MALDI-TOF质谱技术鉴定植物病原体研究进展

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术具有快速和高通量特点,适合分析微量蛋白质、多肽、多糖和核酸,该技术已在生命科学领域广泛应用。本文综述了 MALDI-TOF MS 技术原理以及近年来在植物病原真菌和细菌鉴定方面的研究进展。MALDI-TOF MS 作为一种简便和快捷的检测技术,必将在植物病原菌鉴定领域发挥更大的作用。     

深港两地工程土壤真菌多样性分析

[目的]对深圳和香港工程土壤的真菌种类进行检测。[方法]以深圳和香港两地不同深度(0.5、10.0、20.0和30.0 m)的工程土壤为研究对象,结合形态学和ITS序列扩增并测序的方法,分析土壤真菌多样性。[结果]共分离得到934个菌株,分别属于79个属132种。深圳土壤有14个属19种;香港土壤有73个属122种。66个属113种只在香港有分布;7个属10种只在深圳有分布。深港两地均有分布的有7个属9种。[结论]深港两地工程土壤真菌种类有一定差异性;香港工程土壤真菌种类较多,其中还包括多种植物病原真菌,土壤入境前必须进行检疫处理。     

李痘病毒适生区预测及模型选择

李痘病毒是危害核果类果树的重要病原物,具有传播迅速的特点,已被多个国家列为检疫性有害生物.本文尝试利用Dymex模型和Maxent模型预测李痘病毒在中国的潜在适生区,通过试验验证和对预测模型技术参数AUC的比较分析,认定利用Maxent模型预测的李痘病毒在中国的潜在适生区具有一定的科学性,对我国制定植物检疫法规具有一定的参考价值,同时也为今后其它植物病毒的定量风险分析工作提供有益的借鉴.     

芦笋枯萎病

芦笋枯萎病是芦笋的一种危险性病害,它常和芦笋冠腐病 Fusariumminiliforme 一起造成芦笋严重衰产、老芦笋园无法更新。该病的发现很可能始于1921年,当时 Cook 在美国新泽西州发现了一种称之为“Dwarf Asparagus”的新病害,经实验证明是由一种待鉴定的镰刀菌引起,1941年 Cohen 和 Heald 对为害华盛顿芦笋的枯萎病菌进行了鉴定。之后到     

烟草环斑病毒RT-Realtime PCR检测方法

烟草环斑病毒(Tobacco ringspotvirus,TRSV)是我国公布的二类检疫危险性有害生物,对农业生产危害较大。受该病毒侵染的一些寄主植物出现隐症,并伴随病毒浓度降低,给检测工作造成困难。根据TRSV外壳蛋白基因序列设计合成了一对引物及一条MGB探针,优化了反应条件,建立了TRSV实时荧光RT-PCR检测方法。该方法与常规的DAS-ELISA方法和RT-PCR方法相比,灵敏度分别提高了200倍和4倍,并且对不同寄主上的TRSV均有较好的检测效果。     

进口泰国榴莲上棕榈疫霉的分离和鉴定

从泰国进口的榴莲上分离到一种引起榴莲果实腐烂的病原真菌.通过形态鉴定和核糖体ITS区DNA序列测定以及分子生物学检测结果综合分折,鉴定为榴莲根茎褐腐病菌(棕榈疫霉Phytophthora palmivora(Butl.)Butler).     

我国梨和部分国外梨果实上链格孢菌的鉴定研究

本文从链格孢的产孢表型、分生孢子特征和分子生物学方面研究了从河北鸭梨、新疆库尔勒香梨、美国和日本以及智利的梨上分离的链格孢菌的种类.经对115支Alternaria菌株的形态学鉴定,共确定了3个种,即Alternaria alternata、A.tenuissima和A.infectoria.ITS系统发育分析研究表明,Alternaria大孢子种彼此间及大孢子种与小孢子种间已发生明显分化,可以根据ITS序列差异明确区分.而供试的多数小孢子种在ITS序列上差异很小,因而不能根据ITS序列差异来区分.     

PCR法检疫鉴定番石榴实蝇

利用mtDNA序列,设计出两对特异性引物,应用定性PCR技术检疫鉴定番石榴实蝇.本方法适用于成虫鉴定和未成熟虫态(卵、幼虫、蛹)的快速检疫鉴定.     

李痘病毒适生区预测及模型选择

李痘病毒是危害核果类果树的重要病原物,具有传播迅速的特点,已被多个国家列为检疫性有害生物.本文尝试利用Dymex模型和Maxent模型预测李痘病毒在中国的潜在适生区,通过试验验证和对预测模型技术参数AUC的比较分析,认定利用Maxent模型预测的李痘病毒在中国的潜在适生区具有一定的科学性,对我国制定植物检疫法规具有一定的参考价值,同时也为今后其它植物病毒的定量风险分析工作提供有益的借鉴.     

基于形状与纹理算法的通用昆虫图像模式识别研究

为了在口岸检疫中实现对多种昆虫的识别,采用了基于形状和纹理的通用昆虫图像模式识别算法。用该算法测试了6个目14种昆虫,体长从3.2～76.3mm,长宽比为0.51～6.88,体色包括为黑、紫、褐、黄及绿色,取得92.4%的1秒钟叠加识别率。测试结果表明该算法对不同体长、各种长宽比,以及深色的昆虫识别效果良好。在白色背景下对于黄色的国槐羽舟蛾识别效果较差,主要由于昆虫体色与背景颜色相近,采用识别算法的二值化处理后失去轮廓所至。