凡纳滨对虾收获体质量大规模家系选择效果的计算机模拟分析

为进一步补充凡纳滨对虾核心育种群收获体质量的遗传进展工作,设计了包括10个家系数量梯度(100~1 000)和11个家系内测试个体数梯度(100~5 000)的育种方案,利用计算机模拟技术,执行家系间(留种50%家系)和家系内选择(留种1雄、2雌),连续选择19次,比较核心育种群与扩繁群收获体质量育种值和群体近交系数的变化,为进一步优化大规模家系选育提供基础参数。结果显示,与对照方案(家系数量100个、家系内测试个体数100个、体质量遗传力0.35)相比,增加参与测试的家系内个体数,选择强度不断提高,核心育种群收获体质量育种值均值增加了48%(62.75~92.87 g),但增加幅度在不断降低(100~2 500:40.60%;2 500~5 000:7.40%);核心育种群收获体质量育种值标准差降低了2.90%(1.38~1.34 g)。受限于选择强度,随着家系数量的扩大,核心育种群收获体质量育种值仅增加了1.88%(62.75~63.93 g),育种值标准差增加了4.35%。扩繁群收获体质量育种值随家系规模变化的趋势同核心育种群,但在家系水平上的提高幅度更大(63.63~65.48 g,2.91%)。随着家系数量的增加,核心育种群的近交系数降低了90.32%(0.093~0.009),下降幅度不断减少(100~500:79.57%;500~1 000:10.75%);家系数量为200个的育种群体,连续选择19次后,每代平均近交率为0.25%。增加参与测试的家系内个体数,不影响核心育种群的近交水平。研究表明,扩大家系内测试个体数,可以进一步提高核心育种群与扩繁群收获体质量的遗传进展。     

烤烟新品种南江3号的特征特性研究

贵州省是种烟历史长、种烟面积广、品种更迭较快的烤烟大省,独特的海拔立体气候为外引品种变异提供了良好条件。南江3号就是贵州省贵阳市开阳县在红花大金元品种中发现的自然变异株,该品种农艺性状叶片形态特性与红花大金元相似,遗传性状稳定,田间生长整齐一致,在株高、叶片数、叶色、烟叶烘烤特性等性状上与原品种红花大金元有明显差异,单株有效叶数较多,叶片较大,叶色浓绿,生长势较强,叶片分层落黄,易烘烤;经贵州省烟草科学研究所抗性鉴定和多年田间自然发病调查结果表明,该品种中抗黑胫病和青枯病,感烟草花叶病,气候斑点病轻,抗叶斑类病害的能力优于对照;主要经济性状产量、产值和上等烟率显著高于对照;初烤烟叶外观质量总体略好于对照,主要化学成分含量适宜;比例较协调;感官品质与对照K 326相当。     

凡纳滨对虾育种基础群体收获体重的未知亲本组效应分析

由于凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)属国外引进种,国内引进群体间(内)的亲缘关系及其遗传背景不清楚.为分析凡纳滨对虾基础群体中这些未知亲本组(unknown parent group,UPG)的效应,本研究收集生长速度和养殖存活率差异较大的3个凡纳滨对虾群体作为奠基者群体,通过双列杂交方法构建育种...     

我国南美白对虾种业发展现状及对策建议

为评估基因型鉴定芯片在育种群体构建中的应用价值,实验对凡纳滨对虾3个群体 (EE、PP和SS)进行急性肝胰腺坏死病 (AHPND)副溶血弧菌 (Vp_AHPND)侵染实验,利用自主研发的40K SNP液相芯片“黄海芯1号”获得146尾个体的基因型信息,对群体遗传背景进行了系统调查并估算了AHPND抗性遗传力。Vp_AHPND浸染实验结果显示,不同群体间存在抗病差异,PP群体的存活性能比EE和SS群体分别高出12.9%和11.6%。利用质控后的38148个SNP信息构建系统进化树,结果显示群体内同一个家系的个体首先聚在一起,进而同属一个群体的多个家系聚在一起。主成分和遗传结构分析显示,可以准确地将146尾个体划分为3个组,与系统进化树聚类结果一致。遗传多样性分析显示,3个群体的观测杂合度 (H_o)平均值为0.25~0.29,多态信息含量 (PIC)平均值为0.20~0.23,上述遗传参数达到极显著水平。3个群体间的遗传分化系数 (F_ST)为0.11~0.21,存在中高度遗传分化。基因组近交分析表明,EE、PP和SS群体的近交系数均值分别为−0.05±0.06、0.20±0.09和0.37±0.07,后2个群体内部分个体表现出较高的近交水平。使用ssGBLUP-MF (Single Step Genomic BLUP with Metafounders)模型,复合基因型、表型和系谱信息,获得Vp_AHPND侵染后存活状态的遗传力估计值为0.24±0.07,表现为中等水平,表明基础群体具有较好的选育潜力。研究表明,利用液相芯片“黄海芯1号”开展辅助育种,可以进一步提高基础群体构建和评估的效率。     

世界重要养殖品种——南美白对虾生物学简介

为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响,本实验对26个全同胞家系进行Vp_AHPND侵染,收集686尾个体的存活时间数据,对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号” (55.0 K SNP)进行基因分型,基于A、G和H亲缘关系矩阵估计Vp_AHPND侵染后存活时间的遗传参数;采用随机和等距抽取方式,基于55.0 K SNP构建了8个低密度SNP面板 (40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.1 K),利用GBLUP和ssGBLUP等方法预测Vp_AHPND侵染后存活时间的基因组育种值,利用交叉验证方法计算其预测准确性,并与BLUP方法进行对比分析。遗传参数估计结果显示,Vp_AHPND侵染后存活时间表现为高遗传力水平,估计值为0.68~0.79。在55.0 K SNP密度下,针对242尾基因分型个体数据集 (G242),利用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.424、0.450和0.452,GBLUP和ssGBLUP比BLUP分别提升了6.13%和6.60%;针对686尾表型测定个体数据集 (P686),利用BLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.510和0.535,后者比前者提升了4.90%。对于8个低密度SNP面板,当SNP密度≥10.0 K时,基因组预测准确性变化幅度在G242和P686数据集中均较小 (1.1%~1.8%);随着SNP密度自10.0 K不断降低,基因组预测准确性在2个数据集中也不断降低,其中5.0 K密度降幅为0.6%~2.6%、1.0 K密度降幅为5.8%~11.0%、0.5 K密度降幅为11.4%~17.2%、0.1 K密度降幅为38.8%~41.6%。10.0 K与55.0 K SNP密度间基因组亲缘系数、GEBV的相关系数均高于0.99,表明利用10.0 K SNP面板可以准确地预测同胞个体间的亲缘关系及其GEBV。研究表明,使用10.0 K SNP面板对Vp_AHPND侵染后存活时间进行基因组遗传评估可以得到与55.0 K SNP芯片近似的预测准确性,为低密度SNP分型芯片设计提供了参考。     

不同时期施用沼渣追肥对花生农艺性状和产量的影响

为探索不同时期施用沼渣追肥对花生农艺性状和产量的影响,采用田间试验和室内分析相结合的方法,以不施追肥为空白对照和在5月28日施用225 kg/hm2花生专用复合肥追肥为常规对照,设置在5月28日、6月18日和6月28日3个不同时期施用沼渣追肥的对比试验.结果表明:花生在新垦山地进行春种时,各处理的综合效果从强到弱的顺序...     

不同施氮水平对特色烟叶品质和产量的影响

为提高烤烟的品质、产量,并改善烤烟的香气味类型,为优质烤烟生产提供科学依据,进行了不同施氮水平(6.2kg/667m2,5.2kg/667m2,4.0kg/667m2)对特色烟叶品质和产量的影响试验。结果表明,施氮6.2kg/667m2,按照基肥和追肥6∶4的比例进行施肥,生产的特色烟叶香气质、香气量、吃味均较好,杂气和刺激性小,品质最佳,其产量、产值、上中等烟比例也高于5.2kg/667m2和4.0kg/667m2的处理。     

“冠祥”肥中宝在烤烟生产中应用效果初报

在贵州5个不同生态区，采用大区对比试验表明：配施“冠祥”肥中宝对烤烟各个生育期影响差异不大，同一试验点和对照生育期相同；但配施“冠祥”肥中宝处理较对照5个试点平均产量略有降低，但产值、均价和上等烟率均较对照高；施用“冠祥”肥中宝对烤烟内在化学品质影响差异不大；5试点试验表明，配施“冠祥”肥中宝可改善烟叶外观质量，提高烟叶产值。     

不同起垄栽培方式对烤烟生长及效益的影响

通过对高垄+覆膜、高垄+不覆膜、高垄+覆盖秸秆、常规垄+覆膜等4种烟草栽培方式的大区比较试验,结果表明:通过株高、茎围、最大叶面积大小等各农艺性状比较,团棵期前高垄比常规垄生长发育慢,但整个营养生长期高垄比常规垄长,高垄延长了烤烟营养生长期,且缩短了生殖生长期;通过产量、均价、中上等烟率及产值的比较,产量、均价、中上等烟率及产值均以高垄+覆膜＞高垄+不覆膜＞高垄+覆盖秸秆＞常规垄+覆膜,且各处理间存在显著或极显著差异.     

凡纳滨对虾6个国内群体的遗传背景分析

本研究选取了来自国内6个不同育苗场的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体,对8个SSR位点的基因型信息进行分析。结果显示,观察等位基因数(Na)平均值为3.67~9.33,有效等位基因数(Ne)平均值为2.20~5.67,观察杂合度(Ho)平均值为0.12~0.71,期望杂合度(He)平均值为0.41~0.81,多态性信息含量(PIC)平均值为0.36~0.76。聚类分析结果显示,来自于同一个育苗场的对虾聚在一个分支。不同品牌来源的对虾分别聚在几个不同分支。6个群体间的遗传一致度为0.4229~0.8265,遗传距离为0.1905~0.8607。遗传分化系数(FST)是0.1837,群体内近交系数(FIS)是0.2514,Ho相似文献