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以通量为2200个独立基因的cDNA阵列,对水稻孕穗期、灌浆期基因表达谱进行了检测,目的是通过群体水平平行、定量地分析以孕穗期为参照的灌浆期表达基因.通过用ratio(R)值对所有阳性信号进行归类分析,结果显示:大部分基因(694个,占47.5%)呈持家状态,即:无强烈组织特异性表达 (0.5〈R〈2);少部分基因(350个,占24.0%)呈特异性高丰度表达(R≥3),参与种子淀粉、蛋白质、脂肪等贮藏物的积累过程并具时序表达特征.一些种子贮藏物相关基因,如蔗糖合酶、淀粉合酶、Wx蛋白、淀粉分支酶、淀粉脱支酶、谷酰胺合成酶GS1、蛋白酶抑制剂基因、泛素蛋白基因、3-酮脂酰载体蛋白合酶iii和硬脂酰-ACP脱饱和酶,可能对稻米品质、口感、营养价值和风味形成起重要作用.一些可能与种子耐力和发芽力有关的基因,如甲酸脱氢酶、类抑制因子蛋白、萌发样蛋白(germin-like protein)、GA调节蛋白和α-淀粉酶基因等也同时被检出. 相似文献
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差异显示法克隆水稻抗白叶枯病相关蛋白激酶基因 总被引:6,自引:0,他引:6
利用已知植物的蛋白激酶及抗病基因氨基酸序列,设计含激酶保守功能域的简并引物,运用mRNA差异显示技术显示经病原菌诱导的抗性品系及感病品系愈伤组织mRNA表达差异,并对差异片段分子克隆。 相似文献
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在前期大规模水稻(Oryza sativa)EST测序和生物信息学分析的工作中,发现一些在茎cDNA文库中高水平表达基因,包括叶绿素a/b结合蛋白(T007D10)、富脯氨酸蛋白(S037D04)、脱落酸和逆境诱导蛋白(S057803)、微管蛋白(S060D11)等基因。为验证这些基因是否为茎特异性表达基因,选择高冗余度的EST克隆制备cDNA探针,与高通量的RNA阵列进行杂交。结果表明:叶绿素a/b结合蛋白基因在叶中高丰度表达且受光诱导,是一个光合作用相关基因,而不是茎特异性基因;微管蛋白基因在茎和根中都具有较高的表达丰度,说明根的纤维化和茎的木质化是同一生化过程;脱落酸和逆境诱导蛋白基因虽然在茎中高表达,但其丰度容易受环境条件(如营养缺乏、逆境等)的影响,而不是在茎中以组成型方式稳定表达,不能被称为茎特异性表达基因。这些结果提示出在一个EST数据库中高冗余度的基因并不能完全代表该文库的特征,也不能单纯通过EST分析技术认定它们是组织特异性表达基因,需要进一步的确认。通过在不同发育阶段、不同生理状态及不同逆境状态下获得全局性的表达谱特征,才能较客观地评价一个基因是否为组织特异性表达基因。 相似文献
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以含有2200个独立水稻转录本的膜质cDNA微阵列鉴别萌发期水稻(Oryza sativa L.)幼苗的空间特异表达基因。经比较表达谱,得到了在胚芽、胚轴和胚根中特异表达的基因分别为31、36和73个。其中,胚轴特异表达基因包括聚泛蛋白、UDP-葡萄糖焦磷酸酶、蔗糖合酶、磷酸甘油酸激酶等参与糖、蛋白质代谢反应的蛋白,意味着在萌发期水稻幼苗中,胚乳贮藏淀粉和贮藏蛋白的降解反应主要发生在胚轴部。实验检测到的胚芽和胚根特异表达基因包括一些具有防御功能的基因及多个参与复制、转录和翻译过程的基因,如胚芽特异表达的基因中,翻译起始因子5a、40s核糖体蛋白s28及核糖体蛋白136与蛋白合成有关;而过敏性蛋白、β-D-葡聚糖外水解酶和肌动蛋白-11等为抗病相关基因。胚根特异表达的基因中,肽链延伸因子1-α、TATA盒结合蛋白、DNA复制蛋白A2、组蛋白和两种核糖体蛋白等与复制、转录和翻译有关;而富含甘氨酸蛋白、创伤诱导性碱性蛋白、Bowman-Birk蛋白酶抑制因子、脂类转运蛋白-2等基因则与幼苗的防卫反应有关。通过分析这些空间特异表达基因,揭示出一些潜在的生物学规律,为研究萌发生理学提供了有价值的信息。 相似文献
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