影响藏猪与大约克夏猪肌肉品质的lncRNA的筛选及功能分析

旨在分析藏猪和大约克夏猪(180日龄)背最长肌组织中与猪肉质性状相关的长链非编码RNA (lncRNAs)和基因,探讨lncRNAs在猪肉品质中的分子调控作用,为猪肉质性状的改良提供理论依据.本研究根据先前公布的数据,以饲养在相同条件下的180日龄健康藏公猪(n-3)和大约克夏公猪(n-3)为研究对象,收集背最长肌肉品...     

采精频率对不同品种公猪精液品质的影响

为了探讨采精频率对杜洛克、大白、长白种公猪精液品质的影响,并确定不同品种种公猪的最佳采精频率,试验选取12月龄体重相近的健康杜洛克、大白、长白种公猪各6头,分5个不同采精频率阶段采精,即第1阶段(A组)为1次/1 d,第2阶段(B组)为1次/2 d,第3阶段(C组)为1次/3 d,第4阶段(D组)为1次/4 d,第5阶段(E组)为1次/5 d,每个阶段采精3次,一个阶段采精完成后,公猪休息一周,然后开始下一个阶段采精,采精完成后对每份精液的精液量及精子密度、活率和畸形率指标进行统计分析。结果表明：三个品种种公猪精液量及精子密度和活率随采精频率的降低均总体呈升高趋势,精子畸形率随着采精频率的降低呈现下降趋势;杜洛克种公猪C组的精液量、精子密度、精子活率较佳,E组精子畸形率最低,但与B、C、D三组精子畸形率差异不显著(P>0.05);大白种公猪B组精液量较佳,D组精子密度较佳,C组精子活率较佳,E组精子畸形率最低,与D组精子畸形率差异不显著(P>0.05);长白种公猪C组精液量较佳,D组精子密度较佳,C组精子活率较佳,E组精子畸形率最低,与D组精子畸形率差异不显著(P>0...     

确山黑猪HOXA5基因组织表达及生物信息学分析

【目的】探究确山黑猪HOXA5基因的组织表达情况和HOXA5蛋白的结构功能。【方法】利用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)技术检测HOXA5基因在确山黑猪各组织中的表达情况,并与大白猪皮下脂肪和背最长肌进行对比;以确山黑猪皮下脂肪组织为cDNA模板,克隆确山黑猪HOXA5基因编码(coding sequence, CDS)区序列,利用生物信息学软件分析确山黑猪HOXA5基因CDS区序列及其编码蛋白质的结构和功能。【结果】HOXA5基因在确山黑猪肺脏中表达量最高,其次是肝脏和皮下脂肪,且显著高于其他组织。同时,HOXA5基因在确山黑猪皮下脂肪组织中表达量显著高于大白猪。通过对确山黑猪HOXA5基因进行克隆及生物信息学分析,获得的确山黑猪HOXA5基因CDS区全长813 bp,编码270个氨基酸,与牛、绵羊、马、黑猩猩、小鼠、人和鸡的同源性分别为99.1%、99.0%、98.8%、97.8%、97.4%、95.6%和81.3%。确山黑猪HOXA5蛋白分子质量为29.28 kD,主要位于细胞核内,属于酸性、亲水性蛋白,且不具有跨膜结构和...     

河南地方猪mtDNA D-loop序列遗传多样性 及系统进化分析

为了解河南省地方猪种的遗传资源状况,探究猪种间的亲缘关系,对河南省地方猪种(南阳黑猪、确山黑猪、淮南猪、豫西黑猪)及2个参考猪种(莱芜黑猪、二花脸猪)和野猪共计282个样本的mtDNA D-loop序列进行PCR扩增及序列测定,并结合GenBank中3个国外猪种(杜洛克猪、长白猪、约克夏猪)的38条mtDNA D-loop序列,进行单倍型、遗传多样性、系统发育树、网络分析、歧点分布分析。结果表明,河南省地方猪4个品种共236条序列,定义了32种单倍型,单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.788～0.854、0.001 56～0.004 55。构建的NJ系统进化树将所有样本分为2个独立分支,一支包含所有河南各猪种和部分约克夏猪,另一支全部为引进猪种,表明河南地方猪和3个国外猪种具有2个明显不同的母系起源。网络中介图和歧点分布显示,在历史驯养过程中,整个河南地方猪群体曾经历过群体扩张事件。说明河南地方猪种具有较为丰富的遗传多样性,且彼此之间有一定的基因交流。     

大白母猪乳头数全基因组关联分析

乳头数是评价母猪繁殖性能的重要参数,是大白猪选种的重要指标之一.本研究利用1118头大白猪母猪群体,利用50K SNP芯片对该群体进行基因分型,采用单变量混合线性模型的全基因组关联分析(GWAS)及Fst选择信号分析,筛选该群体的左乳头数、右乳头数和总乳头数性状相关基因.结果显示:GCTA软件计算左、右、总乳头数性状的...     

不同品种、季节和月龄对公猪精液品质的影响

【目的】探究不同品种、采精季节和采精月龄对法系公猪精液品质的影响,比较不同品种公猪精液的常温保存效果。【方法】选取278头法系杜洛克猪、长白猪和大白猪为试验对象,收集某种公猪站2021年17 960条精液记录数据,采用一般线性模型与方差分析探究品种、采精季节和采精月龄对精液体积、精液密度、精子活力及总精子数的影响;同时于夏季从各品种中分别选取15份精子活力≥90%、前向性运动≥80%精液,稀释后进行为期7 d的常温保存试验,比较不同品种公猪精液常温保存效果。【结果】长白猪精液体积、总精子数均显著高于杜洛克猪和大白猪(P<0.05),杜洛克猪精液密度显著高于长白猪和大白猪(P<0.05),精子活力显著低于长白猪和大白猪(P<0.05)。随着常温保存时间的延长,各品种公猪精液精子活力和前向性运动逐渐降低,其中长白猪精液在夏季常温保存效果最好,杜洛克猪最差。各品种公猪精液体积在秋、冬季均显著高于春、夏季(P<0.05),总精子数春、冬季均显著高于夏、秋季(P<0.05),精液密度在春季显著高于其他季节(P<0.05),各品种公猪精子活力均在冬季最高、夏季最...     

不同初配日龄对大白母猪繁殖性能的影响

为研究不同初配日龄对大白母猪繁殖性能的影响.试验选择1538头初配日龄在180～300 d的大白母猪5974条繁殖记录,初配日龄以30d为单位,划分为4个试验组后进行单因素方差分析.结果 显示:母猪初配日龄在210～240 d的产活仔数显著高于初配日龄为180～210 d的母猪(P＜0.05),而断奶窝重显著高于初配日...     

案例教学法在家畜育种学教学中的应用

分析了家畜育种学教学过程中存在的问题和案例教学法在教学中的作用。采用最新研究成果,精心挑选科研团队培育的新品种作为教学案例,讨论了案例教学法在家畜育种学课程中的实施过程和应用效果。     

使用GWAS和Meta-GWAS鉴定与猪甘油三酯含量相关候选基因

本实验旨在挖掘影响猪甘油三酯(TG)含量的有效SNP位点以及候选基因,为生产优良猪肉的选育工作提供理论依据。收集Beadchips 60K SNP芯片分型莱芜猪、二花脸猪和杜洛克×(长白×约克郡)(DLY)群体共1 256头猪的数据,并运用FarmCPU模型对1 256头猪的TG含量进行全基因组关联分析(GenomeWide AssociationStudy,GWAS)及Meta-GWAS分析。GWAS分析结果显示：共检测到32个与TG含量相关的SNP位点,其中莱芜猪中有6个(P<1.8×10^-5),二花脸猪中有8个(P<1.8×10^-5),DLY中有18个(P<1.8×10^-5);Meta-GWAS分析结果显示：发现2个与TG含量相关的新SNP位点;并利用Ensembl数据库,在显著SNP位点上下游0.5 Mb区域内进行基因鉴定,一共发现8个与TG含量调控有关的候选基因,其中在莱芜猪中发现的基因为PDCD6IP;在二花脸猪中发现的基因为CD24、ADGRF5和ADAMTS5;在DLY中发现的基因为DM...     

部分河南地方猪与藏猪选择信号分析

本实验旨在对部分河南地方猪和藏猪筛选全基因组选择信号,研究它们之间的遗传分化情况和基因交流情况。实验基于淮南猪、南阳黑猪、确山黑猪、河南野猪、藏猪以及中国野猪6个猪品种共计66个个体的全基因组重测序数据,通过多种软件对重测序数据进行群体结构分析和选择信号分析,同时利用TreeMix软件对河南地方猪与藏猪进行基因流分析。结果显示：河南地方猪、藏猪与野猪的遗传关系比较远,而河南地方猪和藏猪之间的遗传关系较近。通过群体分化指数（Fixation indices,Fst）方法进行选择信号分析,并对分析结果进行基因功能注释和富集分析,共找到369个基因,GO和KEGG富集分析显示,这些基因主要富集于RNA聚合酶II对转录的负调控通路、神经营养因子信号通路等通路,通过查阅文献得到47个与重要性状相关的候选基因。基因流分析显示藏猪与确山黑猪有基因交流情况。