微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性

为探究四川省6个绵羊群体的遗传多样性,实验应用12个微卫星标记计算基因频率、有效等位基因数、杂合度及多态信息含量来评估群体内遗传多样度,通过遗传距离聚类图、群体结构推测图、主成分分析及群体间分子方差分析来评估群体间遗传关系。结果表明:6个绵羊群体在12个微卫星位点的平均有效等位基因数为3.006~3.176,平均多态信息含量变化为0.559~0.612,平均期望遗传杂合度为0.610~0.670;6个绵羊群体间的遗传关系与地理分布情况及育成史实不完全一致,但遗传距离聚类图、群体结构推测图和主成分分析结果均显示,6个绵羊群体中布拖黑绵羊类群与贾洛绵羊类群遗传关系更近;6个绵羊群体间方差组分F统计量结果为0.112 39,处于中度分化水平。     

绵羊IGFBP-6基因的克隆及序列分析

以凉山半细毛羊为研究对象,克隆了其胰岛素样生长因子结合蛋白6基因(IGFBP-6),采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对IGFBP-6蛋白的理化性质进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,绵羊IGFBP-6基因的CDS全长序列为711 bp,编码236个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为96%、84%、74%,氨基酸序列同源性分别为95%、80%、69%;IGFBP-6蛋白大小为24.9 ku,理论等电点(p I)为8.83。遗传进化分析结果显示,绵羊IGFBP-6基因与山羊、牛等哺乳动物关系较近,与鱼类的亲缘关系较远。IGFBP-6蛋白存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、14个磷酸化位点、3个N-糖基化位点和7个O-糖基化位点;二级结构分析结果显示,IGFBP-6蛋白无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠区域比例分别为77.54%、19.92%、2.54%;三级结构分析结果显示,IGFBP-6蛋白存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。     

凉山半细毛羊徽卫星标记多态性的研究

利用微卫星技术对凉山半细毛羊核心育种群206个个体第1、2、3、9号染色体上的18个微卫星位点进行研究,检测微卫星在凉山半细毛羊中的等位基因数,计算等位基因频率（Pi）、遗传杂合度（H）和多态信息含量（PIC）,分析了凉山半细毛羊微卫星DNA的多态性。实验采用的18个微卫星标记位点在凉山半细毛羊群体中,平均等位基因数为8.2778个（3～19个）,平均多态信息含量为0．591（O.253～0.833）,遗传杂合度均值为0．500（0.026～0.888）。表明该品种绵羊遗传多态性丰富,群体遗传变异较大,并且所选18个微卫星基因座适用于绵羊的遗传连锁分析研究。     

边新藏横交后代若干性状相关研究——毛囊性状、羊毛性状和体性状

本文用简单相关,因子分析和典范相关,分析了边新藏横交后代的33个数量性状间的相关关系。结果表明,所研究毛囊性状与羊毛性状间的相关除少数显著外,大多数不显著。毛囊性状与体性状间只有少数显著相关。羊毛性状除羊毛长度与毛囊内径比和外径比显著正相关,其它均无显著相关。因子分析和典范相关分析指出,这两种方法对绵羊育种中多性状关系研究比用一般相关更有意义。前者可用少量几个独立综合因子简化,众多观测性状的解释,同时保持原有全部观测性状的特征。典范相关既可分析多方面的成组性状间的相关,又能解释引起相关的原因,最后达到简化多性状分析之目的。     

河南汉族人群7个Y-STR基因座单倍型分析

分析河南汉族群体7个Y-STR基因座单倍型及其在法医学应用,利用PCR扩增检测7个Y染色体特异性的STR基因座,并用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染显色技术分析单倍型频率分布.结果显示:在河南汉族102名无关男性个体中7个基因座DYS438、DYS446、DYS391、DYS390、DYS458、DYS534、DYS426分别检出5、8、7、4、8、6、7个等位基因,共检出100种单倍型,其中98种为唯一的,单倍型基因多样性为0.999 612。7个Y-STR基因座具有很高的识别能力,对建立Y染色体STR数据库,研究群体遗传学和进行法医学鉴定有重要意义。     

Web of Science收录生物信息学数据库研究文献的分析

利用文献计量学方法,统计分析了1995～2007年Web of Science收录生物信息学数据库（bioinformatics databases）研究文献,探讨了生物信息学数据库文献研究的年代分布、语种、期刊分布、作者、文献类型、主题分布以及发文量前10名的国家和机构,以期了解世界各国在这一研究领域的进展情况。     

培育凉山半细毛羊的启示

有人预计世界人口到2020年将会高达79亿,2050年估计将增到100亿。如此快速的人口增长将会导致诸如营养不良和环境破坏等许多社会问题。21世纪人类在感受现代文明飞速发展的同时,还不得不面临着一个严酷的问题———贫困。据世界银行一项最新统计显示,目前全世界的贫困人口已经超过13亿,其中约有9亿多人口则因粮食总产量不足和农作物分配不均衡而导致营养不良,占目前世界人口的15%。据国家统计局公布的资料,我国乡村贫困人口从1978年的2.5亿减少到2000年的3209万人。但是在城市的“边缘”生活着1400万左右的城市贫困人口。我国到2030年,估计…     

主要家畜种基因组连锁图现状和展望

对主要家畜种基因组研究中用多态遗传标记,如微卫星标记、RFLP等,制作遗传连锁图现状进行了综述。在过去近半个世纪中,家畜基因组遗传连锁图的研究随着遗传标记技术,特别是DNA 微卫星等多态标记的迅速发展,取得了很大进展。其中主要介绍了主要家畜种牛、猪、绵羊、马和家禽基因组遗传连锁图发展的现状以及将来的发展趋势。     

动物育种中的方差组分分析及统计软件包

方差组分估测是分析变异来源和预测育种值的基础,国内外对其进行了大量的研究,对动物育种中方差组分的估测方法及统计分析软件包作了一个简单的综述.     

绵羊IGFBP-5基因的克隆及序列分析

为了克隆IGFBP-5基因的CDS序列及其生物信息学分析,试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-5基因的CDS全序列,并用生物信息学方法深入分析其序列。结果表明:IGFBP-5基因的CDS序列为816 bp,编码271个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为97%、94%、89%,氨基酸序列同源性分别为98%、98%、95%,Gen Bank登录号为EU727460.1;IGFBP-5基因的氨基酸分子质量为30.3 ku,理论等电点(p I)为8.56;进化分析显示与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与蟾、鱼类等亲缘关系较远;IGFBP-5基因存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、22个磷酸化位点、2个N-糖基化位点和3个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为66.42%、22.51%、11.07%;三级结构分析显示存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。