水稻遗传育种相关生物信息数据库和工具的研究进展

水稻Oryza sativa L.是主要的粮食作物，也是单子叶植物研究的模式植物。面对日益严峻的环境和人口压力，培育高产、优质、环境适性强的水稻品种是解决当前粮食安全问题的有效途径。随着多组学技术的快速发展，积累了海量的水稻遗传育种相关的数据。生物信息数据库和在线分析工具是存储这些数据的载体，用以整合、可视化和共享数据，并为数据的深入挖掘和利用提供工具，从而为育种决策提供数据支撑。本综述系统梳理了近20年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具，并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结。最后，讨论了现有的水稻生物信息数据库和在线分析工具的问题与不足，并对它们在大数据和人工智能时代的发展方向进行了展望。     

长期连续施用生物质炭对土壤肥力、小麦产量和微生物群落结构的影响

摘 要：基于始于2010年的长期田间试验，研究了每年6 t/hm2 玉米秸秆还田(Straw)，每年2.4 t/hm2 (BC1)、6 t/hm2 (BC3)和12 t/hm2 (BC5)玉米秸秆生物质炭添加对土壤肥力、小麦产量和微生物群落结构的影响。结果表明：与不添加玉米秸秆及其生物质炭的处理（CK）相比，BC5处理显著提高了小麦产量，三个剂量生物质炭处理平均增加小麦产量15%。经过11年的连续添加，土壤容重（BD）从CK的1.06 g/cm3降低至BC5处理的0.73 g/cm3，总碳（TC）从CK的14.9 g/kg 增加至BC5处理的83.8 g/kg。土壤有效氮（AN）、速效钾（AK）和有效磷（AP）均随施用量增加而增加，表现为BC5 > BC3 > BC1 > Straw ≥ CK。本研究中，长期连续施用玉米秸秆及其生物质炭没有显著改变细菌群落多样性，而BC5处理略微增加真菌群落多样性。PICRUSt2功能预测表明生物质炭处理显著增加了碳固定相关功能基因丰度，而降低碳降解相关功能基因丰度。     

稀释中的深化效应：城镇化对农村人力资本积累的影响

城镇化与农村人力资本积累之间的关系将会影响到乡村振兴战略和城乡融合发展的成败。基于理论分析和2005—2017年中国省级面板数据,采用固定效应、面板工具变量估计方法检验城镇化对农村人力资本积累的因果效应和内在机制。结果表明：（1）在控制其他变量的条件下,城镇化对农村人力资本积累具有显著的正向影响,城镇化率每提高一个百分点,农村人均人力资本大约增加1200~1300元;（2）城镇化强化了农村家庭人口质量偏好,农村人力资本投资持续增加,即城镇化对农村人力资本的深化效应是借助人口质量偏好机制而现实的。上述发现进一步澄清了城镇化与农村人力资本积累之间的逻辑关系,并为政府部门在设计和完善相关政策方面提供理论启发和经验证据。     

大豆品种对苜蓿花叶病毒的抗性鉴定

近年来，由苜蓿花叶病毒（alfalfa mosaic virus,AMV）引起的大豆病害在东北地区时有发生，并有流行扩大之势。研究通过病情等级和反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）对197个北方大豆品种进行抗病性筛选。结果表明，AMV可侵染所有测试大豆品种，无对AMV完全免疫的抗性品种。综合病情等级和RT-PCR结果，其中30份大豆品种耐病性较好，在两次接种试验中均未表现出明显AMV症状，是AMV流行区域大豆栽培和育种的良好抗性资源。     

长期连续秸秆还田和生物质炭施用对稻田N2O排放的影响

为了评估麦季多年连续秸秆还田和生物质炭施用对稻麦轮作系统下稻田N₂O排放的影响，于2010年麦季开始开展了为期11 a的麦季秸秆还田和生物质炭施用定位试验。试验共包括5个处理：无玉米秸秆还田和生物质炭施用(CK);6 t/(hm²·a)玉米秸秆还田(CS);2.4 t/(hm²·a)生物质炭施用(BC1);6 t/(hm²·a)生物质炭施用(BC2)和12 t/(hm²·a)生物质炭施用(BC3)。结果表明，BC2和BC3处理较CK均显著提高了土壤碱解氮、有效磷、速效钾、易氧化碳、可溶性有机氮和土壤微生物生物量氮含量。CS、BC1和BC2处理水稻生长季N₂O总排放量与CK没有显著差异，但是BC3处理的N₂O总排放量比CK提高了245.31%，并显著高于其他处理。BC3处理的N₂O总排放量和施氮肥后N₂O排放高峰期的累积排放量分别比CK提高了3.84 kg/hm²和3.3...