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61.
带属绦虫线粒体基因组全序列生物信息学分析 总被引:2,自引:0,他引:2
通过利用生物生物信息学方法分析带属绦虫线粒体DNA(mtDNA)碱基组成、基因结构、密码子利用、基因变异及其在分子系统进化研究中的应用价值等,以期为带属虫种线粒体功能基因组学研究、分子分类学研究及其疾病诊断提供重要依据。从NCBI GenBank中下载已测序的6种带属绦虫线粒体基因组(mt genome)全序列,以细粒棘球绦虫mtDNA序列作为参考序列(外群),用ClustalX软件(1.83)(http://www2.ebi.ac.uk/clustal w/)进行多重序列比对,用DNAStar软件进行序列差异性分析,用MEGA4软件的邻接法(Neighbor-joining method)构建进化树,核苷酸进化距离算法用最大似然法(Maxi mumlikelihood method),氨基酸进化距离算法用泊松校正法(Poissoncorrection method),进化树检验用自展法(Bootstrap test)。tRNA和2个非编码区RNA二级结构预测分别使用软件ARWEN和RNAstructure Version 4.6。结果显示,带属绦虫mtDNA为双链闭环分子,为13.3~13.7 kb;4种碱基成分中,T含量最高(超过47%),C含量最低(低于9%);共有36个按照相同顺序排列的编码基因,其中蛋白质编码基因有12个,tRNA编码基因有22个(其中编码丝氨酸-tRNA和亮氨酸-tRNA的基因有2个,其余18种tRNA分子各有1个),rRNA编码基因有2个(包括1个大亚基和1个小亚基)。基因组结构紧凑,基因间存在重叠区域,如nad4L和nad4基因;除广泛使用ATG作为起始密码子编码蛋氨酸,部分基因如多头绦虫nad6基因用GTG作为蛋白质翻译的起始密码子。线粒体tRNA长度为58~76 nt,二级结构多数呈典型的三叶草结构,少数呈D-loop结构;2个线粒体rRNA亚基基因rrnL和rrnS被trnC基因分隔开;线粒体基因组有2个大的非编码区,1个长非编码区(LNR)和1个短非编码区(SNR);线粒体基因组中蛋白编码基因之间的差异为5.7%~28.9%,其中cox1和nad4L基因比较保守,而nad5和nad6则变异较大,进化较快。结果表明,根据线粒体基因组序列绘制的带属绦虫分子进化树表明,亚洲带绦虫(T.asiatica)和牛带绦虫(T.saginata)间的亲缘关系最近,成为姊妹种,而多头绦虫(T.multiceps)与前两者的亲缘关系比猪带绦虫(T.solium)与前两者的关系更近,但与虫种的生物学特征存在一定差异。 相似文献
62.
切忠叶海 《畜牧兽医科技信息》2009,(10):58-58
仔猪腹泻是哺乳仔猪最为常见的多发病。其发病原因复杂,常造成仔猪死亡或形成僵猪,严重影响猪场效益。该病一般发生在仔猪的三个年龄段:出生后1~3日龄、7~14日龄和刚断奶后的仔猪。不同阶段发生的腹泻各不相同,现介绍如下: 相似文献
63.
为比较2、35日龄滩羊皮肤毛囊的发育特点与血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)和血管内皮生长因子受体2(vascular endothelial growth factor receptor 2,VEGFR2)的分布特征,探究出生后滩羊被毛生长发育的变化特点,试验应用常规HE染色及改良Masson胶原纤维染色、Gomori银氨法染色、磷钨酸染色等特殊染色观察2与35日龄滩羊皮肤组织结构特点;应用免疫组织化学法结合免疫荧光染色法观察VEGF及VEGFR2在2与35日龄滩羊皮肤组织中的分布定位,并用IPP图像分析软件进行定量分析。结果显示:与2日龄滩羊皮肤组织比较,35日龄滩羊表皮与真皮间界限更加清晰,毛囊结构发育完整;毛囊密度显著降低(P<0.05);胶原纤维与弹性纤维含量增加,形成网格状分布。免疫组化及免疫荧光结果显示,VEGF及VEGFR2在滩羊皮肤表皮及毛囊外根鞘、皮脂腺上均有表达。统计表明,VEGF及VEGFR2在2日龄滩羊皮肤组织中的表达量均显著高于35日龄(P<0.05)。综合上述结果,滩羊毛囊发育过程中,胶原纤维和弹性纤维增加明显;VEGF与VEGFR2通路在毛囊角质形成中起直接调节作用。 相似文献
64.
仔猪黄白痢是由致病性大肠杆菌引起的传染病。根据我县一个规模种猪场的统计,1997年1月至1998年5月,在死亡仔猪中,因黄白痢引起死亡的占52%,1998年6月份开始对这个种猪场采取综合防治措施,到1998年底,共产仔猪3650头,28~30日龄断奶,成活仔猪3372头,成活率达9238%,黄白痢发病率为28%,因黄白痢而死亡的仔猪基本没有发生,成活率比以前有了明显提高,现将综合防治措施报告如下:1 生产母猪的管理和预防接种 生产母猪应加强饲养管理,保证母猪膘情适宜。母猪分娩后立即肌肉注射青霉… 相似文献
65.
不同添加剂对晴隆白刺花青贮品质和营养价值的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
试验通过添加不同种类的青贮剂研究其对晴隆白刺花青贮品质和营养价值的影响.试验设直接青贮、添加乳酸菌(1%FM)、纤维素酶(0.1%FM)、乳酸菌+纤维素酶(1% FM +0.1% FM)、甲酸(6 mL/kg FM)、蔗糖(3%FM)及乳酸菌(1%FM)+纤维素酶(0.1%FM)+乳酸菌(1%FM)+纤维素酶(0.1%FM)+甲酸(6 mL/kg FM)+蔗糖(3% FM)7个处理.试验结果表明:青贮过程中pH值总体呈下降趋势,添加剂处理显著低于直接青贮,其中蔗糖的效果最为明显(pH值3.97),乳酸菌+纤维素酶+甲酸+蔗糖处理也低(pH值4.04),品质较好;直接青贮的pH值相对较高(4.73);青贮后晴隆白刺花的粗蛋白(CP)略有下降,乳酸菌+纤维素酶+甲酸+蔗糖降幅最大,达11.18%,但CP含量仍较高,为15.41%,其他各处理CP均有所上升;单独青贮,晴隆白刺花的酸性洗涤纤维(ADF)虽略有增加,但粗纤维(CF)和中性洗涤纤维(NDF)均下降,且NDF降幅较大,达20.15%,而粗脂肪(EE)、无氮浸出物(NFE)含量相对增加,改善了晴隆白刺花的营养;各处理单宁含量均有所下降,其中甲酸处理的降幅最大,达47.83%,乳酸菌+纤维素酶处理降幅相对较小. 相似文献
66.
67.
68.
69.
下痢是哺乳期犊牛常发生的一种胃肠道疾病。赤峰地区乳用犊牛发生较多,给养牛户造成了一定的经济损失。在生产实践中,采取中西医结合的方法对该病进行治疗,效果良好。通过改善饲养管理,可有效地预防该病的发生。1病因分析1.1犊牛的饲养管理方法不当如犊牛出生后用盆或桶喂奶,让犊牛随意自饮,导致食管沟闭合不全,使一部分乳汁进入瘤胃和网胃。而这时的瘤胃和网胃还不能正常地排除其中的内容物,乳汁在这些部位长期停留并发酵,造成下痢;喂奶不能定码:B0058-01时、定量;奶温过高或过低;补饲精料过多或过早,造成犊牛消化不良而下痢;犊牛吃患乳房… 相似文献
70.
犬科动物作为棘球绦虫的重要终末宿主,在棘球蚴病的传播和流行中扮演非常重要的角色。感染了棘球绦虫的犬科动物,其排出的粪便含有大量孕卵节片或虫卵,从而导致棘球蚴病的传播。因此,流行区终末宿主棘球绦虫感染情况的检测是棘球蚴病防控的重要环节之一,对该病的防控具有重要意义。近年来,传统的病原学检查技术逐渐被免疫学及分子生物学等技术替代,主要有粪抗原ELISA法和粪DNA检测法(PCR、实时荧光PCR、LAMP等)。论文对不同的粪抗原和粪DNA检测方法做一综述,为棘球绦虫终末宿主检测方法的选择提供参考。 相似文献