表型组学及多组学联合分析在植物种质资源精准鉴定中的应用

种质资源是指具有实际或潜在利用价值的、携带生物遗传信息的载体。表型组学是近年来新兴的高通量、高分辨率的表型分析技术和平台。随着各种先进的表型组学研究工具和平台的研发,表型组学在种质资源筛选和评价中起着越来越重要的作用:在植物优异农艺性状鉴定、抗逆性研究、突变体研究和分子标记辅助育种研究中,高能量、高分辨率的鉴定技术对基因与环境互作的表型鉴定,为种质资源的规模化、批量化鉴定评价提供了基础和条件,为发掘优异种质和优良等位基因奠定了基础。     

基于部首嵌入和注意力机制的病虫害命名实体识别

为了解决农业病虫害命名实体识别过程中存在的内在语义信息缺失、局部上下文特征易被忽略和捕获长距离依赖能力不足等问题,以农业病虫害文本为研究对象,提出一种基于部首嵌入和注意力机制的农业病虫害命名实体识别模型(Chinese agricultural diseases and pests named entity recognition with joint radical embedding and self attention, RS-ADP)。首先,该模型将部首嵌入集成到字符嵌入中作为输入,用以丰富语义信息。其中,针对部首嵌入设计了3种特征提取策略,即卷积神经网络(Convolutional neural network, CNN)、双向长短时记忆网络(Bidirectional long short term memory network, BiLSTM) 和CNN-BiLSTM;其次,采用多层不同窗口尺寸的CNNs层提取不同尺度的局部上下文信息;然后,在BiLSTM提取全局序列特征的基础上,采用自注意力机制进一步增强模型提取更长距离依赖的能力;最后,采用条件随机场(Conditional random field, CRF)联合识别实体边界和划分实体类别。在包含11个类别和24715条标注样本的农业病虫害自制语料上进行了实验。结果表明,本文模型RS-ADP在该数据集上精确率、召回率和F1值分别为94.16%、94.47%和94.32%;在具体实体类别上,RS-ADP在作物、病害、虫害等易识别实体上F1值高达95.81%、97.76%和97.23%。同时,RS-ADP在草害、病原等难以识别实体上F1值仍保持86%以上。实验结果表明,本文所提模型能够有效识别农业病虫害命名实体,其识别精度优于其他模型,且具有一定的泛化性。     

重庆市不同区县‘红阳’猕猴桃果实品质综合评价

[目的]对‘红阳’猕猴桃果实品质特征进行综合评价,为后期重庆市‘红阳’猕猴桃的种植布局及其果实品质的提升提供理论依据.[方法]以重庆市12个区县的‘红阳’猕猴桃果实为材料,测定分析单果质量、果形指数、可溶性固形物含量、可溶性糖含量、可滴定酸含量、维生素C含量、干物质含量、固酸比、糖酸比9个重要品质指标;采用主成分分析法...     

355份粳稻种质资源在新疆的遗传多样性分析及综合评价

为筛选出适合新疆种植的综合性状较优的水稻种质资源,对国、内外355份水稻资源的17个质量性状和20个数量性状进行综合评价。结果表明：在质量性状指标中穗抽出度、二次枝梗、穗立形态、叶片茸毛和分蘖力上表现出丰富的变异类型;数量性状变异范围为3.906%～57.519%,遗传多样性指数为1.713～2.067。通过对数量性状进行聚类分析将355份水稻种质资源划分为4大类群,类群Ⅰ属于极端粒型的特异性种质,共97份;类群Ⅱ属于潜在增产种质,共81份;类群Ⅲ属于晚熟极端种质,共94份;类群Ⅳ属于优质高产种质,共83份。20个数量性状利用主成分分析提取5个综合因子,累计贡献率为74.989%,各成分的贡献率分别为17.472%(PC1)、17.071%(PC2)、15.738%(PC3)、15.237%(PC4)和9.429%(PC5);水稻种质资源的综合得分范围为0.416 8～1.240 8,综合得分前10名的种质资源依次为‘21Y137’‘21Y271’‘21Y162’‘21Y280’‘21Y276’‘21Y87’‘21Y132’‘21Y254’‘21Y294’‘21Y318’,均属于类群Ⅳ...     

天丰优269的特征特性与栽培制种技术

天丰优269系江苏省沿海地区农业科学研究所用广东天丰A与自育恢复系盐恢269配组而成的三系杂交籼稻新组合。一般单产650 kg/667 m2左右,全生育期140~145 d,具有米质较优、适口性好、产量稳定、熟期适中,抗病性强等特点。该组合2006年1月通过江苏省农作物品种审定委员会审定,适于江苏省中籼稻地区中上肥水条件下种植。     

转Hu-IFN-α基因草鱼雌核发育F1的遗传配型分析

1998年,张学文等[1]通过分子重组,将人α干扰素(Hu-IFNα)基因编码序列克隆到鲤β肌动蛋白基因启动子下游,构建了能够在鱼体内表达的Hu-IFN-α基因重组分子,然后通过显微注射法将重组基因注射入草鱼1～2细胞期的受精卵内,获得转抗病基因草鱼.此后,该项目研究小组开展了一系列研究[2-6],对转Hu-IFN-α基因草鱼接种草鱼出血病病毒(GCRV991)的攻毒实验表明:转Hu-IFN-α基因草鱼对草鱼出血病病毒的抗性比普通草鱼提高了66%.但是,目前的转基因技术还无法使外源基因在鱼体内进行定点整合,目的基因在鱼体内的整合形式难以确定.     

大力加湖鲟鱼放养场水质理化特征

2004年5月、7月、9月和12月对大力加湖鲟鱼放养场水化学特征进行了调查,结果表明：大力加湖鲟鱼放养场水质良好,透明度变幅在45～90cm,pH值变幅在6.69～8.72,水呈中性。水型属重碳酸盐类,钙组Ⅰ型(C_Ⅰ~(ca))软水。水中主要营养元素含量,总氮含量较高平均为1.63 mg/L,磷酸盐含量较低平均为0.0339 mg/L。离子含量以冬季最高104.52 mg/L,春季最低51.64 mg/L。水中离子含量高低次序为HCO_3~-＞Ca~(2 )＞Cl~-＞Mg~2＞Na~(?) K~ 。探讨了水体的的营养类型和利用。     

黑龙江勤得利湾鱼类区系组成特征

初步调查勤得利湾鱼类共计58种，隶属于15科，其中鲤科鱼类为最多，43种，占水系鱼类总数74．13％；鳅科5种，占0．09％；偿科、鲶科各2种，各占0．035％；鲟科、狗鱼科、鳕科、鮨科、塘鳢科、鳢科、杜父鱼科各1种，共占0．017％。肉食性鱼类种类相对较多。通过比较分析，黑龙江勤得利湾鱼类组成与黑龙江中游表现出很大的相似性。     

兴凯湖红鳍原鲔消化酶活力和肌肉氨基酸组成的季节变化

研究了不同季节体质量为107．824-22．97g的兴凯湖野生红鳍原鲐（Cultrichthys erythropterus）肝胰脏、肠道消化酶活力及夏季昼夜变化和肌肉氨基酸种类组成、含量及其变化,探讨其营养生态特性及变化规律。结果显示：不同季节红鳍原铂的蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶的比活性显著不同（P〈0．05）,夏、秋季高于春、冬季,同一季节蛋白酶比活均显著高于淀粉酶比活（P〈0．05）;红鳍原鲐蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶比活的昼夜变化为：19：00～21：00、19：00和16：00～19：00时值最高,7：00、7：00和21：00值最低。红鳍原鲴肌肉由18种氨基酸组成,冬季缬氨酸、蛋氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸和赖氨酸五种必需氨基酸的含量显著低于春、秋季（P〈0．05）,而非必需氨基酸的含量无明显的季节变化;不同季节谷氨酸含量均最高,最低为胱氨酸。春、夏季氨基酸总量和必需氨基酸总量较高,秋、冬季较低;秋季鲜味氨基酸含量最低。研究表明,野生红鳍原鲐消化生理具有不同季节和日变化特点,氨基酸组成的季节变化提示：冬季鱼体代谢活动对肌肉组织中必需氨基酸的依赖。     

青海省玛柯河川陕哲罗鲑数量变动及原因分析

玛柯河是长江流域岷江水系一级最大支流大渡河干流在青海省河段的名称,为大渡河的正源。玛柯河是岷江上游川陕哲罗鲑的主要产卵繁殖水域。青海省渔业环境监测站自1998起通过数年对玛柯河实地考察,分析了川陕哲罗鲑在玛柯河分布数量锐减的原因,并就保护川陕哲罗鲑提出具体措施。