钢鹅mtDNA全序列的克隆和生物信息学分析

【目的】探究钢鹅的遗传多样性和系统进化的关系。【方法】参照NCBI上近缘物种线粒体基因组序列设计18对引物,运用DNA克隆和测序技术获得钢鹅mtDNA基因组序列,对其进行生物信息学分析。【结果】钢鹅mtDNA基因组序列总长16 739bp,其中含有22个tRNA基因、2个rRNA基因、13个蛋白质编码基因和1个非编码控制区域(D-loop区),基因组成及排列顺序与其他鸟类类似,A、T、C和G碱基含量分别为30.18%,22.54%,32.18%和15.10%。tRNAScan-SE Search Server在线软件分析表明,tRNA均是4个恒定臂的三叶草二级结构。对钢鹅mtDNA D-loop区序列的分析发现,其中含有LSP/HSP、ETAS1-2、Goose hairpin、E-box、F-box、D-box、C-box、CSB1-box及CSB-like保守框。用MEGA 6.0采用最大似然法基于D-loop区和线粒体全序列构建进化树,遗传进化分析表明,钢鹅与鸿雁、灰雁的亲缘关系最近。【结论】获得了钢鹅mtDNA全序列,进一步明确了其生物学信息。     

IGF1R和IGF2R基因在鸭脂肪组织中的发育表达模式比较

为比较胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)和胰岛素样生长因子2受体(IGF2R)在鸭脂肪组织发育中的作用,利用RT-PCR技术,扩增出鸭IGF1R、IGF2R部分编码区序列,并采用荧光定量PCR检测IGF1R、IGF2R基因mRNA丰度在1～8周龄鸭腹脂、背皮和肝脏中的表达变化。成功获得了鸭IGF1R和IGF2R部分序列,长度分别为798 bp和716bp。腹脂中IGF1R和IGF2R基因的表达都呈先上升后下降的变化规律,4周龄时表达量最高;皮下脂肪中IGF1RmRNA的表达规律是在1周龄时极显著高于其他各时间点(P<0.01),2周龄时显著下降,随后缓慢上升到4周龄时达到最高,之后又逐渐下降。IGF2R mRNA的表达水平呈先上升后波动下降的趋势,以4周龄时表达量为最高,5～8周龄时波动下降;肝脏中IGF1R和IGF2R基因的表达规律相似,表达量总体都呈现1周龄后急剧下降而后平稳的趋势。综合上述结果可知,IGF1R和IGF2R基因对肝脏的脂肪合成以及肝外脂肪组织增殖、分化的调控具有差异性。     

鹅GnIH基因克隆及其在卵泡发育中的表达规律研究

为研究促性腺激素抑制激素(Gonadotropin-inhibitory hormone,GnIH)基因表达与鹅卵泡发育间的关系,对鹅GnIH基因的CDS区序列进行了克隆与分析,并采用荧光定量PCR检测了该基因在产蛋高峰期鹅的不同大小卵泡中的表达量.序列分析结果表明,所获得的鹅GnIH基因CDS区长471 bp,编码157个氨基酸,与已知的其它鸟类GnIH相似性达87％.鹅GnIH前体包括3个“LPLRF”,具有典型的“LPXRF-酰胺”基序.荧光定量结果表明,鹅GnIH在所有不同大小的卵泡中均有表达,其表达量在卵泡发育过程中呈现规律性变化,总趋势是先增高后降低,且在直径4～5 mm的卵泡中表达量最高.研究结果显示,鹅卵泡GnIH基因的表达与卵泡选择性发育有关,且该选择过程可能发生在直径为4～5mm的卵泡.这一研究可为探讨季节性繁殖禽类卵泡发育的调控机理奠定基础.     

鸭Akirin2基因克隆、序列分析与组织表达特性研究

为研究Akirin2基因在鸭生物体中的功能,本试验通过RT-PCR扩增了鸭Akirin2基因,并采用荧光定量PCR方法检测了其在40日龄北京鸭不同组织中的表达差异.序列分析结果表明,鸭Akirin2基因CDS区全长594 bp,编码197个氨基酸,氨基酸水平上与鸡的相似性达99%,其氨基酸序列二级结构具有哺乳动物Akirinl和Akirin2氨基酸二级结构域的共同区域;荧光定量结果表明,鸭Akirin2在肌肉和免疫器官脾脏中都有表达.以上结果支持了鸟类Akirin2可能具有与哺乳动物中Akirin1和Akirin2共同功能的观点,为进一步研究Akirin2基因在鸟类肌肉发育中的作用奠定了基础.     

以科技之力,为产业兴旺保驾护航 ——记贵州省铜仁市印江县科技特派员梁正其

梁正其,铜仁学院农林工程与规划学院副教授,贵州省水产学会理事.多年来,他致力于铜仁市以及贵州省生态渔业养殖技术试验示范研究及推广应用和水产动物疾病防控指导、农业产业发展帮扶等相关培训工作.     

鸭胚卵内注射rhIGF-1对其出壳后卵泡抑素基因表达及胸肌发育的影响

本研究通过卵内注射技术,注射120、100、80和0(对照组)ng.mL-1的重组人胰岛素样生长因子(rhIGF-1)到孵化中的鸭胚蛋白中,并检测2日龄雏鸭胸肌发育和卵泡抑素(FST)表达的情况,探讨不同浓度rhIGF-1对FST表达及鸭胸肌发育的影响。结果表明,卵内注射不同浓度的rhIGF-1对雏鸭体质量的影响不显著(P>0.05);但雏鸭胸肌质量、胸肌率随rhIGF-1注射浓度的增加而升高,120 ng.mL-1处理组胸肌质量、胸肌率相对对照组有显著差异(P<0.05);120 ng.mL-1的rhIGF-1处理组肌纤维直径和横切面积最大,显著高于对照组(P<0.05);FST基因在雏鸭胸肌中的表达水平也随rhIGF-1的浓度增大而升高,其中以120 ng.mL-1处理组FST基因表达量最高,显著高于其它各处理组(P<0.05)。结果表明IGF-1对FST的调控作用以浓度依赖的方式进行,高浓度的IGF-1导致FST高表达并促进肌肉发育。     

鸭Mef2bnb基因的克隆及其mRNA丰度在肌肉组织中的发育性表达变化

旨在克隆鸭肌肉增强因子2b邻居基因(Myocyte enhancer factor 2Bneighbor,Mef2bnb)的cDNA全序列,并对其进行分析,研究该基因在肌肉组织中的发育性表达规律。利用RACE技术从鸭腿肌中克隆出Mef2bnb的全长cDNA序列,应用Q-PCR技术检测了自鸭胚胎10d至出壳1周肌肉组织中Mef2bnb基因的发育性表达。结果显示:该序列全长935bp,包括5′非编码区(5′UTR)51bp和3′非编码区(3′UTR)518bp,完全开放阅读框(ORF)366bp,可编码121个氨基酸残基,结构分析表明,该肽链没有信号肽,第1～117号氨基酸为鸭Mef2bnb基因与其它动物高度保守的NEP结构域;Mef2bnb基因在胸肌、腿肌和心脏3种肌肉组织中不同阶段均有不同程度的表达,而其在胸肌中的表达量均高于同时期在腿肌中的表达量,推测鸭Mef2bnb基因可能具有促进Ⅱ型纤维形成的功能,另外该基因在心脏的高表达表明其可能与心脏的发育有关。本研究结果将为进一步研究鸭Mef2bnb结构及其在肌肉组织中的作用奠定基础。     

肉鸭Six1基因第2外显子单核苷酸多态与屠体性状的相关性分析

Six1基因是调控肌肉形成过程中的重要基因。为研究Six1作为肉鸭生长发育候选基因的可行性,本实验以42日龄大型肉鸭为研究对象,采用PCR-SSCP技术检测肉鸭Six1基因第2外显子的多态性,并对所检测到的多位点组成的基因型与肉鸭屠体性状进行关联性分析。结果表明:在鸭Six1基因的编码区第729 bp处存在C→T突变,属同义突变,该突变位点在大型肉鸭群体中表现为AA与AB 2种基因型。肉鸭AA和AB基因型间,胸肌重、腿肌重和其他屠体性状差异不显著(P>0.05)。以上结果表明,鸭Six1基因第2外显子区没有适用于遗传标记的多态位点。     

鹅ATP5E基因cDNA克隆及生物信息学分析

线粒体ATP酶合成体ε亚基(ATP synthase,H+transporting,mitochondrial F1 complex,epsilon,ATP5E)是ATP合成酶催化中心的最小亚基,在能量代谢过程中具有重要作用。本研究利用RT-PCR和RACE技术获得鹅ATP5E序列,并结合生物信息学方法对鹅ATP5E的序列进行深入分析。结果表明:克隆获得鹅ATP5E基因序列全长为347 bp,包括156 bp的编码区序列,编码51个氨基酸。同源性分析发现,鹅ATP5E核苷酸序列与推测氨基酸序列与原鸡的同源性最高,分别达到87.74%和89.58%,而与其他物种之间的一致性差异稍大。氨基酸序列分析发现该基因编码蛋白理论分子量为水溶性蛋白,相对分子量为5.79 ku,理论等电点为10.01,无信号肽序列和跨膜区,预测含有4个磷酸化位点,二级结构以α螺旋为主,预测ATP5E蛋白主要在能量代谢和脂肪酸代谢过程中有着关键作用。以上研究为进一步探讨ATP5E基因在鹅肝脂肪变性过程中的功能研究奠定了信息基础。