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水牛DGAT1基因第8外显子群体遗传特征分析 总被引:1,自引:0,他引:1
为了阐明河流型和沼泽型水牛DGAT1基因的第8外显子的群体遗传差异和特征,采用PCR-SSCP和PCR产物直接测序技术对11个水牛群体402份样品进行了群体变异检测,并结合GenBank数据库上已发表的牛科物种DGAT1基因序列进行了比较分析。结果显示,河流型和沼泽型水牛DGAT1基因第8外显子序列一致,序列全长为75 bp;与普通奶牛序列相比,河流型和沼泽型水牛DGAT1基因第8外显子都为K等位基因,揭示其与水牛的高乳脂率、低泌乳量有关。序列比对发现K等位基因在牛科物种中普遍存在。本研究结果揭示了水牛中DGAT1基因第8外显子的遗传特征,可为其奶用性状选育利用提供遗传背景资料。 相似文献
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采用PCR产物直接测序技术对重庆地区117群东方蜜蜂样品的线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)420 bp长度序列进行了分析。结果显示:在所得到的序列中共检测到11个核苷酸多态位点,其中单一变异位点2个,简约信息位点9个,序列突变率为2.62%,序列T,C,A,G平均含量分别为44%,14.2%,32.9%,8.9%,共定义8种单倍型,单倍型多样度为0.773±0.021,核苷酸多样度为0.003 82±0.000 32,单倍型网络关系图揭示重庆地区东方蜜蜂群体没有明显的遗传分化。 相似文献
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【目的】ACVR1作为一些TGF-β超家族成员信号通路的I型受体之一,在器官形成和细胞分化及卵泡形成等调控事件中扮演重要角色。迄今,有关ACVR1基因的研究主要集中在人上,有关水牛ACVR1基因的研究尚未见报道。【方法】采用RT-PCR测序法对槟榔江水牛ACVR1基因的编码区序列进行了分离鉴定,进一步对之进行了功能生物信息学和表达谱分析。【结果】水牛ACVR1基因编码区全长1 530 bp,编码1个由509个氨基酸残基构成的多肽。水牛ACVR1为弱亲水性蛋白,含有1个信号肽和跨膜区,定位在质膜上;该蛋白含有Activin_recp、TGF_beta_GS和STKc_ACVR1_ALK1三个保守结构域,其二级结构、三维结构与人的ACVR1极为相似。水牛的ACVR1与普通牛、野牦牛、人和猪等8个物种的ACVR1氨基酸序列间一致性99%。在所检测的水牛9个组织中,ACVR1基因在肝脏、脾脏、肾、瘤胃、卵巢、子宫和睾丸中均表达,其中在卵巢和子宫中表达水平最高。【结论】水牛的ACVR1与其他物种的ACVR1具有相近的氨基酸组成和结构特征,其作为BMP、AMH信号通路的I型共享受体,可能参与了水牛的细胞分化及卵泡形成等调控事件。 相似文献
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74种鸟类线粒体基因组碱基组成及特征分析 总被引:3,自引:0,他引:3
在鸟类线粒体基因组中,不同物种的线粒体碱基组成和特性存在明显的差异。截至2008年5月,GenBank细胞器基因组资源数据库共公布了74种鸟类线粒体全基因组数据。本研究利用已公布的鸟类线粒体基因组全序列分析其碱基组成特征。结果表明:(1)鸟类线粒体基因组密码子第二位的GC含量值波动范围十分狭窄,而密码子第三位的GC含量值波动范围很大。(2) 密码子第三位碱基中C的含量波动范围较大,为32.60%-50.70%。(3)线粒体基因组GC含量主要由密码子第三位的碱基C和T的变化引起。(4)密码子第三位碱基的GC含量与线粒体基因组的GC含量的变化存在相关性。这些结果,为今后鸟类线粒体基因组的深入研究提供借鉴和参考资料。 相似文献
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本文采用 SDS-PAGE对 56头云南德宏水牛和 47头中国荷斯坦牛的乳上皮粘蛋白 MUC1进行了基因分型。结果表明:德宏水牛乳和荷斯坦牛乳中的 MUC1均呈现多态性。德宏水牛乳中共发现 3种分子量分别为208,185,168kD的电泳谱带,命名为 A,B和 C等位基因;荷斯坦牛乳中共发现 5种分子量分别为 196,191,188,176,159kD的电泳谱带,命名为 D,E,F,G和 H等位基因。德宏水牛乳 MUC1基因座 A,B,C3个等位基因频率分别为0.2232,0.3304和0.4464,群体期望杂合度为0.6475;荷斯坦牛乳 MUC1基因座 D,E,F,G,H5个等位基因频率分别为0.4681,0.0106,0.2128,0.2553和0.0532,群体期望杂合度为0.6747。结果揭示德宏水牛乳 MUC1蛋白与荷斯坦牛乳 MUC1蛋白遗传组成存在显著差异,该座位遗传多态性较丰富。 相似文献
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槟榔江水牛是近年在云南西部发现的中国第一个本土河流型水牛群体,具有较高种用价值,但其重要遗传背景信息还不清楚。本文采用 PCR产物直接测序法对 86头槟榔江水牛 mtDNAD-Loop序列进行了突变检测,并以 GenBank上已发表的 70条河流型和 112条沼泽型水牛 mtDNAD Loop序列为对照,对所得数据进行群体遗传和系统发育分析。结果在槟榔江水牛中检测到 33种单倍型,112个多态位点。其中单一变异位点 14个,简约信息位点 98个。槟榔江水牛 mtDNAD Loop序列 T,C,A,G的平均含量分别为 28.43%,24.82%,31.96%,14.79%,单倍型多样度为 (0.948±0.012),核苷酸多样度为 (0.0381±0.0016),序列间平均核苷酸差异数为33.288,群体内平均遗传距离为 (0.043±0.005)。系统发育、中介网络图和群体遗传关系分析表明,槟榔江水牛含有两个差异显著的母系世系组分,其中一个为河流型世系,在群体中占 61.63%;另一个为沼泽型世系,在群体中占3837%,而其沼泽型世系可进一步分为 A,B,C3个支系,其中,C为在水牛中新发现的支系,其频率极低。结果揭示了槟榔江水牛群体遗传多样性丰富,但该群体存在一定的沼泽型水牛基因渗入。 相似文献
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对云南德宏水牛乳和荷斯坦牛乳中淀粉酶、N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶、γ-谷氨酰胺转移酶、碱性磷酸酶以及乳过氧化物酶的活性进行测定。结果表明,云南德宏水牛乳中淀粉酶活性极显著高于荷斯坦奶牛乳(P<0.01),γ-谷氨酰胺转移酶、N-乙酰-β-D-葡萄糖苷酶活性显著高于荷斯坦牛乳(P<0.05),荷斯坦牛乳中碱性磷酸酶活性显著高于水牛乳(P<0.05);德宏水牛乳与荷斯坦牛乳中乳过氧化物酶活性无显著性差异(P>0.05)。 相似文献
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二酰甘油酰基转移酶1(DGAT1)在乳脂合成过程中发挥重要作用,但水牛DGAT1基因第17外显子遗传多态性及其与产奶性状的关联性还不清楚。本文采用PCR-SSCP结合DNA测序方法对48头德宏水牛和93头产奶杂交水牛(F1: 摩拉水牛×德宏水牛)的第17外显子进行了多态性检测并结合乳成分数据进行了关联分析。在水牛DGAT1基因第17外显子发现1个SNP位点,即c.1350C>G,其为同义替换。该SNP位点在德宏乳用和非乳用水牛中群体遗传组成相近,且不同基因型个体间的乳糖率、乳脂率及乳蛋白率无显著差异(P>0.05)。表明该SNP对水牛乳糖率、乳脂率及乳蛋白率等无显著影响。序列比对显示,水牛、普通牛、瘤牛、山羊和绵羊DGAT1基因第17外显子间仅存在1个编码氨基酸差异,揭示其具有较高的保守性。 相似文献
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