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选择合适的内参基因可以提高q RT-PCR分析相关基因表达的准确性。本研究以玉兰(Magnolia denudata)实生苗在盐胁迫下的根、茎、叶为材料,选取常用的13个内参基因:肌动蛋白(actin,ACTIN)、亲环蛋白(cyclophilin,CYP)、延伸因子1α蛋白(elongationfactors-1α,EF-1α)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphat dehydrogenase,GAPDH)、GTP结合蛋白(GTP binding protein,GBP)、NAC域蛋白(NAC domain protein,NAC)、异柠檬酸脱氢酶(NADP-isocitrate dehydrogenase,NADP)、翻译延伸因子(translation elongation factors,TEF)、泛素化酶基因(ubiquitin-conjugating enzyme,UBC)、多聚泛素蛋白(polyubiquitin protein,UBQ)、微管蛋白(α-tubulin alphaα,α-TUB)、β微管蛋白(tubulin beta,β-TUB)、18S核糖体RNA(18S ribosomal RNA,18S)作为候选内参基因,设计引物,通过普通PCR和溶解曲线验证引物特异性;结合ge Norm、Norm Finder和Best Keeper软件分析筛选最佳内参基因,进一步通过2个目的基因:纤维素合成酶类似蛋白D(cellulose synthase-like D,CSLD)和1,4-β-d-葡聚糖酶(endo-1,4-beta-d-glucanase,KOR)对筛选得到的内参基因进行验证。结果显示,13个内参基因PCR产物条带清晰单一,引物扩增效率均在95%到105%之间,且溶解曲线呈现明显的单一峰,表明引物特异性良好;3个内参软件ge Norm、Norm Finder和Best Keeper综合分析得到稳定性排名前3的内参基因为GBP、UBQ和UBC,而18S为最差的内参基因。进一步选取GBP、UBQ、UBC 3个基因的组合以及稳定性差的18S和GAPDH基因,对不同组织中的CSLD和KOR基因进行相对表达分析,结果表明,两个目的基因相对于3个稳定的内参基因及其组合显示出一致的相对表达量,而不稳定的内参基因18S和GAPDH没有对表达数据进行有效的标准化,结果存在偏差。由此可见,GBP、UBQ和UBC可以作为玉兰盐胁迫下不同组织器官中表达的稳定内参。本研究结果将为木兰属植物在逆境中相关目的基因的定量表达研究提供重要的参考依据。 相似文献
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采用逐级降温程序模拟冰冻处理技术测定含笑、乐昌含笑、深山含笑3种含笑属植物离体叶片的相对电导率和可溶性蛋白含量,并用Logistic方程计算其半致死温度(LT50)。结果表明:(1)3种植物的耐低温能力存在着显著差异,随着温度的降低,叶片电导率总体上呈S形曲线变化;采用Logistic方程计算3种植物的耐寒半致死温度(LT50),得出3种植物的耐寒强弱次序为含笑(–39.2℃),乐昌含笑(–32.9℃),深山含笑(–31.0℃)。(2)随着低温处理时间的延长,3种植物叶片蛋白质含量呈现上升趋势。 相似文献
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为了探究调控‘红元宝’紫玉兰一年两次花芽分化的成花关键基因和代谢通路,对其两次花芽分化过程的前、中、后期花芽样本进行转录组和代谢组测序分析。转录组拼接后共得到43257条Unigene,其中鉴定出35个差异表达的成花关键基因;代谢组共检测到569个代谢物。结合转录组和代谢组分析,两次花芽分化中期产生差异基因最多,共4074个。第二次花芽分化产生的差异代谢物蔗糖(Sucrose)和3–氰基丙氨酸(3-Cyanoalanine)大幅上调,甲基丙二酸(Methylmalonic acid)大幅下调,它们在4条KEGG通路上与相应时期的差异基因的相关性值|PCC|> 0.80且P <0.05。蔗糖与淀粉代谢通路中,差异代谢物海藻糖(Trehalose)与该通路中7个差异基因相关性值|PCC|> 0.80。通过CCA(Canonical correspondenceanalysis)分析:两次花芽分化的中期,筛选出存在差异转录调控机制的KEGG通路共3条,分别为ko01200碳代谢、ko00630乙醛酸和二羧酸代谢和ko02010ABC转运蛋白。从35个成花基因中随机挑选6个(... 相似文献
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通过电镜扫描,观察和描述了12种(包括3品种)木兰属Magnolia植物(望春玉兰M. biondii,武当木兰M. sprengeri,青皮木兰M. viridula,白玉兰M. denudata,玉灯玉兰M. denudata ‘Lamp’,星花木兰M. stellata,景新玉兰M. × soulangeana ‘Jingxin’,美丽紫玉兰 M. concinna,腋花玉兰 M. axilliflora,长花玉兰M. × soulangeana ‘Changhua’,紫玉兰M. liliflora,多瓣紫玉兰M. polytepala)的花粉形态。结果表明:12种(包括3品种)木兰属植物花粉粒均为舟形,具远极单沟,左右对称,异极,大小及外壁纹饰存在差异;根据Walker进化理论可知:望春玉兰、武当木兰、青皮木兰、白玉兰、玉灯玉兰以及景新玉兰属于较原始的种;美丽紫玉兰、星花木兰、长花玉兰、腋花玉兰、紫玉兰以及多瓣紫玉兰花粉属于较进化的种;同时还得出美丽紫玉兰、紫玉兰以及多瓣紫玉兰花粉形态基本一致;青皮玉兰与景新玉兰关系较近,但进化关系不同。图2表2参9 相似文献
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盐胁迫对红叶石楠‘红罗宾’幼苗生长与光合生理的影响 总被引:2,自引:0,他引:2
以红叶石楠‘红罗宾’幼苗为试验材料,用不同浓度的NaCl处理,测定了处理后的植株叶片的光合作用参数、超氧化物歧化酶(SOD)活性和丙二醛(MDA)、钠离子(Na+)含量。结果表明,植株在低浓度NaCl(≤0.7%)胁迫下,幼苗叶片的净光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)、胞间二氧化碳浓度(Ci)和叶片中的Na+浓度均呈现先升后降的趋势,而SOD活性则不断上升,幼苗生长未受到显著影响;植株在高浓度NaCl(≥1.0%)胁迫下,幼苗叶片的Pn、Tr、Gs均呈现出不断下降的趋势,Ci和叶片中Na+含量不断上升,SOD活性先升后降,幼苗叶片萎蔫凋落,甚至死亡,而幼苗MDA含量在各种处理下均没有明显规律性变化。 相似文献