基于高通量测序技术挖掘分子遗传标记及其在蛋鸡生产中的精准应用

高通量测序技术是研究物种复杂生物性状遗传机制的基础,随着高通量测序技术的不断优化提升,一些与生物表型性状密切相关的基因组变异被精准地挖掘出来,其中包括单核苷酸多态位点(SNP)、小片段的插入或缺失(Indel)、拷贝数变异(CNV)以及结构变异(SV)为代表的分子标记。与传统遗传标记相比较,分子遗传标记具有多态性高、遍布整个基因组、检测手段简单快捷以及成本低廉的特点。通过检测覆盖全基因组范围内的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体或群体遗传资源进行评估,能够缩短世代间隔、提高选种的准确性,进而在短期内取得较大的遗传进展。作者从高通量测序技术挖掘分子遗传标记角度入手,综述了三代测序技术发展历程和应用领域以及三代分子遗传标记检测技术在蛋鸡种业创新中的应用,并详细阐述了高通量测序技术与分子遗传标记相结合在蛋鸡群体遗传多样性及进化分类、群体遗传图谱的构建和功能基因定位、数量性状形成的遗传机制解析和质量性状形成的遗传机制解析等4个方面的精准应用,以期为蛋鸡基因组选择进入实质应用阶段提供科学依据和指导。     

蓖麻籽化学成分研究及杀螨活性部位筛选

动物螨病是由肉食性螨寄生于动物体表或表皮内所引起的一种以皮肤剧烈瘙痒、渗出性炎症和高度接触性传播为特征的体外寄生虫病,直接影响着畜牧养殖业的发展。目前,常用有机磷、有机氮和有机氯类农药对螨病进行防治。长期使用此类药物,导致了     

冬春季节鸡呼吸道综合征的防治

冬春季节气温较低,是鸡呼吸道病的高发季节。鸡呼吸道综合征一般是由支原体、大肠杆菌、新城疫病毒、冠状病毒、传染性支气管炎病毒、传染性喉气管炎病毒、鸡嗜血杆菌和流感病毒中的2种或多种细菌或病毒引发鸡呼吸道疾病的总称。     

消费者安全农产品消费意愿与消费行为的一致性研究——以吉林省为例

消费者安全农产品购买意愿和支付行为的一致性对保障农产品质量安全具有重要的逆向促进作用。本文以吉林省城镇消费者的问卷调查数据为基础,实证分析了消费者安全农产品认知和消费情况,并用Logistic回归模型识别了影响区域消费者安全农产品购买意愿和购买行为一致性的因素。结果显示,尽管81.27%的受访者表示愿意购买安全农产品,但受溢价约束购买意愿和动机鲜少转化为购买行为。受教育程度、家庭人口规模、家庭月收入、消费环境、消费体验对消费者安全农产品购买意愿与行为的一致性具有显著影响;消费者农产品质量安全认证知识和政府农产品质量安全监管了解程度也对安全农产品消费意愿与行为的一致性有重要影响。     

初生德本F1和蓝本F1牛的生长发育性能

试验测定了德国黄牛和比利时蓝牛对本地牛的杂交改良效果.在粗放式饲养管理条件下,德本F1和蓝本F1在体型外貌、生长速度、适应性、经济效益等方面,比当地黄牛均有显著提高.     

基于网络药理学及分子对接技术研究黄芪调控仔猪肠道菌群失调性腹泻的作用

【目的】基于网络药理学及分子对接技术研究黄芪调控仔猪肠道菌群失调性腹泻的有效活性成分及其作用机制。【方法】从TCMSP数据库搜集黄芪中药化合物成分,并获取其潜在靶点。利用GeneCards和OMIM数据库搜集肠道菌群失调性腹泻(flora imbalance diarrhea)的作用靶点,将两者预测的潜在作用靶点进行映射,获得共同作用靶点。运用STRING数据库构建靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)关系,用Cytoscape_3.8.0软件对其网络进行拓扑分析,用DAVID数据库对共同作用靶点进行富集分析,用AutoDuck_4.2.6软件对其核心成分与核心靶点进行分子对接。【结果】黄芪含有11个调控仔猪肠道菌群失调性腹泻核心成分,其对应靶点基因65个,疾病靶点854个,交集靶点25个。PPI网络中显示肿瘤坏死因子(TNF)、转录因子AP-1(JUN)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、白细胞介素-6(IL6)、NF-κB抑制剂α(NFKBIA)、IL1B、IL10、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、C-C基序趋化因子2(CCL2)为关键靶点。GO功能和KEGG通路富集分析发现,黄芪有效成分主要通过美国锥虫病、炎症性肠病、阿米巴病、细胞因子-细胞因子受体相互作用、A型流感、疟疾、T细胞受体信号通路、沙门菌感染等信号通路参与转录调控、免疫反应、细胞对脂多糖的反应等生物过程。分子对接结果显示,槲皮素、山奈酚、芒柄花素等核心成分与TNF、IL1B等关键靶点结合紧密,亲和力较好。【结论】黄芪可能通过槲皮素、山奈酚、芒柄花素等主要活性成分作用于TNF、IL1B等靶点,通过参与美国锥虫病、炎症性肠病、疟疾、T细胞受体信号通路、沙门菌感染等信号通路进而治疗仔猪肠道菌群失调性腹泻。     

基于畦田双侧灌水条件下灌水参数优化研究

为减少畦灌灌水时长、设计合理的畦田规格、提高灌溉效率,采用田间畦块双侧灌水试验和WinSRFR5.1模型分析相结合的方法,模拟双侧地面灌溉的水流过程和灌水质量情况。以水流汇集处为界,将畦块双侧灌水试验分为两次坡度不同灌水试验,与WinSRFR5.1模型结合进行土壤入渗参数（入渗系数K和入渗指数α）率定和模拟灌水质量（灌水效率和灌水均匀度）等值线图,再对模拟结果进行对比分析。结果表明：畦块双侧灌水是可行的,相对于畦宽,畦长对灌水效率和灌水均匀度的影响更大。结合天津市武清区畦田现状,得到双侧灌水畦田的畦长、畦宽范围,即：单宽流量为2.96 L/（s·m）、畦宽为2.0～11.5 m、畦长为49～165 m,此时灌水效率和灌水均匀度均达到90%以上。     

北京市蒲洼自然保护区野果资源的保护及开发利用

2004年4-9月,采用线路调查、抽样调查、标本采集等方法,对北京市蒲洼自然保护区的植被和物种进行了不同季节的调查,以期对现存野果资源进行评价,指导开发利用。调查结果：极危种1种、濒危种2种、近危种4种、安全种18种。对濒危系数EI〉0．5的物种,严禁开发利用,对EI〈0．5的一些安全种和使用价值较大的物种提倡重点开发。     

全基因组重测序在鸡中的应用和研究进展

高通量测序技术的出现不仅推动了生命科学的发展进程,为许多生命机制的解析提供了技术支撑,也为基因组学研究中曾经未解的一些难题带来了新的解决方法.随着基因组研究水平的不断深入,越来越多家养动物的基因组信息被逐渐公布,极大地推动了家养动物重要性状在全基因水平上的研究进程.自鸡的基因组序列信息公布以来,重测序技术被大量运用于基...     

FSH受体基因单核苷酸多态性与卵巢功能

\t\t\t\t\t目的\t\t\t\t\t揭示无量山乌骨鸡FSHR基因的结构与功能。\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t方法\t\t\t\t\t采用RT-PCR法克隆了无量山乌骨鸡FSHR基因的编码区全序列,并利用生物信息学方法对无量山乌骨鸡FSHR基因编码产物的理化特性、结构及功能进行了初步分析,最后采用实时荧光定量分析其组织表达情况。\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t结果\t\t\t\t\t本研究获得的无量山乌骨鸡FSHR基因编码区全长为2 082 bp,编码693个氨基酸。生物信息学预测显示：无量山乌骨鸡FSHR无N-端信号肽。该蛋白含有3个保守结构域、7个跨膜区和6种功能活性位点。无量山乌骨鸡FSHR二级结构主要由无规则卷曲和α螺旋构成,分别占35.50%和31.17%。氨基酸序列比对显示：无量山乌骨鸡FSHR与其他禽类的同源性在87.4%以上。荧光定量结果显示：该基因在性腺组织中表达量最高,说明该基因与生产性能、繁殖性能等有关系。\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t结论\t\t\t\t\tFSHR属于G蛋白偶联受体家族,可介导促卵泡作用的发生,可能在转运和结合、信号转导、修饰加工等过程中发挥重要作用。\t\t\t\t