株与Lederle疫苗株有着最密切关系,不同培养代次的CDV3疫苗株H基因具有较高的遗传稳定性。 相似文献