甘南牦牛H-FABP基因CDS区多态性及生物信息学分析

应用PCR产物混合样本DNA池法检测甘南牦牛心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因CDS区多态性,并应用生物信息学方法分析甘南牦牛H-FABP蛋白质特性.结果表明:甘南牦牛H-FABP基因CDS区序列与九龙牦牛相同,而与普通牛对比在第3外显子存在*76G>A的同义突变;甘南牦牛H-FABP氨基酸序列没有明显的疏水性区域,也未形成跨膜螺旋区及信号肽,推测其主要在细胞质中发挥生物学作用;甘南牦牛H-FABP基因编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主的mixed型;氨基酸序列与普通牛、山羊、马、人、小鼠、大鼠、鸡、草雀及绿鸭9个物种间同源性较高,与其实际亲缘关系远近一致.     

祁连山高寒牧区优质奶羔生产效果分析

以引进品种羊‘白萨福克’、‘邦德’、‘特克塞尔’和澳洲‘美利奴’为父本,‘甘肃高山细毛羊’为母本,开展杂交组合筛选试验,形成4种杂交组合(分别简称白萨甘细、邦甘细、特甘细和澳甘细),’甘肃高山细毛羊‘为对照组(简称甘高细).在2008～2011年,通过连续4年系统观测853只杂种羔羊和174只甘高细的生长结果、屠宰性能、肉品质和内脏器官指标.结果表明:特甘细的断奶体质量为28.27kg,比邦甘细、白萨甘细、澳甘细和甘高细分别高出2.46、3.29、5.76、4.66kg;特甘细的眼肌面积及GR值均显著高于其他杂交组合(P<0.05),分别比甘高细提高16.49cm2和2.07mm;特甘细、白萨甘细和邦甘细的热胴体质量分别比甘高细提高37.44%、11.70%和21.87%;特甘细的全胃质量和小肠长度均显著高于其他3个组合(P<0.05).表明在祁连山高寒牧区放牧条件下,特克塞尔×甘肃高山细毛羊是生产奶羔的最优杂交组合,特克塞尔是生产奶羔的最优父本.     

甘肃高山细毛羊微卫星遗传多样性及亲子鉴定研究

利用多重PCR和DNA测序技术对116只甘肃高山细毛羊(Ovis aries)13个微卫星座位的多态性进行检测,并结合父母本记录,开展亲子鉴定研究,以期为绵羊种质资源评价和亲子鉴定研究提供合理有效的微卫星座位.结果表明,甘肃高山细毛羊13个微卫星座位共检测到111个等位基因,在DRB 1-INTRO2座位检测到的等位基因数最多(14个),SRCRCP5座位最少(5个).ILSTS011座位观察杂合度最高(0.888),MAF214座位最低(0.500),除MAF214座位为中度多态外,其余12个座位均为高度多态,13个微卫星座位平均观察杂合度(Ho)为0.743,期望杂合度(He)为0.727,平均多态信息含量(PIC)为0.689.表明甘肃高山细毛羊遗传多样性较丰富.通过Cervus 2.0计算,13个微卫星座位累计父权排除概率(CPE)达到了0.999 94,11个具有高度多态的座位(除MAF214和OARJMP29外)CPE达到0.999 85,12个座位达到0.999 91,其中MAF214座位(中度多态)对CPE的影响较小,DRB1-INTRO2座位(高度多态)对CPE的影响较大,对亲子鉴定的贡献较大.本研究所分析的13个微卫星座位能够有效的提高亲子鉴定要求的精确度,可使实验操作更简便,成本降低,更适用于生产实际.     

五个绵羊群体KAP11-1基因核苷酸序列变异分析

为了分析绵羊KAP11-1基因的核苷酸序列变异,采用PCR-SSCP方法和DNA测序技术检测了欧拉羊、甘肃高山细毛羊、滩羊、湖羊和青海细毛羊5个群体(749只个体)KAP11-1基因的单核苷酸多态性,同时分析了等位基因频率、遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量等群体遗传特征。结果表明,5个绵羊群体的KAP11-1基因中共检测到c.93C/T、c.240G/A、c.285C/G/A和c.331A/G 4个单核苷酸多态位点,且c.331A/G为非同义突变。等位基因A在5个群体中出现的频率最高(87.70%),为优势等位基因,其次为等位基因B(基因频率为11.03%),等位基因C和D的频率最低(分别为0.53%和0.74%)。群体遗传学分析结果表明,滩羊KAP11-1基因的遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量均高于其余4个群体。KAP11-1基因作为羊毛经济性状的主要候选基因之一,其核苷酸序列的变异导致KAP11-1中相应氨基酸的改变,最终可能会影响羊毛纤维的结构和羊毛主要经济性状。     

高寒牧区羔羊育肥效果分析

为了探讨高寒牧区羔羊的最优育肥模式,以澳洲美利奴×甘肃高山细毛羊杂种一代羔羊、邦德×甘肃高山细毛羊杂种一代羔羊、特克塞尔×甘肃高山细毛羊杂种一代羔羊(分别简称澳甘细、邦甘细、特甘细)和甘肃高山细毛羊纯繁羔羊(简称甘高细)作为试验对象,采用全舍饲和"放牧+补饲"2种方式进行育肥试验,观测其生长(育肥期增重、平均日增重)和屠宰(胴体重、屠宰率)性能。结果表明:不同育肥方式对羔羊的生产性能无明显影响(P>0.05),全舍饲和"放牧+补饲"下,羔羊的育肥期增重分别是9.95 kg和9.83 kg,平均日增重分别是165.88 g和163.79 g,胴体重分别是14.41 kg和14.38 kg,屠宰率分别是47.61%和47.26%。经济效益分析表明"放牧+补饲"育肥羔羊的平均效益较全舍饲高35元/只;3个杂种羔羊群体的育肥效果都好于甘高细,其中特甘细的生长和屠宰性能最好。全舍饲育肥下,特甘细的胴体重分别比澳甘细、邦甘细高2.83和2.3 kg(P<0.01);"放牧+补饲"育肥下,分别比这2个群体高0.79和0.28 kg。由此说明,"放牧+补饲"是高寒牧区羔羊育肥的最优技术,特克塞尔×甘肃高山细毛羊杂种一代羔羊是羔羊育肥的最优群体。     

牦牛瘦素受体基因(LEPR)多态性分析

瘦素受体(LEPR)是瘦素(leptin)发挥作用的重要中介物.LEPR基因突变与人的肥胖,以及普通牛、猪等动物的脂肪沉积相关.本研究根据GenBank中普通牛(Bos tauras)LEPR基因序列设计3对引物,采用PCR-SSCP方法检测天祝白牦牛、甘南牦牛和青海牦牛(Bos grunniens)LEPR基因第4、5及8外显子及其相邻区域多态性.结果表明,牦牛LEPR基因第4外显子和第8外显子及其相邻区域分别存在多态性.对应普通牛LEPR基因序列,3类群牦牛该基因第4外显子及相邻区域检测到5处单碱基突变并形成2种等位基因A和B,第4外显子存在2处错义突变;该区域A为优势等位基因,PIC＜0.25为低度多态.3类群牦牛LEPR基因第8外显子及其相邻区域发现5处SNPs,其中第8外显子存在3处错义突变;等位基因在牦牛群体间分布不均衡,除天祝白牦牛发现6种等位基因A-F外,其余两类群牦牛仅发现3种等位基因A-C;3类群牦牛中A均为优势等位基因,该位点PIC>O.25,为中、高度多态且显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05).3类群牦牛LEPR基因第5外显子及相邻区域未发现多态性,但相对于普通牛该基因序列,在第4、5内含子区存在3处SNPs.LEPR基因第8外显子编码识别和结合相应配体的C2区,牦牛LEPR基因存在较丰富的多态性,可作为其调控性状的潜在分子标记位点.     

中国绒山羊选育探讨

山羊绒是指从山羊毛被中获得的由皮肤次级毛囊产生的纤细毛纤维。山羊绒在国际市场上的通用商品名称为开士米 (ｃａｓｈｍｅｒｅ) ,是一种传统而名贵、高级的纺织原料 ,其织品为高档商品 ,价格昂贵。国际市场上的山羊绒价格一般较高 ,但中国山羊绒的市场价格变化较大。 90年代初 ,曾达到 4 0 0元 /ｋｇ;之后 ,又降低到1 0 0元左右 /ｋｇ的水平 ;2 0 0 0年 6月份 ,国内羊绒市场价格竟高达 5 0 0～ 5 5 0元 /ｋｇ ,创下中国羊绒价格的最高纪录。伴随着羊绒价格的上涨 ,国内最近又出现了绒山羊引种、杂交和品种 (品系 )选育的热潮。为防止曾出…     

甘肃马鹿乳营养成分分析

分析测定了12头甘肃马鹿10～35d泌乳期内乳样的pH值、常规营养成分及矿物元素含量。结果表明,马鹿乳富含营养物质,其干物质、蛋白质、灰分、钙、磷等含量均很高,乳中含有18.64%干物质,8.07%蛋白质,4.73%脂肪,4.39%乳糖,1.52%灰分,0.37%钙,0.20%磷,0.12%钾,0.06%钠和0.02%镁。马鹿乳成分的测定将为人工代乳料的研制提供理论依据。     

秦川牛PLAG1基因启动子克隆及转录因子预测

【目的】探究秦川牛多形性腺瘤基因1(pleomorphic adenoma gene 1,PLAG1)的组织表达规律,并克隆其启动子区序列,预测分析其关键转录因子结合位点,为探究其转录调控机制提供理论参考。【方法】采集3头20月龄秦川牛成年公牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌、瘤胃组织,用实时荧光定量PCR方法检测PLAG1基因在不同组织中的相对表达量,同时克隆PLAG1基因上游启动子区序列,利用生物信息学软件预测PLAG1基因转录起始位点及启动子核心区域,分析、筛选核心启动子区域的关键转录因子结合位点。【结果】PLAG1基因在秦川牛各组织中均有表达,且在背最长肌中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。PLAG1基因启动子序列全长1 861 bp,生物信息学预测分析发现PLAG1基因核心启动子区位于-297―+42 bp,存在高度保守的Krüppel样因子5(KLF5)、cAMP反应元件结合蛋白1(CREB1)和早期生长反应因子1(EGR1)转录因子结合位点,且CpG岛位于PLAG1基因核心启动子区域内。【结论】PLAG1基因在肌肉组织中高表达,其核心启动子区...