侵染甜椒的番茄黄化曲叶病毒的分子鉴定和全序列分析

<正>番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)在世界范围内可危害多种作物,造成植株矮化、叶片皱缩变形、局部黄化等症状。该病毒自1964年首次报道以来已蔓延至世界多地。在我国2006年上海首次报道该病毒[1],随后江苏、山东、安徽、北京、河北、天津等地相继报道,危害严重。TYLCV为双生病毒科(Geminiviridae)菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)成员,基因组为单组     

加强果树规范化采样和病毒检测,降低潜隐和危险性病毒对我国苹果产业的危害风险

苹果病毒病在世界各苹果产区广泛发生,危害严重,目前没有有效的防治药剂。苹果病毒具有潜隐危害、主要以嫁接方式传播的特点。危险性高的类病毒侵染导致苹果果实几乎失去经济价值。苹果病毒的检测是防止其传播和危害,繁育无病毒苗木和苹果树无毒化管理的一项关键技术。由于对病毒在苹果树体中的组织分布和浓度认知不到位,苹果病毒检测中存在样品采集和检测方法的误区。本文根据课题组十年来开展苹果病毒检测和研究工作的数据,简要概述了我国苹果病毒的发生危害特点,苹果病毒检测方法,详细给出了规范的样品采集、处理、总RNA提取、RT-PCR参数、检测引物、对照设置及检测结果判别的技术方法。     

林业微生物菌种资源数据库查询系统构建

以林业微生物菌种信息为研究对象 ,采用计算机网络和数据库技术 ,构建了基于Web的林业微生物菌种资源数据库查询系统。系统具有适用性强、用户交互性好和使用方便等特点 ,不仅能为普通用户提供翔实的菌种信息 ,而且实现了菌种信息的动态管理 ,提高了工作效率 ,具有较高的实用价值。     

马铃薯Y病毒属病毒HC-Pro研究进展

马铃薯Y病毒属病毒HC-Pro是一种多功能的蛋白,参与病毒多聚蛋白的酶切加工、病毒的蚜传、病毒在细胞间和长距离移动、影响病毒的复制、毒性和症状表达,并可抑制植物的基因沉默机制。本文介绍了这几个方面的研究进展,并讨论了HC-Pro策略的意义。     

长春花花叶病病原物的分离和鉴定

长春花病原物采白海南省琼海市博鳌镇和广东省广州市星海公园,症状表现为系统花叶与畸形,对其进行染病外植体组织培养、鉴别寄主反应、传播方式鉴定、病毒粒体形态观察和血清学反应及病叶双链RNA(dsRNA)分析.引起长春花花叶病的病原物鉴定为黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV),克隆该病毒分离物外壳蛋白基因核苷酸序列,并对该核苷酸序列进行生物信息学分析,结果显示侵染我国长春花引起长春花花叶和畸形的CMV分离物应初步划归在CMV IB亚组.     

玉米矮花叶病毒原北京分离物的分子鉴定

玉米矮花叶病自1968年在河南新乡等地发生以来，在全国各玉米产区相继有不同程度的发生。该病近年在华北各地流行，导致玉米大面积减产、品质降低，造成了严重的经济损失。近20年有关病原生物学及血清学的研究结果表明，我国至少存在着3种相关的病原可导致玉米矮花叶病：玉米矮花叶病毒（MDMV）B株系（MDMV-B），MDMV-G（或白草花叶病毒）以及甘蔗花叶病毒（SCMV）。它们均属于马铃属Y病毒属（Potyvirus）中侵染禾本科植物的甘蔗花叶病毒亚组（SCMV Subgroup）。虽然MDMV-B并不侵染甘蔗，但是由于其外壳蛋白基因的核苷酸序列与SCMV的同源性高于MDMV的其它株系，已被重新归类为SCMV-MDB株系。为了明确我国曾鉴定为MDMV-B的玉米矮花叶病毒原的分类地位及其分子生物学特征，以利于探索针对该病毒的有效控制措施，测定其基因组RNA全序列是很必要的。     

烟草花叶病毒丁香分离物的分离与鉴定

 从表现花叶症状的丁香病株上获得一病毒分离物,其在电镜下为约300 nm×18nm的杆状粒子;电泳分析表明感病组织中ds RNA大约为6.4kbp,而其外壳蛋白分子量约为17.6k Da。以上实验结果初步将该病毒分离物鉴定为烟草花叶病毒属(Tobamovirus)。根据该属病毒复制酶基因序列设计通用引物,进行RT-PCR检测,扩增出约1000 bp的预期特异片段(Gen Bank AY566703)。将PCR产物克隆后测序,序列分析表明,与从蚕豆中分离的TMV-B株系序列(Gen Bank AJ011933.1)同源性为99.90%。根据烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)的RNA CP基因序列设计引物,进行RT-PCR,扩增出约800 bp的预期特异片段(Gen Bank AY56672),序列分析表明,与TMV-B株系序列(Gen Bank AJ011933.1)同源性达99%,上述实验结果表明,该病毒分离物为TMV。由于该分离物与TMV-B在指示植物上的症状存在明显差异,所以,作者把该分离物暂命名为TMV-S。     

玉米矮花叶病毒北京分离物复制酶基因的克隆及序列分析

 以MDMV北京分离物RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增了含复制酶(NIb)基因的DNA片段,将其克隆到p UC18载体上并进行序列分析。结果表明:NIb基因由1563个碱基组成,编码521个氨基酸并含有高度保守基序GDD。NIa/NIb和NIb/CP交界处的蛋白酶切割位点分别为Q/C和Q/S-NIb基因(北京分离物)在碱基数目上与保加利亚分离物完全一致,二者的核苷酸及氨基酸序列同源性分别为70.6%和76.6%,而与SCMV-SC的核苷酸及氨基酸序列同源性则高达81.3%和92.1%。     

引起玉米粗缩病的水稻黑条矮缩病毒山东分离物的分子特性

 Four isolates of Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV) were collected from the maize plants showing rough dwarf symptom in Linyi and Tai'an,Shandong province.The S10 genomic sequences of these isolates were determined and compared with those of 14 other RBSDV isolates.All of the four sequences were 1 801 base pairs (bp) long including the 5'-UTR of 21 bp and the 3'-UTR of 103 bp.They all contained an open reading frame of 1 677 bp (22-1698),encoding the coat protein (CP) of 558 amino acids.The sequences of these four RBSDV isolates and those of the major cp gene of 14 other isolates available in the GenBank were divided into two groups in the phylogenetic tree.Recombination analysis indicated that the isolate Lym2 was likely a recombinant of isolates Lym1 and Zhjs.