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为了解白掌株型突变的转录组序列功能和SSR位点分布特征,并探索与株型关联的SSR位点信息。以对照‘美酒’及其小株型突变体为材料,选取叶片、叶柄、佛焰苞片、苞梗组织进行高通量PE150的转录组测序和序列筛选;开展unigene的GO、KOG、KEGG功能注释及分类;开展SSR位点筛选及批量设计引物;发掘差异表达含SSR位点unigene的GO、KEGG富集功能信息。结果显示,白掌转录组共筛选127 153个unigene,其中有41 370个获注释,包含GO注释25 925个、KO注释12 727个、KOG注释21 487个;从18 636个unigene中发掘出28 046个SSR位点,出现频率22.06%,包含有193种重复基序,其中以二核苷酸AG/CT(14 305, 51.01%)、AC/GT (3 907, 13.93%)、AT/AT (2 322, 8.28%)和三核苷酸AAG/CTT (2 087, 7.44%)居多,基序重复次数以5~10次重复占优势;从18 636个unigene中筛选17 070个批量设计出51 210对SSR引物,有效扩增和多态性好。差异转录组结合S... 相似文献
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研究荸荠球茎的组织培养过程,包括前处理、诱导、增殖、生根、育苗移栽。结果表明,消毒前处理有效降低了诱导萌发的污染率。以主芽为外植体进行诱导可有效缩短萌动时间,主芽的诱导萌动时间为10d左右,而侧芽的诱导萌动时间为20 d左右,且主、侧芽的萌动污染率也有差异,分别为50.5%,43.5%。当荸荠在6-BA浓度0.5~1.0 mg.L-1的培养基中增殖时,荸荠试管苗长势健壮,丛生芽增殖3~4倍;当在6-BA浓度2.0~6.0 mg.L-1的培养基中增殖时,荸荠试管苗长势较弱,丛生芽增殖5~10倍,且丛生芽增殖差异在10 d左右时就已呈现出来;当6-BA浓度低于2.0 mg.L-1时,荸荠试管苗在增殖的同时亦进行生根,减少了褐化现象的产生。本研究提供了一套快速繁殖荸荠组培种苗体系,可有效缩短时间,为快速筛选优秀的种质资源提供技术支撑,同时为高效快繁优质荸荠种苗提供技术流程,服务现代农业。 相似文献
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