MSTN-/-鲁西黄牛肌肉全转录组共表达网络及转录本富集分析

为了探究与牛骨骼肌发育相关的共表达网络及核心转录本,挖掘牛骨骼肌在发育过程中的调控转录本,试验采用新的fastp+kallisto+Sleuth分析方法对牛骨骼肌转录组测序数据进行分析,通过转录组测序分析筛选出两组肌肉样本差异表达的RNA,对其进行GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析、WGCNA分析和GSEA富集分析。结果表明：转录组测序共鉴定出32 919个转录本,按照是否满足|lbFC|≥2、P<0.05的条件共筛选出457个差异表达转录本,其中上调转录本303个,下调转录本154个。457个差异表达转录本共涉及106个GO功能注释条目和14个KEGG信号通路,差异表达转录本主要富集在与细胞周期、细胞生长密切相关的基因功能注释和信号通路中。457个差异表达转录本被划分到显著相关的3个转录本模块,棕色模块有83个转录本,蓝色模块有93个转录本,绿色模块有111个转录本,并且筛选出10个核心转录本。核心转录本多数集中在细胞黏附分子、AMPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、肌动蛋白细胞骨架的调节等与细胞周期、细胞生长密切相关的通路中。说明牛骨骼肌发育受基因转录水平调控的影...     

1982-2016年西南地区变干、变绿趋势分析

[目的]极端气候事件对世界各地的植被有着强烈的破坏性影响.西南地区是我国重要的生态资源区和生态脆弱区,在国家"绿水青山"战略发展中具有重要地位,其近年来愈发频繁的遭受到干旱的侵袭.[方法]本文利用1982-2016年卫星遥感数据GIMMS LAI3g数据和西南5省市的温度、降水观测资料,分析1982-2016年间的长期...     

牛肌肉中的蛋白质组学研究进展

蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征,它已在医学、畜牧学、食品科学以及农业等领域得到广泛的研究与应用。牛肉因其蛋白质含量高、脂肪含量少、血红素铁丰富等,深受人们的喜爱。但目前对我国而言,牛肉仍需要大量进口,因此对于如何提高牛肉品质一直是我国畜牧和食品行业科研工作者不断努力研究的一大课题。随着基因组学的深入研究发展,从蛋白质水平研究牛肌肉及其形成机制,对提高牛肉品质有着重要的意义。肌肉主要是由水、蛋白质等成分构成,其性状及品质主要是由蛋白质来表达的。因此,研究蛋白质组学在牛肌肉中的认知对于调控牛肉的品质具有重要意义。本文主要对蛋白质组学的研究技术及其在牛肌肉中的研究做简要介绍。     

UBE2L3对牛骨骼肌卫星细胞增殖分化的影响

将分离的牛骨骼肌卫星细胞(BSMSCs)进行体外培养,首先检测泛素结合酶UBE2L3在BSMSCs增殖分化过程中mRNA以及蛋白表达水平的变化.设计UBE2L3的3个干扰RNA(si-UBE2 L3-1、si-UBE2L3-2、si-UBE2L3-3),对干扰效果进行筛选.构建UBE2L3过表达质粒载体pcDNA3.1...     

牛LncRNA-133a对骨骼肌卫星细胞增殖分化的影响

【目的】 探讨长链非编码RNA LncRNA-133a对牛骨骼肌卫星细胞增殖分化过程的影响。【方法】 利用测序样品3、6、9月龄胎牛及24月龄成年和牛骨骼肌肌肉组织,qRT-PCR法检测LncRNA-133a的组织时序表达谱。构建牛骨骼肌卫星细胞的体外成肌诱导分化模型,模拟牛骨骼肌的生长发育过程,qRT-PCR法检测LncRNA-133a和肌细胞分化标记因子MyoG、MHC的细胞时序表达谱。利用过表达LncRNA-133载体（pCDNA3.1-EGFP-LncRNA-133a） 或LncRNA-133a抑制物（si-LncRNA 133a） 转染牛骨骼肌卫星细胞,qRT-PCR法检测转染效率以及各转染处理组LncRNA-133a、MyoD、MyoG及MHC基因mRNA的表达水平,Western blotting检测MHC 基因的蛋白表达水平;同时,通过EdU细胞增殖检测、免疫荧光蛋白染色技术检测牛骨骼肌卫星细胞增殖阶段的细胞增殖量和分化阶段的肌管融合程度。【结果】 组织表达谱分析发现LncRNA-133a在3月龄胎牛肌肉组织中表达量最高,6月龄胎牛肌肉组织中次之,9月龄胎牛及成年牛肌肉组织中表达量最低,时序表达呈下降趋势;利用成功构建的牛骨骼肌卫星细胞体外诱导分化模型,进行LncRNA-133a、MyoG、MHC的细胞时序表达谱分析,结果发现在牛骨骼肌卫星细胞分化过程中（D0-D3）,肌分化标记因子MyoG、MHC的表达水平逐渐升高,LncRNA-133a的表达在分化阶段呈上升趋势,且分化48 h时（D2）表达量最高;成功构建的过表达LncRNA-133a或抑制LncRNA-133a的牛骨骼肌卫星细胞模型,在增殖期（D0）：与对照组相比,过表达LncRNA-133a处理组EdU增殖染色检测得到EdU阳性细胞数显著增加（P<0.01）,而LncRNA-133a抑制处理组EdU阳性细胞数显著减少（P<0.01）;在分化48 h时（D2）：与对照组相比,LncRNA-133a过表达处理组肌细胞分化标记因子MyoD、MyoG及MHC的mRNA表达水平显著升高（P<0.05）,Western blotting检测MHC蛋白表达量显著增加（P<0.01）,且MHC蛋白的免疫荧光蛋白染色检测观察到融合肌管的体积占比更大;而LncRNA-133a抑制处理组MyoD、MyoG及MHC的mRNA表达水平均降低,其中MyoG显著降低（P<0.05）, MHC蛋白表达量显著减少（P<0.01）,同时MHC蛋白融合肌管的体积占比也降低。【结论】 研究证实LncRNA-133a具有促进牛骨骼肌卫星细胞增殖及分化的作用,为进一步挖掘LncRNA-133a调节牛骨骼肌卫星细胞增殖分化调控网络机制奠定了基础。     

葛根芩连汤对感染大肠杆菌小鼠血常规、血液内毒素及炎性细胞因子含量的影响

旨在研究葛根芩连汤预防及治疗感染大肠杆菌K_(88)小鼠的血常规、血液内毒素及炎性细胞因子含量的影响。统计小鼠的死亡率,血常规检测小鼠血液中白细胞、红细胞及血小板的变化,以及采用显色基质鲎试剂法和ELISA方法检测感染小鼠血液里内毒素及炎性因子TNF-α、IL-1β、IL-6的含量变化。结果显示,预防试验中葛根芩连汤组小鼠死亡率为20%,治疗试验中葛根芩连汤组死亡率为30%,均极显著地低于模型组(P0.01),且与氟苯尼考组相比没有差异;葛根芩连汤组小鼠血液中白细胞指标均极显著地低于模型组(P0.01),红细胞及血小板指标均极显著地高于模型组(P0.01);葛根芩连汤组小鼠白细胞、中性粒细胞及血小板数目极显著的高于氟苯尼考组(P0.01),葛根芩连汤组小鼠内毒素及TNF-α、IL-1β、IL-6的含量均极显著地低于模型组(P0.01)。结果表明:葛根芩连汤对感染大肠杆菌K_(88)小鼠具有预防与治疗作用,而且在抑制早期炎性因子的释放,降低机体炎症反应水平方面优于氟苯尼考。     

烟酰胺对牛骨骼肌卫星细胞增殖与分化的影响

为了探究烟酰胺(NAM)对牛骨骼肌卫星细胞(BSMSCs)增殖与分化的影响,试验以体外培养的BSMSCs成肌分化模型为研究对象,用0,1,2,4,8 mmol/L烟酰胺处理BSMSCs(对照组及1,2,4,8 mmol/L烟酰胺组),采用CCK-8法筛选烟酰胺对BSMSCs作用的最适浓度,后续试验均以不添加烟酰胺作为对照组,最适浓度作为试验组,采用EdU试剂盒检测最适浓度烟酰胺对BSMSCs增殖的影响;光学显微镜下观察最适浓度烟酰胺处理的BSMSCs分化24,48,72小时时的肌管形态,采用Western-blot检测BSMSCs中肌球重链蛋白(MyHC)和肌原蛋白(MyOG)的表达水平,分析烟酰胺对BSMSCs分化的影响。结果表明：与对照组比较,BSMSCs的OD₄₅₀值随着烟酰胺浓度的上升而下降,4 mmol/L烟酰胺组OD₄₅₀值显著降低(P<0.05),8 mmol/L烟酰胺组OD₄₅₀值极显著降低(P<0.01),但8 mmol/L烟酰胺组的细胞存活率低于50%,超过药物对细胞的半数致死浓度,最终以...     

3个时期牛肌肉组织中长链非编码RNA表达谱的生物信息学分析

试验旨在分析不同时期牛肌肉组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)的表达谱,并筛选出可能参与肌肉发育过程的相关的lncRNAs。采集3月龄胚胎、6月龄胚胎和9月龄出生个体的肌肉组织RNA样品进行高通量测序,通过生物信息学方法对鉴定到的lncRNAs进行分析筛选,对lncRNAs靶基因和3个时期差异mRNAs进行Veen分析,并对Veen结果进行GO和KEGG富集分析,筛选与肌肉发育相关的lncRNAs及靶标mRNA。结果显示,高通量测序共鉴定到212 851条新的未注释的lncRNAs,其中在不同时期差异表达的有9 913条,分属于基因间型、正义链型、反义链型和双向型4种类型,在各染色体上均有分布,其中正义链型lncRNAs在各个染色体上分布数量最多,分布范围最广。分析其结构发现这些lncRNAs具有开放阅读框短、表达水平低、编码能力弱、分布广、数量大等特征。通过GO和KEGG富集分析,最终筛选出3月龄胚胎、6月龄胚胎和9月龄出生个体肌肉中差异表达并与肌生成有密切关系的55条lncRNAs和38条候选靶标mRNA。本研究不仅提供了3个时期牛肌肉组织中lncRNAs的表达模式,而且通过预测lncRNAs与mRNA的相互作用关系极大地缩小了与牛肌肉发育相关的lncRNAs的研究范围,为揭示牛肌肉发育的功能提供了重要的靶点。     

乌头驴及杂交一代幼驹生产性能分析

实验旨在对乌头驴及杂交一代幼驹生产性能进行分析,以期提高肉驴的生产性能及经济效益,满足人们对驴产品日益增长的需求。本实验建立了2个以乌头种公驴为父本,三粉母驴和关中母驴为母本的杂交组合以及1个以乌头母驴为母本的纯繁组合,并且对所产子一代的公、母驴驹在初生时及6月龄时的生产性能进行了测定和比较分析。结果表明,乌头驴♂×三粉驴♀、乌头驴♂×关中驴♀、乌头驴♂×乌头驴♀所产子一代幼驹初生时各体尺指标均无显著性差异;乌头驴♂×三粉驴♀杂交的子一代公驴驹6月龄体重、胸围显著高于乌头驴♂×关中驴♀及乌头驴♂×乌头驴♀子一代公驴驹。此外,乌头驴♂×三粉驴♀杂交的子一代母驴驹6月龄时的体重、体长、体高、胸围指标均显著高于乌头驴♂×关中驴♀和乌头驴♂×乌头驴♀后代母驴驹。综上所述,乌头驴♂×三粉驴♀杂交所产子一代幼驹具有较佳的生产性能,该研究结果为提高肉驴配套生产及提升驴产业规模化发展奠定了科学基础。