北京黑猪HoxB簇基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析

旨在对北京黑猪HoxB簇9个基因(HoxB1-7、9和13)的多态性与脊椎数和胴体性状(胴体长、胴体直长、胴体斜长及胴体重)进行关联分析。本研究提取251头220日龄的健康北京黑猪耳组织DNA,对HoxB簇的9个基因通过引物设计、聚合酶链式反应(PCR)技术、Sanger测序技术等对SNPs进行基因分型，并计算变异位点基因型频率以及等位基因频率分布，并与脊椎数和胴体性状进行关联分析。结果，本试验共筛选到4个基因共12个非编码区的(UTR)SNPs,包括HoxB2基因的1个5′UTR突变、HoxB5基因的2个3′UTR突变、HoxB9基因的2个3′UTR突变以及HoxB13基因的7个3′UTR突变。将12个SNPs分别与脊椎数和胴体性状使用Duncan′s多重检验统计分析发现，HoxB2基因的1个5′UTR突变(c.40 C>T)、HoxB5基因的2个3′UTR突变(c.1766 A>G、c.1767 A>G)均与性状关联不显著(P>0.05);而HoxB9基因中的1个3′UTR突变(c.2743 C>T)与胴体性状关联显著(P<0.05),HoxB1...     

畜禽肌纤维发育规律及相关基因研究进展

肌肉组织分为骨骼肌、心肌和平滑肌3种类型。其中骨骼肌是畜禽最大的器官，约占畜禽身体质量的40%，它由大小、形状及肌肉收缩蛋白含量不同的肌纤维构成，对维持身体姿势、呼吸和体温调节是必不可少的。在肌纤维发育的各阶段，复杂的外在和内在机制共同调控着肌肉的发生，相关的信号机制在这当中起着决定性作用。畜禽的骨骼肌是主要的肉产品来源，而肉质性状的改善也是每个畜禽场的重要目标，因此对肌纤维的发生及相关机制的全面了解是很有必要的。本文通过整合1987—2022年国内外肌纤维研究相关文献，对肌纤维的发生、类型及调控机制进行了综述，重点介绍了与畜禽肌纤维发育规律相关的基因及信号通路，并对目前畜禽肌纤维调控机制研究存在的问题提出了建议和未来研究的方向进行了展望。     

北京黑猪FUBP3和USP43基因多态性与眼肌面积性状的关联分析

旨在研究上游远端元件结合蛋白3(far upstream element binding protein 3，FUBP3)及泛素特异性蛋白酶43(ubiquitin specific protease 43，USP43)基因多态性与北京黑猪眼肌面积性状的关系，从而在分子水平指导北京黑猪的育种工作。本研究选取408头北京黑猪收集眼肌面积性状数据并采集肉样提取DNA，根据FUBP3和USP43基因序列设计43对引物进行PCR扩增及测序，运用DNAstar软件分析测序结果，对FUBP3和USP43基因不同基因型与北京黑猪眼肌面积性状进行关联分析并运用荧光定量PCR对两基因进行基因表达差异分析。在FUBP3基因启动子区共有8个突变，其中rs701769847G>A与5~6肋眼肌面积和最后肋眼肌面积均关联显著(P<0.05)，rs332131528C>G仅与5~6肋眼肌面积关联显著(P<0.05)，rs325550799T>C、rs339464012T>C和rs326069041T>C只与最后肋眼肌面积关联显著(P<0.05);基因表达差异分析表明，rs701769847G>A位点GG型个体的FUBP3基因mRNA水平显著低于AA型个体(P<0.05)。USP43基因启动子区的rs335310752C>T和剪切区的rs323463345G>A均只与最后肋眼肌面积关联显著(P<0.05)。基因表达差异分析表明，rs323463345G>A中GG型个体和AA型个体的USP43基因mRNA水平差异不显著。上述两基因中共有两个位点与5~6肋眼肌面积性状关联显著(P<0.05)，6个位点与最后肋眼肌面积性状关联显著(P<0.05),可以作为北京黑猪眼肌面积性状变异的候选基因功能位点，也可以作为潜在的眼肌面积性状分子标记。