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为深入开展中华蜜蜂相关研究提供参考信息和基础,利用已获得的纳米孔(Nanopore)测序数据对中华蜜蜂Apis cerana cerana的酚氧化酶(phenoloxidase, PO)和丝氨酸蛋白酶(serine protease, SP)相关基因和全长转录本进行发掘和分析。通过Blast工具将中华蜜蜂所有全长转录本比对KEGG和Nr数据库以筛选出PO和SP相关基因和全长转录本。采用gffcompare软件将PO和SP相关全长转录本与东方蜜蜂参考基因组(ACSNU-2. 0)已注释基因进行比较以优化结构。使用Astalavista软件鉴定PO和SP相关基因的可变剪接(alternative splicing, AS)事件,再利用IGV浏览器进行结构可视化。通过PCR验证AS事件的真实性。利用TAPIS pipeline预测和分析可变多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)位点,并通过TBtool软件鉴定APA位点上游的基序(motif)。鉴定到中华蜜蜂PO和SP相关的42个基因与146条转录本。优化了16个参考基因组已注释PO和SP相关基因的结构,其中5′端延长和3′端延长的基因均有7个,5′端和3′端同时延长的基因有2个。鉴定到PO和SP相关的10个基因的389次AS事件,其中最丰富的AS类型是5′端可变剪接。PCR结果证实了2次AS事件的真实性。共鉴定到34个PO和SP相关基因含有1个及以上的APA位点,其中含有3个APA位点的基因数量最多;在APA位点上游鉴定到多个motif,一致性序列为:GGHKSYWSHHTRATWTCNBHDMRRYWYRTNYTVACNGCKGCDCAYTGYR。鉴定到中华蜜蜂PO和SP相关的42个基因和146条全长转录本,优化了东方蜜蜂参考基因组已注释的PO和SP相关基因结构,并发掘出PO和SP相关基因的389次AS事件和237个APA位点。 相似文献
62.
杂交水稻重穗型组合的增产潜力及其选育初探 总被引:3,自引:0,他引:3
近年来,杂交水稻重穗型组合很受群众欢迎,种植面积越来越大。从杂交稻组合方面分析了重穗型组合的增产潜力及提出了今后选育重穗型组合的一些设想和做法。 相似文献
63.
64.
【目的】建立荷斯坦奶牛瓜氨酸血症的PCR-SSCP检测方法。【方法】根据GenBank公布的荷斯坦奶牛精氨酸琥珀酸合成酶基因(Ass)第5外显子核苷酸序列(登录号:M2619),设计并合成1对特异性引物,应用PCR-SSCP方法检测北京市周边牛场173头荷斯坦奶牛瓜氨酸血症的隐性基因,并利用PCR-RFLP和DNA序列测定验证检测结果的准确性。【结果】PCR-SSCP检测的173头奶牛中有1头是瓜氨酸血症携带者,与PCR-RFLP和DNA序列测定结果一致,携带率为0.58%。【结论】建立了荷斯坦奶牛瓜氨酸血症的PCR-SSCP检测方法,该方法简单快捷、准确性高、成本低廉,适合荷斯坦奶牛的大规模检测。 相似文献
65.
66.
贵德黑裘皮羊耳成纤维细胞系的建立和生物学特性的研究 总被引:4,自引:1,他引:4
以贵德黑裘皮羊耳缘组织为材料,采用组织块贴壁培养法和细胞冷冻技术成功构建了成纤维细胞系,并对培养细胞进行了形态学、生长动力学观察、细胞活力测定、核型分析和微生物检测。结果表明:细胞群体倍增时间(PDT)约为36h,冻存前细胞活力为96.2%,以DMEM/F-12+20%FBS中添加10%DMSO冻存成纤维细胞,解冻后细胞活力为93.6%,24h后的贴壁率为85%。在传代10次之前,细胞染色体中二倍体(2n=54)占主体,约为82%~90%,细菌、真菌、病毒、支原体检测为阴性。该细胞系的建立,使贵德黑裘皮羊这一国家重要种质资源在细胞水平上保存下来,也为体细胞克隆等研究提供了理想的生物材料。 相似文献
67.
羊超数排卵影响因素的分析 总被引:4,自引:0,他引:4
超数排卵(简称超排)是以各种外源性促性腺激素诱发动物卵巢的多个卵泡发育并排出多个具有受精能力卵的过程。超排是胚胎移植最重要的技术环节,对于提高优良母畜的繁殖能力和品种改良具有重要意义,同时也为动物克隆和转基因动物生产等提供卵子和胚胎来源。目前,尽管超数排卵的方法已广泛应用,但超排的胚胎回收率和可用胚胎数还不稳定,影响了胚胎移植的进一步推广和应用。本文通过对超排影响的动物品种、个体差异、激素、超排处理方案、采胚方法、重复超排、年龄、营养状况、季节等诸多因素的分析,旨在为提高动物的超排效率提供借鉴。1影响超… 相似文献
68.
正随着青年鸡养殖如雨后春笋般的发展,良莠不齐的青年鸡也应运而生。由于青年鸡好与坏难以清晰判定的生物学特殊性,青年鸡场与养殖户(场)对各自利益的坚守及养殖户(场)的观念、能力的限制,使得好的青年鸡卖一个好的价格和养殖户(场)能买到物有所值的青年鸡都变得十分困难。目前,给高端青年鸡场和优质青年鸡一个明确的定义就显得十分必要。1明确高端青年鸡场应具备的条件1.1有一个思想意识超前的好老板老板的理念十分重要,要具有打造品 相似文献
69.
<正>一说到"DIY"这个词,喜欢接触数码产品的朋友大都会联想到台式电脑DIY攒机,但今天要说的这件事儿可和台式电脑没有太多关系。此前网络上曾曝光过谷歌在出售摩托罗拉手机业务,但依旧保有模块化手机项目Project Ara,不过此后就没有了下文。在最近这几天,Project Ara似乎又有所起色。依据美国《时代》报道称,谷歌Project Ara 相似文献
70.
一、前言近交在猪杂交育种上,对于分化群体,纯合基因,固定优良特性,提露有害性状有重要作用。但近交往往会导致繁殖力、生活力、生长速度及相关的机能衰退。甘肃黑猪是一个肉脂兼用型品种,近年来开始向瘦肉型转化,为了加速瘦肉系群体继代选育的进程,开展了小群体近交试验,旨在探明近交对生产性能的影响,为合理地利用近交,科学地指导育种和生产提供依据。 相似文献