番茄DIR基因家族鉴定及其对非生物胁迫响应的分析

【目的】鉴定番茄DIR基因家族所有成员,并对其基因结构、编码蛋白的理化性质、系统进化、染色体定位、共线性、启动子元件、表达模式、互作转录因子及内源竞争RNA预测等进行了解析,为探究DIR在番茄生长发育和逆境胁迫中的作用提供参考。【方法】采用生物信息学方法,基于全基因组数据对番茄DIR基因家族成员进行鉴定,运用Phytozome、MEME、PlantCARE、opsRNATarget和plantcircnet等在线网站获取染色体位置、保守基序、顺式作用元件、存在互作的转录因子、miRNA和circRNA等信息。利用Mapteace、TBtools、Cytoscape、OmicShare等作图软件及工具绘制染色体定位图、进化树、DIR与转录因子关系图、ceRNA网络等。采用NCBI的基因数据库结合转录组测序及qRT-PCR试验研究DIR基因家族在逆境下的表达情况。【结果】共鉴定到番茄中27个DIR基因,将其命名为SlDIR1—SlDIR27,分别位于12条染色体上,且大部分基因位于染色体末端,其基因结构、基序和结构域相对保守,其中22个SlDIR具有一个外显子的经典结构。番茄DIR基因家族同拟南芥的共线性关系远高于水稻和大豆。基于系统进化关系将27个番茄DIR成员分为3个不同的亚家族。转录组数据表明大部分DIR基因在番茄根部具有较高的表达量。此外,DIR基因的启动子区域含有多个与干旱、低温等非生物胁迫,以及MeJA、ABA、SA等激素诱导相关的顺式作用元件,且预测到与激素、生长发育、非生物胁迫相关的ERF、E2F/DP、MYB等互作转录因子。结合转录组数据分析,分别有5、10、10和13个SlDIR在农药、干旱、盐和冷胁迫后显著上调表达,其中,SlDIR23受到以上4种胁迫的诱导表达,而SlDIR8、SlDIR13和SlDIR20特异性响应冷胁迫的诱导,SlDIR17特异性响应盐胁迫。番茄DIR的ceRNA调控表明,miR-156与靶基因SlDIR8可能共同作用调控番茄的逆境胁迫。【结论】共鉴定出番茄DIR家族基因27个,不均匀地分布在12条染色体上,在根部有较高的表达量。SlDIR1、SlDIR13和SlDIR14等具有MeJA、ABA、SA等激素响应元件,其中,SlDIR6仅具有MeJA元件,SlDIR27仅具有SA响应元件。另外,SlDIR2、SlDIR14、SlDIR23等参与干旱、盐、低温等多种逆境胁迫,其中SlDIR23在不同胁迫处理下均可被激活。此外,DIR基因和转录因子、非编码RNA相互作用,共同参与调控番茄植株的逆境胁迫。     

三种方法检测猪O型口蹄疫抗体的比较分析

口蹄疫(FMD)是由小RNA病毒科口蹄疫病毒属的口蹄疫病毒(FMDV)引起的以感染偶蹄动物为主的急性、热性、高度接触性传染病。其传播速度快,往往造成大流行,由于难于防治、补救措施少,对养殖业构成严重威胁,严重影响国内、国际贸易,造成巨大的经济损失。世界动物卫生组织(OIE)将其列为A类动物疫     

深松对土壤物理性质及油用向日葵产量性状的影响

为研究深松措施对耕层土壤特性和油用向日葵产量性状的影响,以油用向日葵T562为供试品种,进行了深松45 cm(S45)、深松30 cm(S30)和浅旋15 cm(RT)3个处理的3次重复的大区对比试验。结果表明:向日葵播种期、初花期、终花期,随土层深度的增加土壤紧实度呈增加趋势,深松能够降低30～40 cm土层土壤紧实度,并以深松45 cm的土壤紧实度降幅最大;深松措施下,40～80 cm土层的含水量高于0～40 cm土层,以S45的含水量最高,S30次之,TR最低。在开花期(初花至终花)的4个土层内(0～20 cm、20～40 cm、40～60 cm、60～80 cm),深松较浅旋土壤体积含水量的相对增加量表现为:S45为15.6%～27.7%,S30为6.8%～13.3%。在同一深松深度下,随着土层的加深,土壤孔隙度呈逐渐减小趋势;在不同深松下,深松土壤孔隙度高于浅旋,差异达到显著水平(P0.05),以S45的土壤孔隙度最大。向日葵单盘粒重、籽仁率、结实率、千粒重、产量等5个产量性状均以S45的最高,S30次之,RT最低;单盘粒重、籽仁率在S45、S30和RT的差异达到显著水平(P0.05);结实率、千粒重、产量表现为S45与RT存在显著差异,S45的产量为5 610.3 kg/hm~2,S30为5 354.0 kg/hm~2,分别较浅旋RT增加了10.8%和5.8%。综上结果,深松措施能够改善土壤硬度、孔隙度,提高土壤水分涵养量和调控产量构成要素,是蒙西向日葵产区高产栽培提供科学依据。     

水产品物理保鲜技术与应用

正中国水产资源丰富,而且水产品种类繁多。水产品具有低脂肪、高蛋白的特点,是合理膳食结构中不可缺少的重要组分,已成为人们摄取动物性蛋白质的重要来源,并且鱼、虾、蟹等水产品肉质鲜美、风味独特,深受广大消费者青睐。随着人们生活水平的不断提高,人们不仅喜爱食用水产品,并对水产品的要求也越来越高,尤其对其鲜度要求是最高的。而且现在鲜活水产品市场发生了     

站立的魂魄

这是一盆比较独特的大型曲立式榕树盆景,它不同于一般大型盆景在多层次上生长着侧枝,以密密匝匝的翠绿来显示其旺盛的生命力。在该植株硕大的基部上,粗细不一的侧根像书法的撇、捺那样,笔道遒劲地挥洒出大大小小的“人”字,支撑着厚实的底部,使其充满了活力,与其生机盎然的顶冠相得益彰。     

柿疯病研究——Ⅳ.国内区域分布

<正> 柿疯病是柿树的一种严重传染性病害,关于该病症状、侵染性及病源微生物已作报道。该病是由难养细菌RLO通过斑衣蜡蝉(Lylorma delicatula White),血斑叶蝉(Erythroneura Mori Mats)以及嫁接为媒介传病.罹病后叶脉变黑,果实畸形,新梢木质部产生黑褐色纵条病变等,罹病严重者不结实,结实者果实早红早落造成严重减产,     

社办初制茶厂知识讲话 第二讲 人民公社怎样建设初制茶厂

社办初制茶厂,应积极贯彻执行“以土为主,土洋结合;以中小型为主,大中小型结合”的方针。按建厂的规模分类,可分为大型的日产干茶40—50担,中型厂日产干茶20—30担,小型厂日产干茶10担左右的初制茶厂。大中型茶厂一般可配备洋土结合的机器。小型厂以自制木质和铁木结构的机器为主。按制茶的种类,可分为红茶厂,炒青眉茶厂,炒青圆茶厂,扁茶厂,和烘青厂。不论规模大小,生产那一种茶类,在建厂的方法和步骤上大致总是一样的。为了