牦牛与普通牛、水牛的X染色体基因编码区比较及密码子偏性分析

【目的】从基因组比对及密码子偏性角度分析牦牛与其他牛亚科动物X染色体,有助于了解牦牛品种差异及系统进化地位,为其适应高原低压低氧环境和密码子优化提供参考。【方法】以牦牛X染色体参考基因编码区序列为参考,与普通牛和江河型水牛X染色体参考基因编码区序列进行基因组比对和基因共线性分析,同时进行基因注释,对过滤后的编码区文件进行相对同义密码子使用频率(RSCU)、ENC-plot、PR2-plot和最优密码子确定等偏性分析。【结果】在牦牛X染色体基因编码区发现了参与气管收缩、肺部呼吸及机体代谢等基因与普通牛和水牛存在差异,如KLHL13、CENPI和PGK1等基因;共线性显示长段由强选择压和突变压下表现出的交换线性区域;密码子分析中3种牛亚科动物密码子使用偏性相似,偏性均较弱,均偏向G/C结尾;强偏性密码子(RSCU≥1.5)均为CUG、GUG、AGA、AGG和UGA;牦牛、普通牛和水牛分别筛选出16、13和9个最优密码子,均以A/U结尾。【结论】牦牛与普通牛、水牛相比面临了更大的选择压力,累计的变异程度更大,三者的密码子偏性受到自然选择作用均大于突变作用。研究结果为牦牛的遗传育种、密码子优化...     

基于多种标记技术的榴莲蜜种质的遗传多样性分析

榴莲蜜为桑科木菠萝属热带稀有水果，原产马来半岛，近年在海南引种栽培成功。为了区分25份材料以及鉴定它们的亲缘关系的远近。本研究利用形态学，DNA条形码和ISSR分子标记技术对23份榴莲蜜和2份菠萝蜜种质进行种类鉴别以及亲缘关系分析，以探讨海南榴莲蜜种质资源的遗传多样性。结果表明通过对叶片刚毛性状的鉴定，可将25份种质资源分成3类。以ITS2序列和psbA-trnH序列作为DNA条形码，分别将25份种质资源分成5大类和3大类，2种序列都无法将25份材料完全进行区分，但都可将榴莲蜜LLM-10与其他榴莲蜜种质区分开来，其中，LLM-10与菠萝蜜的亲缘关系最近。从ITS2序列和psbA-trnH序列差异位点图来分析，psbA-trnH序列变异位点多，遗传变异信息丰富。ISSR分子标记技术分析了25份种质资源的遗传多样性，菠萝蜜和榴莲蜜样本的遗传相似系数在0.57～0.80，榴莲蜜样本之间的遗传相似系数在0.59～0.90，说明菠萝蜜种质与榴莲蜜种质之间，榴莲蜜与榴莲蜜种质之间的遗传变异幅度都较大；UPGMA聚类图将25份材料分成5大类，其中榴莲蜜LLM-10独自聚成1类，这与形态学和DNA条...     

茉莉酸甲酯对橡胶树花药愈伤乳管细胞分化的影响

橡胶树老化的愈伤组织存在乳管细胞。茉莉酸甲酯（MeJA）与茉莉酸（JA）同属茉莉酸类物质（JAs），但MeJA对橡胶树愈伤乳管细胞分化的效果尚不清楚。系统研究MeJA对橡胶树愈伤乳管细胞分化的效果，结果发现，低浓度的MeJA(0～1 mg/L)对花药愈伤组织的生长影响不明显，而高浓度的MeJA(2～3 mg/L)会抑制愈伤组织生长，且MeJA浓度与愈伤组织生长呈负相关关系。组织化学制片结果显示，低浓度的MeJA能显著提高愈伤乳管细胞发生频率，其中浓度为1 mg/L效果最佳；而高浓度的MeJA则会降低其发生频率。荧光定量PCR结果显示，培养基中添加MeJA后SRPP、REF、CPT等与橡胶生物合成相关的重要基因的表达量在愈伤组织中变化趋势与愈伤乳管细胞发生频率的变化趋势基本一致，进一步证实MeJA能促进愈伤乳管细胞分化。透射电镜观察发现愈伤乳管细胞内含有橡胶粒子、黄色体等细胞器。研究结果对促进橡胶树愈伤组织在乳管分化研究中的应用，以及开发新型橡胶树增产刺激剂，促进橡胶树天然橡胶的生产具有一定意义。     

参薯愈伤组织诱导及其悬浮细胞培养体系的建立

为确定参薯愈伤组织诱导的最佳激素浓度及悬浮细胞培养条件，以3种基因型参薯(Dioscorea alata)组培苗的腋芽茎段为材料，采用三因素三水平正交实验来探究不同浓度组合的6-BA、NAA和毒莠定(picloram, PIC)对愈伤组织诱导率的影响；为了初步建立愈伤组织悬浮细胞培养体系，采用单因素实验探讨初始悬浮细胞接种量、蔗糖浓度、摇床转速、酪蛋白浓度和光照时间对其细胞生物量的影响。实验结果表明：在1.0 mg/L 6-BA+1.0 mg/L NAA+0.5 mg/L PIC激素浓度组合下，参薯Da70号组培苗(Da70)的愈伤诱导率为90%，愈伤状态较好，不同激素对愈伤诱导率的影响分别为NAA>PIC>6-BA。在单因素悬浮细胞培养实验中，10 mL的初始悬浮细胞接种量、10 g/L的蔗糖浓度、100 r/min的摇床转速、50 mg/L的酪蛋白浓度和0 h光照有利于细胞生物量的增加。参薯悬浮细胞生长总体上呈现“S”型，且在第18天时，鲜重为0.159 3 g，干重为0.042 3 g，细胞活力OD值为0.485 0，达到峰值。本研究为后续原生质体的分离以及功能基因的...