利用中芯一号SNP芯片检测隆林猪全基因组拷贝数变异

【目的】检测隆林猪的全基因组拷贝数变异。【方法】采集33头隆林猪的耳组织样本,通过酚-氯仿法提取DNA后,使用猪中芯一号50K SNP芯片进行基因分型,得到的原始数据通过Genomestudio软件和Linux系统进行处理,使用CNVPartition和PennCNV软件分别检测拷贝数变异(copy number variation, CNV),并利用Bedtools软件将CNV合并为拷贝数变异区域(copy number variation region, CNVR),使用Biomart对CNVR进行基因定位,利用David网站对定位到的基因进行GO和KEGG富集分析,使用猪QTL数据库对共同CNVR进行QTL注释。【结果】CNVPartition软件共检测到260个CNVs,合并为47个CNVRs,其中缺失型40个、获得型5个、混合型2个,共定位到84个基因,显著富集到13条信号通路;PennCNV软件共检测到96个CNVs,合并为15个CNVRs,其中缺失型9个、获得型1个、混合型5个,共定位到8个基因,显著富集到8条信号通路;2个软件检测结果定位到的基因主要富集在嗅觉相关通路和...     

猪红细胞生成素受体基因突变与血常规性状关联分析

本研究旨在探索红细胞生成素受体基因(EPOR)影响红细胞相关性状的分子机理.对EPOR基因第1内含子和第4内含子突变位点g.705G＞T和g.2373C＞T,以飞行时间质谱进行个体基因型分型,在构建的大白猪×民猪F2代资源群体内开展其与6种血常规性状(红细胞压积、血红蛋白、平均红细胞血红蛋白量、平均红细胞体积、红细胞计数及红细胞分布宽度)的关联分析.结果表明,第1内含子突变位点g.705G＞T未发现与血常规性状显著关联;第4内含子突变位点g.2373C＞T群体内只发现2种基因型,其中CT基因型个体的红细胞压积显著高于CC基因型个体(P＜0.05),但并未发现与其他性状显著关联.结果显示,EPOR基因突变可显著影响红细胞压积,说明该基因可作为影响红细胞压积的主效候选基因开展深入研究.     

黑龙江省森工林区森林生态文化建设的几点思考

黑龙江省森工林区经营总面积1000万hm2，森林覆盖率84．2％，是东北亚陆地自然生态系统的主体之一，区内有野生动物500多种，并有大量金属和非金属矿产资源及多种食用菌类。随着“十二五规划”和“天保二期工程”的启动，以及我省森工“四八四三”长远发展战略的实施，     

几个中国地方猪群体遗传结构和产仔数性状选择信号分析

旨在对几个中国地方猪品种进行群体遗传结构分析,并筛选与中国地方猪产仔数相关的基因组选择信号及候选基因.本研究下载了6个中国地方品种猪共计102头个体的Illumina PorcineSNP60芯片数据,构建了包括19头迪庆藏猪、16头明光小耳猪、16头五指山猪在内的低产仔数组和包括11头姜曲海猪、20头蓝塘猪、20头梅...     

微波提取桂花总黄酮工艺优化

为了给桂花总黄酮的提取提供理论参考,优化微波提取桂花总黄酮的工艺,实验以桂花为原材料,乙醇为提取剂,通过单因素实验研究了颗粒度、乙醇体积分数、微波功率、微波时间、液料比及微波温度对提取效果的影响,通过正交试验对提取工艺进行优化,得最佳提取工艺：颗粒度60目、乙醇体积分数60%、微波功率300W、微波时间150s、液料比40：1（mL/g）、微波温度50℃,在此条件下总黄酮提取率为17.2077%。     

灵宝市黄河沿岸地区芦笋高产高效栽培技术

芦笋又名石刁柏、龙须菜,是多年生草本植物,属百合科,其营养价值高。我市从1997年开始小面积在黄河沿岸的沙质壤土地区进行试验种植,现已发展到5.7万亩。我们在生产实践中总结出了一整套规范性栽培技术,以此达到高产高效的目的。     

上海市搬迁地土壤团聚体的分布特征

[目的]分析城市典型搬迁地土壤团聚体的分布特征,为搬迁地土壤绿化种植提供技术支撑。[方法]以上海市城中村和工企业两种典型搬迁地土壤为研究对象,采集27个典型搬迁地土样,采用干筛和湿筛法分别测定搬迁地土壤非水稳性团聚体和水稳性团聚体,分析了上海搬迁地土壤团聚体分布特性,通过单因素方差法分析了不同搬迁地土壤团聚体的差异性,并对土壤团聚体与土壤基本理化性质进行了相关性分析。[结果]上海搬迁地土壤非水稳性团聚体以粒径≥2.0 mm的大团聚体为主,所占比例达64.9%;土壤水稳性团聚体以粒径<0.106 mm的微团聚体为主,所占比例高达73.4%;土壤团聚体破坏率大,为79.8%。城中村搬迁地土壤非水稳性团粒结构体(粒径≥0.25 mm)显著高于工企业搬迁地(p<0.05),但水稳性团粒结构体差异不明显;工企业搬迁地土壤团聚体破坏率显著高于城中村搬迁地(p<0.05)。土壤团聚体破坏率与土壤容重呈极显著正相关性,与土壤田间持水量、总孔隙度及有机质则呈极显著负相关性(p<0.01)。[结论]上海市搬迁地土壤团粒结构体差,团聚体破坏率高,但城中村土壤团粒结构体及稳定性优于工企...     

上海典型植物群落冬季土壤呼吸特征及其影响因子

采用开放式呼吸测定系统研究了上海典型绿地13类植物群落的冬季土壤呼吸速率及其影响因子.结果表明:不同植物群落之间的土壤呼吸存在差异,土壤呼吸速率的大小变化趋势为草＞乔＞灌,其中黑麦草草坪的呼吸速率最高,为.1.903±0.311μmol·m-2·s-1.人为干扰或植物生长习性不同影响植物群落的土壤呼吸,而影响植物群落土壤呼吸的环境因子主要有10 cm土温、5 cm土温、土壤有机质含量、大气CO2浓度和温度,它们与土壤呼吸速率的相关系数分别为0.632、0.389、0.328、0.137和0.135,结构主因子的累积贡献率达77.0%;其中10 cm土温是影响植物群落土壤呼吸的主导因子,它与土壤呼吸速率之间呈指数显著正相关.研究城市中不同植物群落的土壤呼吸特征对指导城市绿化和提高城市生态环境质量有借鉴作用.     

上海城市绿地不同植物群落土壤呼吸及因子分析

用CFX-2开放式呼吸测定系统对上海城区9种植物群落进行了土壤呼吸速率的测定及其影响因子的探讨。结果表明:9种植物群落的土壤呼吸速率均呈明显季节变化,土壤呼吸速率最大值出现在6－9月,最小值出现在12－3月;但土壤呼吸速率日变化有乔灌木较平稳,草坪呈单峰曲线的趋势;9种植物群落平均土壤呼吸速率的总体差异极为显著（P＜0.01）,狗牙根Cynodon dactylon草坪最高,为5.51 molm－2s－1,是呼吸速率最低的紫荆Cercis sp.群落的2.76倍;9种植物群落的土壤呼吸速率与气温、5 cm地温和10 cm地温均呈极显著指数相关（P＜0.01）,但地温Q10(温度系数,温度每变化10 ℃,呼吸速率的相对变化）值高于气温,且5 cm和10 cm地温对土壤呼吸速率的影响较小;土壤易变碳的大小顺序为轻组有机碳＞微生物量碳＞可溶性碳,但土壤呼吸速率受土壤微生物量碳和可溶性碳的影响较大;草坪群落二氧化碳的年释放量最大,达到了33.18 t hm－2a－1,是乔木林的1.95倍,是灌木丛的2.12倍。图3表6参30