鸭产蛋量相关遗传变异和功能基因筛选及鉴定

【目的】通过高通量混池重测序和选择清除分析比较鸭不同产蛋量组间基因组显著差异区域内的SNP和基因差异,以筛选和鉴定出鸭产蛋量相关的遗传变异位点和功能基因,为通过分子遗传育种手段提高鸭产蛋性能提供依据。【方法】根据金定鸭群体开产后150 d内个体产蛋量情况,选择2种极端表型,分为高产蛋组(CH)和低产蛋组(CL)。基于混池全基因组重测序和选择清除分析技术筛选不同鸭产蛋量组间基因组显著差异区域内的SNP及相关功能基因,通过单个样本PCR扩增子测序对筛选的产蛋量相关SNP进行验证,对筛选的候选基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,确定候选基因参与的最主要生化代谢途径和信号转导途径,并分析不同基因型间产蛋量高低差异。【结果】在低产蛋量组和高产蛋量组分别获得192 071 438和229 836 820条的clean reads,共定位到的SNP差异极显著区间为1 368个,受选择候选基因为214个,而且这些区间和基因主要位于Z号染色体,主要包括KDM4C、LURAP1L、PTCH1、PRUNE2、TRPM3和VPS13AD等基因。验证结果表明重测序结果准确。GO功能分析表明,受选择基因在分子...     

华中地区家鸭种质资源的遗传结构研究

利用28个微卫星标记对华中地区6个家鸭资源（淮南麻鸭、攸县麻鸭、临武鸭、荆江麻鸭、沔阳麻鸭和恩施麻鸭）的遗传结构进行了评估。结果表明：6个群体的平均杂合度都较高,最低的为攸县麻鸭（0．5512）,最高的为荆江麻鸭（0．6035）,群体平均杂合度为0．5801,反映了各鸭种的杂合度都较高,遗传多样性丰富;华中地区各鸭种间存在较大的遗传分化,22．5％的遗传变异来源于群体间的差异,进一步反映了各品种具有本品种特性的多样性;通过计算DA遗传距离发现各品种间的遗传距离较远,分化时间较长;NJ聚类结果将华中地区家鸭资源聚为3类,湖北省的荆江麻鸭、沔阳麻鸭和恩施麻鸭聚为一类;湖南省的攸县麻鸭和临武鸭聚为一类;河南省的淮南麻鸭独聚为一类。本研究结果为华中地区家鸭品种种质特性研究提供了基础,也为中国家鸭资源的合理保护和开发利用提供了科学依据。     

禽类催乳素基因的研究概况

催乳素（Prolactin,PRL）是由单基因编码23KD的多肽类激素,几乎存在于所有脊椎动物中,主要由垂体前叶嗜酸细胞分泌的,也可由各种免疫细胞、妊娠子宫蜕膜及皮肤细胞等合成和分泌。禽类催乳素前体含229个氨基酸,其中包括30个氨基酸的信号肽序列和199个氨基酸的PRL成熟蛋白.催乳素具有广泛的生理功能,它不仅具有调节生殖系统的重要作用,还具有调节体内渗透压平衡、内分泌、代谢和免疫系统,引起就巢等功能。     

鸭发育早期下丘脑-垂体生长轴相关基因mRNA的表达特异性分析

【目的】选择生长速度不同的高邮鸭和金定鸭为试验模型,3种不同品种鸭胚胎期和出雏早期下丘脑垂体生长轴相关基因的表达规律及其与体重和肝重的相关性。【方法】采用实时荧光定量PCR方法研究鸭13、17、21、25、27胚龄和出雏后7日龄下丘脑生长激素释放激素（growth hormone release hormone,GHRH）与生长抑素（somatostatin,SS）、垂体生长激素（growth hormone,GH）和肝脏生长激素受体（growth hormone receptor,GHR）与胰岛素样生长因子（insulin-like growth factors,IGFs） mRNA的表达规律。【结果】证实鸭下丘脑GHRH与SS、垂体GH和肝脏GHR与IGF-I在13胚龄已有表达;除了SS在鸭发育早期维持一个低表达状态外,其它的4种基因均呈现极显著的品种和时间特异性;除了GH外,发现鸭早期发育过程中GHRH、GHR和IGF-I mRNA的表达受到品种和日龄的交互作用的极显著影响。与鸡以往的研究相比,禽类胚胎期下丘脑垂体生长轴相关基因mRNA的表达存在着种属差异。本试验发现鸭早期发育过程中,体重和肝重的变化也呈现极显著的品种和时间特异性,且与下丘脑垂体相关基因的表达呈现不同程度的线性相关。【结论】结果提示下丘脑垂体生长轴基因 mRNA的表达可能在鸭早期发育过程中发挥着重要作用,遗传背景的差异可以导致鸭发育早期体重的差异生长和相关基因的差异表达。     

0～28日龄高邮鸭日粮能量和蛋白质适宜需要值

通过调查日粮能量和蛋白质适宜需要值对0~28日龄高邮鸭生长及日粮蛋白利用率的影响,探讨高邮鸭此阶段能量和蛋白质适宜需要值。选择0日龄健康、精神状况良好的高邮鸭360只,公母各半,随机分到9个处理组,每个处理4重复,每重复10只,分别饲喂由能量(11.70 MJ/kg、11.90 MJ/kg和12.12 MJ/kg)、蛋白(18%、19%和20%)3×3因子组合的9种日粮,饲养28 d,记录喂料和定期称重。21日龄时,从每个处理中按照平均体重选择4只,进行代谢试验。结果表明:0~28日龄高邮鸭在日粮能量值为12.12 MJ/kg时,高邮鸭采食量和增重值都明显比日粮能量值为11.70 MJ/kg和11.90 MJ/kg低,其饲料转化比也最大,达2.83∶1。试验中3个蛋白质水平均对高邮鸭0~28日龄的采食量、体增重等指标产生显著影响,但日粮蛋白质水平对0~28日龄高邮鸭的作用效应较能量值大,随着日粮能量值和蛋白质水平的升高,其采食量、体增重等指标显著降低。代谢试验结果表明,日粮能量和蛋白分别为11.90 MJ和19%时,氮沉积率最大。试验得出0~28日龄高邮鸭日粮的适宜能量和蛋白质适宜需要值分别为11.70 MJ/kg和18%。     

家禽肠道菌群多样性及其与宿主的相互关系

概述主要品种家禽肠道菌群结构多样性,分析肠道菌群与宿主的营养互作关系;多角度诠释肠道菌群对肠道黏膜免疫系统的健康影响,以期实现家禽肠道菌群发展和形成过程的可控,益生菌的合理应用,保证家禽肠道菌群与宿主两者良性互作,实现家禽的健康高效生产。     

光照时长对鸭产蛋性能的影响

光照是影响鸭产蛋性能的重要因素,目前生产上没有统一的最佳光照时长。试验以绍兴鸭为对象,研究16 h、17 h和18 h三种不同光照时长对鸭16~34周龄产蛋性能的影响。结果显示:①17 h光照组产蛋高峰期产蛋率水平维持在90%以上,16 h、18 h光照组高峰期产蛋率水平明显较低,在85%左右。②17h光照组平均蛋重为71.71 g,显著高于16h(70.27g)和18 h(69.51 g)光照组。③16~34周龄间,17 h光照组累积产蛋数达到50285个,明显高于16 h(46063个)和18 h(44764个)光照组;17 h光照组累积蛋重达到2608.13 kg,分别比16 h和18 h光照组重308.76 kg和400.97 kg。综合结果表明:17 h光照组的高峰期产蛋率水平、累积产蛋数、平均蛋重和累积蛋重均优于16 h和18 h光照组。因此,对于产蛋性能而言,光照时长为17 h时可能更有优势。     

中国家鸭的分子遗传多样性及其起源探讨

本研究测定了我国重点保护的8个家鸭品种及斑嘴野鸭的线粒体DNA D-loop区667bp序列,分析了这8种家鸭的遗传多态性和起源。遗传多态性分析结果显示A、G、C、T碱基平均含量分别为25.5%,15.3%,33.4%,25.8%;变异类型为转换和颠换,未发现缺失与插入。确定了20种单倍型,Hap2（A7）为家鸭的主体单倍型型,平均单倍型多样度为0.67136,平均核苷酸多样度为0.00192,攸县麻鸭单倍型多样度、核苷酸多样度最高,8个品种之间双参数遗传距离为0.00056-0.00414,其中连城白鸭和攸县麻鸭之间遗传距离最大。38种单倍型系统发生研究表明,8种家鸭都单一地起源于绿头鸭。     

高邮鸭与金定鸭GnRHR2基因组织表达差异分析

克隆鸭GnRHR基因序列,并研究其对产蛋性能的调节作用.采用RT-PCR技术从鸭生殖轴组织总RNA中克隆GnRHR基因cDNA序列,并利用Real-time PCR技术分析GnRHR基因在不同产蛋期高邮鸭和金定鸭生殖轴组织中的表达.序列分析结果表明克隆序列长度约500 bp,属Ⅱ型GnRHR基因序列,与家鸡cGnRHR...     

金定鸭胚胎期骨骼肌发育模式及MRFs家族基因表达变化研究

MRFs (Myogenic regulatory factors,MRFs)家族包括肌分化因子MyoD、肌细胞生成素(myogenin)、生肌决定因子Myf5和Myf6,它们参与肌肉发生发育的各个环节.研究采用Real-time PCR方法研究了金定鸭胚胎期13、17、21、25和27日胚龄MRFs家族基因在骨骼肌中的表达变化,并分析其表达变化与胚重、骨骼肌发育的相关性.金定鸭胚重及骨骼肌重发育模式显示胚重在胚胎期呈持续增加趋势,但胸肌在胚胎中后期显示出较腿肌滞后的增重变化.MRFs家族基因在胚胎期骨骼肌中均能检测到表达,MyoD mRNA在21日胚龄前腿肌中的表达量高于胸肌,而在胚胎发育后期(25及27日胚龄)胸肌中表达量渐渐高于腿肌.胸、腿肌中myogenin mRNA的表达与胚重、胸、腿肌发育重量变化均呈强的负线性相关.上述研究结果首次揭示了鸭胚胎期骨骼肌中MRFs家族基因表达具有显著的时空性,推测MyoD mRNA在胸、腿肌中的表达变化可能与胸、腿肌增重表型差异有关,研究结果为进一步深入研究MRFs家族基因在胚胎期骨骼肌发生过程及其调控机理中的功能提供一定的理论依据.