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【目的】对高温胁迫下萝卜幼苗进行转录组测序分析,筛选不同耐热性萝卜品种间的差异表达基因,为阐明萝卜幼苗响应高温胁迫的分子机制提供理论参考。【方法】以耐热萝卜品种1116T和热敏感萝卜品种Wr129为对象,对其进行高温(40℃)胁迫处理0(常温,对照)和24 h,提取各时间点样品总RNA进行转录组测序,以|log2 FoldChange|≥1,P<0.05且TPM≥10为标准,筛选出差异表达基因(DEGs),并进行GO功能注释和KEGG代谢通路富集分析。【结果】随着高温胁迫时间的增加,Wr129和1116T幼苗茎叶逐渐发生萎蔫,胁迫24 h后Wr129叶片萎蔫下垂且干枯变黄,而1116T叶片轻度萎蔫下垂,仍保持绿色。12个文库共获得81.45 Gb Clean data,平均有62.30%的reads比对到萝卜参考基因组的一个位置。从2个不同耐热性品种中共鉴定到2701个差异表达基因。GO功能注释结果显示,2629个差异表达基因在GO数据库中得到注释,其中,有559个差异表达基因被注释为细胞组分类别中的叶绿体被膜、叶绿体基质和叶绿体类囊体3个条目,470个差异表达基因被注释为与胁迫响应相关的生物学过程。KEGG代谢通路富集结果显示,1166个差异表达基因富集到124条代谢通路,其中,有74个差异表达基因富集到光合作用和光合作用-天线蛋白代谢通路,23个基因富集到卟啉和叶绿素代谢通路,大部分基因在高温胁迫下被诱导; 35个差异表达基因富集到谷胱甘肽代谢途径,其中14个谷胱甘肽-S-转移酶基因(GSTs)在高温胁迫下上调表达。高温胁迫24 h,Wr129和1116T幼苗叶片PSII的最大光化学效率(Fv/Fm)和总叶绿素含量均下降,但1116T的下降幅度较小。【结论】 Wr129和1116T的耐热性存在明显差异,其原因是1116T植株可通过调控光合作用和抗氧化系统相关基因的表达,减缓Fv/Fm和叶绿素含量下降速率,从而提高植株对高温胁迫的耐受能力。 相似文献
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根结线虫病是我国瓜类蔬菜的主要病害,选育抗病品种是有效防控该病的主要措施。结合田间调查与室内检测重复验证,采用病情指数、繁殖系数等多种抗根结线虫评价方法对丝瓜抗性进行分析,以便为瓜类蔬菜根结线虫多指标抗性评价提供科学参考和借鉴,为丝瓜与其他瓜类蔬菜抗根结线虫的材料创新与新品种(含砧木)培育奠定基础。综合评价供试丝瓜品种对南方根结线虫的抗性水平,经形态学特征鉴定,重庆地区丝瓜的病原线虫为南方根结线虫(Meloidogyne incognita);6个丝瓜品种1、2、5、6、32、33号的田间病情指数分别为65.3、12.5、55.3、18.9、32.0、34.3,根际线虫繁殖系数分别为1.28、0.46、1.12、0.57、0.73、0.78,每5 mm根段组织线虫数量分别为34、4、18、7、9、10 条,每100 mm幼嫩根段上早期平均检出根结数分别为12.2、2.1、14.8、0、0、0。2020年田间和温室试验结果与2019年抗性评价结果基本一致;以上4项指标相互印证,趋于一致,能够作为抗南方根结线虫的评价指标;4项指标数据综合评价,判定2号、6号材料为高抗(HR),32号、33号材料为抗性(R),1号、5号材料为感病(S)。 相似文献
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一、选育经过及示范种植春帅丝瓜的母本为选用合川伏皱丝瓜优良单株,经多代系选而成。该自交系早中熟,始瓜节位12~15节,雌性强,瓜条长而大、表皮乳白色、深皱褶、蜡粉厚,较耐寒耐热。父本5-F-21-54由湖南肉丝瓜经多代分离、单株系选而育成,性状稳定,早熟,始瓜节位4~6节,瓜皮绿色、光滑,瓜条粗短、顺直、蜡粉少。1993~1998年进行自交系选育,1999年开始进行配合力测定和组合配制,普通配合力以5-F-21-54较高,特殊配合力以“合川伏皱丝瓜×5-F-21-54”组合较好。2000年和2001年春、秋季分别在本所和海南对初选组合进行比较、制种及亲本繁殖… 相似文献
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丝瓜SRAP-PCR体系建立与优化 总被引:4,自引:0,他引:4
本文以丝瓜(Luffa cylindrica (L.) M. Roem)基因组DNA为模板,采用正交试验设计,对SRAP (sequence related amplified polymorphism, 序列相关扩增多态性)反应体系中的4种关键因素(dNTPs、Taq酶、引物、模板)进行优化,建立了适合于丝瓜基因组SRAP分子标记的扩增体系:反应总体积10μl,其中含Taq酶1.0 U、模板DNA 50.00 ng、dNTPs 0.3mmol/L、引物0.30μmol/L。该体系能很好地满足丝瓜基因组SRAP标记的要求,可应用于丝瓜的分子生物学研究。 相似文献
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根肿菌侵染油菜抗感病品种早期防御酶活性及转录组分析 总被引:2,自引:0,他引:2
为探究抗病和感病2种油菜品种抗病机理及基因表达差异,通过水培法观测油菜抗病品种6M80和感病品种中双11号接种根肿菌后的根毛侵染,利用紫外分光光度法和RNA-Seq技术分别测定根部防御酶的活性及所有的转录序列。结果表明,接菌后3~15 d油菜品种6M80的根毛侵染率显著低于油菜品种中双11号,其根内过氧化氢酶(catalase,CAT)、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)、过氧化物酶(peroxidase,POD)活性在接菌后第12天达到峰值,且显著高于油菜品种中双11号,分别为382.50、2 044.44和3 342.22 U·g~(-1)·min~(-1)。与未接菌相比,油菜抗病品种6M80和感病品种中双11号接菌后第3、6、9、12天共分别存在6 607个和2 499个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。功能注释结果表明,大多数DEGs参与信号传导、生物代谢、转录过程及防御机制。油菜品种6M80和中双11号中分别存在82个和53个防御酶相关的DEGs。研究表明,根肿菌侵染油菜抗病品种早期防御酶活性较高,其相关差异表达基因参与木质素生物合成和过氧化氢代谢,并在抗根肿病过程中发挥着重要作用。 相似文献
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以丝瓜基因组DNA为模板,采用正交试验设计,对SRAP(sequence related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)反应体系中的4种关键因素(dNTPs、Taq酶、引物、模板)进行优化,建立了适合于丝瓜基因组SRAP分子标记的扩增体系:反应总体积10μ1,其中含Taq酶1.O u、模板DNA50.00ng、dNTPs 0.3 mmol/L、引物0.30μtmol/L.该体系能很好地满足丝瓜基因组SRAP标记的要求,可应用于丝瓜的分子生物学研究. 相似文献
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我国西南地区蔬菜系统氮肥用量大、产量水平不高,优化氮肥管理和筛选适宜的蔬菜品种对西南地区蔬菜提质增产具有重要的意义。但是目前基于优化氮管理策略对该地区不同蔬菜类型的影响尚不清楚,因此,以西南地区典型的6个大白菜品种为研究对象,设置不施氮和优化施氮两个氮水平,明确优化氮管理对不同大白菜产量、氮肥利用率、品质的影响,并比较不同品种间的差异,以期筛选出适宜西南地区种植的高产优质大白菜品种,为西南地区乃至全国大白菜种植提供参考。结果表明,与不施氮肥处理相比,优化施氮条件下,大白菜总产量提高了130%~289%,显著提高了植株养分吸收,同时维生素C含量提高了5.0%~38.3%,类黄酮含量降低了4.5%~275.0%,显著提高了大白菜营养质量指数。优化氮肥管理条件下,不同大白菜品种对氮肥的响应程度不同,山东四号和丰抗70大白菜品种对氮肥响应程度最大,属于氮素高效型品种,其产量、氮肥利用率、氮素累积量、磷素累积量和维生素C含量均分别显著高于其他品种4.0%~42.0%、44%~225%、10.6%~61.4%、12.9%~52.6%和1.2%~8.3%,且对中微量营养元素也有较好地吸收,其中丰抗7... 相似文献
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